MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Caldivirga maquilingensis IC-167 chromosome

Total Repeats: 43015

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009954	CAG	2	6	47681	47686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159040624
1002	NC_009954	TAC	2	6	47749	47754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040624
1003	NC_009954	TAT	2	6	47763	47768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159040624
1004	NC_009954	CAA	2	6	47780	47785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_009954	TAA	2	6	47801	47806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_009954	ATT	2	6	47807	47812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_009954	ATA	2	6	47822	47827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_009954	TA	3	6	47845	47850	50 %	50 %	0 %	0 %	159040625
1009	NC_009954	CAA	2	6	47858	47863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159040625
1010	NC_009954	CAT	2	6	47889	47894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040625
1011	NC_009954	ATT	2	6	47899	47904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159040625
1012	NC_009954	CAA	2	6	47914	47919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159040625
1013	NC_009954	ATA	2	6	47935	47940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159040625
1014	NC_009954	TA	3	6	48056	48061	50 %	50 %	0 %	0 %	159040625
1015	NC_009954	AAT	2	6	48070	48075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159040625
1016	NC_009954	TGA	2	6	48282	48287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040625
1017	NC_009954	AGCCTT	2	12	48441	48452	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	159040625
1018	NC_009954	GTG	2	6	48475	48480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159040625
1019	NC_009954	TCA	2	6	48523	48528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040625
1020	NC_009954	GGC	2	6	48685	48690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159040625
1021	NC_009954	GGCA	2	8	48693	48700	25 %	0 %	50 %	25 %	159040625
1022	NC_009954	CTTA	2	8	48714	48721	25 %	50 %	0 %	25 %	159040625
1023	NC_009954	ACT	3	9	48884	48892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040625
1024	NC_009954	GGC	2	6	48978	48983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159040625
1025	NC_009954	TGC	2	6	48989	48994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159040625
1026	NC_009954	AAG	2	6	49009	49014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159040625
1027	NC_009954	GATT	2	8	49083	49090	25 %	50 %	25 %	0 %	159040625
1028	NC_009954	GAG	2	6	49117	49122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159040625
1029	NC_009954	ACC	2	6	49225	49230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159040625
1030	NC_009954	CTA	2	6	49245	49250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040625
1031	NC_009954	TGG	2	6	49279	49284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159040625
1032	NC_009954	CAT	2	6	49379	49384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040625
1033	NC_009954	TCAAC	2	10	49418	49427	40 %	20 %	0 %	40 %	159040625
1034	NC_009954	TTC	2	6	49462	49467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159040625
1035	NC_009954	ATG	2	6	49469	49474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040625
1036	NC_009954	AGC	2	6	49557	49562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159040625
1037	NC_009954	TAA	2	6	49682	49687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159040625
1038	NC_009954	GTA	2	6	49720	49725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040625
1039	NC_009954	CCA	2	6	49726	49731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159040625
1040	NC_009954	TG	3	6	49828	49833	0 %	50 %	50 %	0 %	159040625
1041	NC_009954	ACT	2	6	49867	49872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040625
1042	NC_009954	CAA	2	6	49880	49885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159040625
1043	NC_009954	CAA	2	6	49898	49903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159040625
1044	NC_009954	CTA	2	6	49904	49909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040625
1045	NC_009954	CAA	2	6	49913	49918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159040625
1046	NC_009954	ACT	2	6	49927	49932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040625
1047	NC_009954	TAC	3	9	49941	49949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040625
1048	NC_009954	ACT	2	6	49960	49965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040625
1049	NC_009954	ACT	2	6	49969	49974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040625
1050	NC_009954	ACT	2	6	49987	49992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040625
1051	NC_009954	CTG	2	6	50027	50032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159040625
1052	NC_009954	CAGTAA	2	12	50075	50086	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	159040625
1053	NC_009954	AGT	2	6	50094	50099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040625
1054	NC_009954	AAT	2	6	50121	50126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159040625
1055	NC_009954	TAT	2	6	50127	50132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159040625
1056	NC_009954	AGC	2	6	50145	50150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159040625
1057	NC_009954	AGC	2	6	50154	50159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159040625
1058	NC_009954	AAT	2	6	50160	50165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159040625
1059	NC_009954	AAG	3	9	50172	50180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159040625
1060	NC_009954	AAG	2	6	50183	50188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159040625
1061	NC_009954	A	6	6	50222	50227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_009954	TCA	2	6	50238	50243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_009954	TAT	2	6	50290	50295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159040626
1064	NC_009954	AGT	2	6	50311	50316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040626
1065	NC_009954	T	6	6	50330	50335	0 %	100 %	0 %	0 %	159040626
1066	NC_009954	TTC	2	6	50338	50343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159040626
1067	NC_009954	GTA	2	6	50382	50387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040626
1068	NC_009954	TGCA	2	8	50403	50410	25 %	25 %	25 %	25 %	159040626
1069	NC_009954	CTG	2	6	50412	50417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159040626
1070	NC_009954	TAG	2	6	50431	50436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040626
1071	NC_009954	TCA	2	6	50516	50521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040626
1072	NC_009954	GCTG	2	8	50533	50540	0 %	25 %	50 %	25 %	159040626
1073	NC_009954	T	6	6	50635	50640	0 %	100 %	0 %	0 %	159040626
1074	NC_009954	TAA	2	6	50644	50649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159040626
1075	NC_009954	CTT	2	6	50660	50665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159040626
1076	NC_009954	AT	4	8	50731	50738	50 %	50 %	0 %	0 %	159040626
1077	NC_009954	AT	3	6	50858	50863	50 %	50 %	0 %	0 %	159040626
1078	NC_009954	AAT	2	6	50890	50895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159040626
1079	NC_009954	CCT	2	6	50896	50901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159040626
1080	NC_009954	AAT	2	6	50931	50936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159040626
1081	NC_009954	CCA	2	6	50954	50959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159040626
1082	NC_009954	TTG	2	6	50970	50975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159040626
1083	NC_009954	ATTA	2	8	51007	51014	50 %	50 %	0 %	0 %	159040626
1084	NC_009954	TTA	2	6	51030	51035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159040626
1085	NC_009954	GAA	2	6	51167	51172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_009954	AGG	2	6	51367	51372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159040627
1087	NC_009954	TAGG	2	8	51413	51420	25 %	25 %	50 %	0 %	159040627
1088	NC_009954	TGA	2	6	51486	51491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040627
1089	NC_009954	TTA	2	6	51506	51511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159040627
1090	NC_009954	TCA	2	6	51555	51560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040627
1091	NC_009954	ATT	2	6	51593	51598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_009954	CTC	2	6	51630	51635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159040628
1093	NC_009954	CTC	2	6	51639	51644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159040628
1094	NC_009954	GGT	2	6	51695	51700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159040628
1095	NC_009954	TAT	2	6	51788	51793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159040628
1096	NC_009954	TTG	2	6	51857	51862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159040628
1097	NC_009954	AGG	2	6	51889	51894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159040628
1098	NC_009954	GT	3	6	51897	51902	0 %	50 %	50 %	0 %	159040628
1099	NC_009954	CTC	2	6	51996	52001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159040628
1100	NC_009954	AC	3	6	52046	52051	50 %	0 %	0 %	50 %	159040628
1101	NC_009954	TAG	2	6	52079	52084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040628
1102	NC_009954	ATT	2	6	52107	52112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_009954	CTT	3	9	52116	52124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_009954	AAC	2	6	52201	52206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159040629
1105	NC_009954	TGA	2	6	52273	52278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040629
1106	NC_009954	ATC	2	6	52288	52293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040629
1107	NC_009954	CCT	2	6	52315	52320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159040629
1108	NC_009954	CTC	2	6	52371	52376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159040629
1109	NC_009954	TTA	2	6	52412	52417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159040629
1110	NC_009954	CAA	2	6	52452	52457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159040629
1111	NC_009954	TTA	2	6	52467	52472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159040629
1112	NC_009954	TAT	2	6	52537	52542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159040629
1113	NC_009954	CCTA	2	8	52666	52673	25 %	25 %	0 %	50 %	159040629
1114	NC_009954	ACCA	2	8	52750	52757	50 %	0 %	0 %	50 %	159040629
1115	NC_009954	CTG	2	6	52815	52820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159040629
1116	NC_009954	AACT	2	8	52843	52850	50 %	25 %	0 %	25 %	159040629
1117	NC_009954	TAC	2	6	52975	52980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040629
1118	NC_009954	CCA	2	6	52995	53000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159040629
1119	NC_009954	CAG	2	6	53007	53012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159040629
1120	NC_009954	TGA	2	6	53029	53034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040629
1121	NC_009954	TTA	2	6	53042	53047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159040629
1122	NC_009954	TTAA	2	8	53139	53146	50 %	50 %	0 %	0 %	159040630
1123	NC_009954	TAAT	2	8	53161	53168	50 %	50 %	0 %	0 %	159040630
1124	NC_009954	ATC	2	6	53381	53386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040630
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1126	NC_009954	AATG	2	8	53423	53430	50 %	25 %	25 %	0 %	159040630
1127	NC_009954	ATG	2	6	53448	53453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040630
1128	NC_009954	TGA	2	6	53456	53461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040630
1129	NC_009954	CAT	2	6	53497	53502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040630
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1131	NC_009954	CAT	2	6	53617	53622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040630
1132	NC_009954	CCT	2	6	53635	53640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159040630
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1146	NC_009954	C	6	6	54334	54339	0 %	0 %	0 %	100 %	159040630
1147	NC_009954	TTA	2	6	54349	54354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159040630
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1150	NC_009954	TTAA	2	8	54645	54652	50 %	50 %	0 %	0 %	159040631
1151	NC_009954	GTA	2	6	54829	54834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040631
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1155	NC_009954	CCTCAT	2	12	55040	55051	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	159040632
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1159	NC_009954	AGT	2	6	55255	55260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159040632
1160	NC_009954	CAT	2	6	55313	55318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159040632
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1165	NC_009954	CTT	2	6	55614	55619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159040632
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1167	NC_009954	AATCC	2	10	55638	55647	40 %	20 %	0 %	40 %	159040632
1168	NC_009954	CTC	3	9	55669	55677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159040632
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1173	NC_009954	CA	3	6	56018	56023	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1174	NC_009954	GAGG	2	8	56139	56146	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1175	NC_009954	GTTAA	2	10	56166	56175	40 %	40 %	20 %	0 %	159040633
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1178	NC_009954	TA	3	6	56214	56219	50 %	50 %	0 %	0 %	159040633
1179	NC_009954	AACC	2	8	56268	56275	50 %	0 %	0 %	50 %	159040633
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1184	NC_009954	TTA	2	6	56379	56384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159040633
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1196	NC_009954	TAGCT	2	10	56938	56947	20 %	40 %	20 %	20 %	159040633
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1212	NC_009954	ATA	2	6	57494	57499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1237	NC_009954	ATA	2	6	58684	58689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1238	NC_009954	CAA	2	6	58742	58747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159040635
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1240	NC_009954	GAG	2	6	58894	58899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159040635
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1249	NC_009954	TTAAC	2	10	59153	59162	40 %	40 %	0 %	20 %	159040635
1250	NC_009954	TAT	2	6	59192	59197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159040635
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