MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii Dugway 5J108-111 chromosome

Total Repeats: 47475

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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45502	NC_009727	CAT	2	6	2069653	2069658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45503	NC_009727	A	6	6	2069678	2069683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45504	NC_009727	CG	3	6	2069699	2069704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45505	NC_009727	CT	3	6	2069760	2069765	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45506	NC_009727	CGT	2	6	2069839	2069844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45507	NC_009727	CTG	2	6	2069862	2069867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45508	NC_009727	GAA	2	6	2069875	2069880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45509	NC_009727	GGA	2	6	2069905	2069910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45510	NC_009727	ACG	2	6	2070036	2070041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45511	NC_009727	ACT	2	6	2070053	2070058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45512	NC_009727	CTCG	2	8	2070076	2070083	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45513	NC_009727	GC	3	6	2070100	2070105	0 %	0 %	50 %	50 %	209364277
45514	NC_009727	CAA	2	6	2070164	2070169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209364277
45515	NC_009727	AGCGA	2	10	2070182	2070191	40 %	0 %	40 %	20 %	209364277
45516	NC_009727	ATG	2	6	2070206	2070211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209364277
45517	NC_009727	AGC	2	6	2070250	2070255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45518	NC_009727	TAAA	2	8	2070283	2070290	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45519	NC_009727	A	6	6	2070288	2070293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45520	NC_009727	CAG	2	6	2070297	2070302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45521	NC_009727	CACTT	2	10	2070358	2070367	20 %	40 %	0 %	40 %	154706793
45522	NC_009727	AATT	2	8	2070373	2070380	50 %	50 %	0 %	0 %	154706793
45523	NC_009727	T	6	6	2070433	2070438	0 %	100 %	0 %	0 %	154706793
45524	NC_009727	TATT	2	8	2070464	2070471	25 %	75 %	0 %	0 %	154706793
45525	NC_009727	T	6	6	2070504	2070509	0 %	100 %	0 %	0 %	154706793
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45527	NC_009727	T	7	7	2070696	2070702	0 %	100 %	0 %	0 %	154706793
45528	NC_009727	T	7	7	2070751	2070757	0 %	100 %	0 %	0 %	154706793
45529	NC_009727	CAC	2	6	2070766	2070771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154706793
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45532	NC_009727	TTA	2	6	2070992	2070997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154706793
45533	NC_009727	CA	3	6	2071068	2071073	50 %	0 %	0 %	50 %	154706793
45534	NC_009727	ATA	2	6	2071120	2071125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154706793
45535	NC_009727	AAC	2	6	2071143	2071148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154706793
45536	NC_009727	AAT	2	6	2071152	2071157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154706793
45537	NC_009727	CAATAA	2	12	2071179	2071190	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	154706793
45538	NC_009727	TAA	2	6	2071236	2071241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154706793
45539	NC_009727	ACC	2	6	2071409	2071414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154706171
45540	NC_009727	ATA	2	6	2071458	2071463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154706171
45541	NC_009727	GCC	2	6	2071612	2071617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154706171
45542	NC_009727	TTC	2	6	2071638	2071643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154706171
45543	NC_009727	ATT	2	6	2071658	2071663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154706171
45544	NC_009727	TAA	2	6	2071664	2071669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154706171
45545	NC_009727	TGT	2	6	2071744	2071749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154706171
45546	NC_009727	CAAC	2	8	2071771	2071778	50 %	0 %	0 %	50 %	154706171
45547	NC_009727	ATC	2	6	2071829	2071834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154706171
45548	NC_009727	CATTT	2	10	2071871	2071880	20 %	60 %	0 %	20 %	154706171
45549	NC_009727	CGT	2	6	2071904	2071909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154706171
45550	NC_009727	ATC	2	6	2071913	2071918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154706171
45551	NC_009727	CGC	2	6	2071976	2071981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154706171
45552	NC_009727	TGCG	2	8	2071989	2071996	0 %	25 %	50 %	25 %	154706171
45553	NC_009727	GCT	2	6	2072020	2072025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154706171
45554	NC_009727	CTT	2	6	2072050	2072055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154706171
45555	NC_009727	CAC	2	6	2072057	2072062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154706171
45556	NC_009727	CG	3	6	2072120	2072125	0 %	0 %	50 %	50 %	154706171
45557	NC_009727	CGA	2	6	2072194	2072199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154706171
45558	NC_009727	TTGC	2	8	2072312	2072319	0 %	50 %	25 %	25 %	154706171
45559	NC_009727	TCAT	2	8	2072409	2072416	25 %	50 %	0 %	25 %	154706171
45560	NC_009727	TGC	2	6	2072417	2072422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154706171
45561	NC_009727	CG	3	6	2072432	2072437	0 %	0 %	50 %	50 %	154706171
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45567	NC_009727	CGT	2	6	2072514	2072519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154706171
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45569	NC_009727	GC	3	6	2072615	2072620	0 %	0 %	50 %	50 %	154706171
45570	NC_009727	CAT	3	9	2072639	2072647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154706171
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45578	NC_009727	CAC	2	6	2072880	2072885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154706185
45579	NC_009727	ACC	2	6	2072946	2072951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154706185
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45586	NC_009727	CAT	2	6	2073208	2073213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154706185
45587	NC_009727	GCTT	2	8	2073239	2073246	0 %	50 %	25 %	25 %	154706185
45588	NC_009727	GGC	2	6	2073303	2073308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154706185
45589	NC_009727	AGA	2	6	2073323	2073328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154706185
45590	NC_009727	GTC	2	6	2073343	2073348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154706185
45591	NC_009727	CGA	2	6	2073351	2073356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154706185
45592	NC_009727	TG	3	6	2073363	2073368	0 %	50 %	50 %	0 %	154706185
45593	NC_009727	G	6	6	2073382	2073387	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
45594	NC_009727	GAA	2	6	2073419	2073424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45595	NC_009727	GCG	2	6	2073456	2073461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154706300
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45601	NC_009727	TTA	2	6	2073770	2073775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154706300
45602	NC_009727	T	7	7	2073837	2073843	0 %	100 %	0 %	0 %	154706300
45603	NC_009727	TTC	2	6	2073877	2073882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154706300
45604	NC_009727	TTTTC	2	10	2073884	2073893	0 %	80 %	0 %	20 %	154706300
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45606	NC_009727	GA	3	6	2073952	2073957	50 %	0 %	50 %	0 %	154706300
45607	NC_009727	TTC	2	6	2073982	2073987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154706300
45608	NC_009727	A	6	6	2074068	2074073	100 %	0 %	0 %	0 %	154706300
45609	NC_009727	TCT	2	6	2074201	2074206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154706300
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