MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii Dugway 5J108-111 chromosome

Total Repeats: 47475

< Previous12...83848586878889909192939495Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44502	NC_009727	AAAC	2	8	2023899	2023906	75 %	0 %	0 %	25 %	154706439
44503	NC_009727	CTA	2	6	2024057	2024062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154706439
44504	NC_009727	T	9	9	2024094	2024102	0 %	100 %	0 %	0 %	154706439
44505	NC_009727	TAA	2	6	2024115	2024120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44506	NC_009727	AGA	2	6	2024233	2024238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154705977
44507	NC_009727	A	6	6	2024253	2024258	100 %	0 %	0 %	0 %	154705977
44508	NC_009727	ATT	3	9	2024268	2024276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154705977
44509	NC_009727	AGC	2	6	2024283	2024288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154705977
44510	NC_009727	CTG	2	6	2024325	2024330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154705977
44511	NC_009727	CTA	2	6	2024351	2024356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154705977
44512	NC_009727	CAAA	2	8	2024465	2024472	75 %	0 %	0 %	25 %	154705977
44513	NC_009727	CGT	2	6	2024501	2024506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154705977
44514	NC_009727	ATCA	2	8	2024514	2024521	50 %	25 %	0 %	25 %	154705977
44515	NC_009727	A	6	6	2024565	2024570	100 %	0 %	0 %	0 %	154705977
44516	NC_009727	TAA	2	6	2024571	2024576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154705977
44517	NC_009727	AACGC	2	10	2024638	2024647	40 %	0 %	20 %	40 %	154705977
44518	NC_009727	TAA	2	6	2024745	2024750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154705977
44519	NC_009727	GC	3	6	2024905	2024910	0 %	0 %	50 %	50 %	154705977
44520	NC_009727	AAG	2	6	2024951	2024956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154705977
44521	NC_009727	A	7	7	2025007	2025013	100 %	0 %	0 %	0 %	154705977
44522	NC_009727	AAT	2	6	2025047	2025052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154705977
44523	NC_009727	TTG	2	6	2025060	2025065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154705977
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44525	NC_009727	A	6	6	2025114	2025119	100 %	0 %	0 %	0 %	154705740
44526	NC_009727	ATA	2	6	2025211	2025216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154705740
44527	NC_009727	CGC	2	6	2025252	2025257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154705740
44528	NC_009727	CT	3	6	2025328	2025333	0 %	50 %	0 %	50 %	154705740
44529	NC_009727	TAC	2	6	2025355	2025360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154705740
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44532	NC_009727	A	6	6	2025612	2025617	100 %	0 %	0 %	0 %	154705740
44533	NC_009727	CTT	2	6	2025622	2025627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154705740
44534	NC_009727	AGA	2	6	2025644	2025649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44535	NC_009727	C	7	7	2025867	2025873	0 %	0 %	0 %	100 %	209364257
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44538	NC_009727	C	7	7	2025988	2025994	0 %	0 %	0 %	100 %	209364257
44539	NC_009727	GCA	2	6	2026037	2026042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209364257
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44553	NC_009727	T	8	8	2026449	2026456	0 %	100 %	0 %	0 %	209364257
44554	NC_009727	TAG	2	6	2026488	2026493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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44556	NC_009727	CATG	2	8	2026537	2026544	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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44559	NC_009727	A	6	6	2026606	2026611	100 %	0 %	0 %	0 %	209364258
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44587	NC_009727	TA	3	6	2027836	2027841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44590	NC_009727	TGCT	2	8	2028062	2028069	0 %	50 %	25 %	25 %	154707019
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44603	NC_009727	T	7	7	2028581	2028587	0 %	100 %	0 %	0 %	154707019
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44617	NC_009727	ATCCA	2	10	2029168	2029177	40 %	20 %	0 %	40 %	154707019
44618	NC_009727	A	6	6	2029191	2029196	100 %	0 %	0 %	0 %	154707019
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