MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii Dugway 5J108-111 chromosome

Total Repeats: 47475

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44002	NC_009727	ACG	2	6	1999921	1999926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209364245
44003	NC_009727	GGT	2	6	1999934	1999939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209364245
44004	NC_009727	A	7	7	1999975	1999981	100 %	0 %	0 %	0 %	209364245
44005	NC_009727	CGG	2	6	1999988	1999993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209364245
44006	NC_009727	AGG	2	6	2000053	2000058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209364245
44007	NC_009727	A	6	6	2000074	2000079	100 %	0 %	0 %	0 %	209364245
44008	NC_009727	ACCC	2	8	2000122	2000129	25 %	0 %	0 %	75 %	209364245
44009	NC_009727	TCA	2	6	2000150	2000155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209364245
44010	NC_009727	TAGA	2	8	2000178	2000185	50 %	25 %	25 %	0 %	209364245
44011	NC_009727	ACC	2	6	2000237	2000242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209364245
44012	NC_009727	GCC	2	6	2000261	2000266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209364245
44013	NC_009727	ATA	2	6	2000319	2000324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44014	NC_009727	ACA	2	6	2000401	2000406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44015	NC_009727	ACC	2	6	2000417	2000422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44016	NC_009727	A	6	6	2000426	2000431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44017	NC_009727	TTC	2	6	2000456	2000461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44018	NC_009727	GGC	2	6	2000465	2000470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44019	NC_009727	CAA	2	6	2000483	2000488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44020	NC_009727	GAT	2	6	2000543	2000548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209364246
44021	NC_009727	CAA	2	6	2000549	2000554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209364246
44022	NC_009727	ATA	2	6	2000559	2000564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209364246
44023	NC_009727	AAG	2	6	2000569	2000574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209364246
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44025	NC_009727	TTC	2	6	2000667	2000672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209364246
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44027	NC_009727	ATC	2	6	2000842	2000847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209364247
44028	NC_009727	GAT	2	6	2000977	2000982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209364247
44029	NC_009727	TCA	2	6	2000990	2000995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209364247
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44032	NC_009727	ACT	2	6	2001203	2001208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209364247
44033	NC_009727	CAA	2	6	2001327	2001332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209364247
44034	NC_009727	TGC	2	6	2001443	2001448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209364247
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44037	NC_009727	CTCG	2	8	2001630	2001637	0 %	25 %	25 %	50 %	209364247
44038	NC_009727	GCG	2	6	2001674	2001679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209364247
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44041	NC_009727	T	6	6	2001837	2001842	0 %	100 %	0 %	0 %	209364247
44042	NC_009727	TCA	2	6	2001894	2001899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209364247
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44046	NC_009727	CAAAA	2	10	2002047	2002056	80 %	0 %	0 %	20 %	209364247
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44050	NC_009727	TCC	2	6	2002187	2002192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209364247
44051	NC_009727	GAC	2	6	2002195	2002200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209364247
44052	NC_009727	TGA	2	6	2002295	2002300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209364247
44053	NC_009727	A	8	8	2002343	2002350	100 %	0 %	0 %	0 %	209364247
44054	NC_009727	TGAC	2	8	2002352	2002359	25 %	25 %	25 %	25 %	209364247
44055	NC_009727	TCA	2	6	2002444	2002449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44056	NC_009727	TCT	2	6	2002495	2002500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44057	NC_009727	A	7	7	2002518	2002524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44058	NC_009727	TGA	2	6	2002590	2002595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44059	NC_009727	TGA	2	6	2002602	2002607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44060	NC_009727	TGC	2	6	2002731	2002736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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44062	NC_009727	CTT	2	6	2002773	2002778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44063	NC_009727	TTTTCA	2	12	2002789	2002800	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44064	NC_009727	TA	3	6	2002823	2002828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44065	NC_009727	TC	3	6	2002853	2002858	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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44072	NC_009727	T	9	9	2003097	2003105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44073	NC_009727	TTTC	2	8	2003147	2003154	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44074	NC_009727	TTTC	2	8	2003165	2003172	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44075	NC_009727	T	7	7	2003178	2003184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44076	NC_009727	ACTT	2	8	2003196	2003203	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44077	NC_009727	TCTT	2	8	2003209	2003216	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44078	NC_009727	AG	3	6	2003217	2003222	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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44080	NC_009727	T	7	7	2003330	2003336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44081	NC_009727	GTC	2	6	2003349	2003354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44082	NC_009727	T	7	7	2003510	2003516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44089	NC_009727	GGA	2	6	2003836	2003841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154706143
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44091	NC_009727	GC	3	6	2003946	2003951	0 %	0 %	50 %	50 %	154706143
44092	NC_009727	TCT	2	6	2003977	2003982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154706143
44093	NC_009727	TG	3	6	2004007	2004012	0 %	50 %	50 %	0 %	154706143
44094	NC_009727	GCA	2	6	2004127	2004132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154706143
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44100	NC_009727	ATTT	2	8	2004376	2004383	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44101	NC_009727	AAT	2	6	2004391	2004396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44102	NC_009727	TTAAT	2	10	2004443	2004452	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44103	NC_009727	TTTAA	2	10	2004453	2004462	40 %	60 %	0 %	0 %	209364248
44104	NC_009727	TTAA	2	8	2004481	2004488	50 %	50 %	0 %	0 %	209364248
44105	NC_009727	GC	3	6	2004579	2004584	0 %	0 %	50 %	50 %	209364248
44106	NC_009727	GGC	2	6	2004636	2004641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209364248
44107	NC_009727	ATT	2	6	2004646	2004651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209364248
44108	NC_009727	TAT	2	6	2004653	2004658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209364248
44109	NC_009727	T	7	7	2004715	2004721	0 %	100 %	0 %	0 %	209364248
44110	NC_009727	CCAT	2	8	2004757	2004764	25 %	25 %	0 %	50 %	209364248
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44112	NC_009727	TTC	2	6	2004905	2004910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209364248
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44117	NC_009727	ACC	2	6	2005108	2005113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209364248
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44120	NC_009727	CACG	2	8	2005203	2005210	25 %	0 %	25 %	50 %	209364248
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