MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii Dugway 5J108-111 chromosome

Total Repeats: 47475

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38502	NC_009727	TCCCT	2	10	1748072	1748081	0 %	40 %	0 %	60 %	209364167
38503	NC_009727	GA	3	6	1748157	1748162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38504	NC_009727	TGA	2	6	1748212	1748217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38505	NC_009727	TATCGG	2	12	1748222	1748233	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38506	NC_009727	TTC	2	6	1748235	1748240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38507	NC_009727	T	6	6	1748295	1748300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38508	NC_009727	TTC	2	6	1748304	1748309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38509	NC_009727	TAAA	2	8	1748381	1748388	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38510	NC_009727	T	6	6	1748392	1748397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38511	NC_009727	AAT	2	6	1748463	1748468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38512	NC_009727	T	6	6	1748480	1748485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38513	NC_009727	CTC	2	6	1748508	1748513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38514	NC_009727	CAA	2	6	1748589	1748594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38515	NC_009727	AAC	2	6	1748614	1748619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38516	NC_009727	AGA	2	6	1748661	1748666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38517	NC_009727	AAT	2	6	1748668	1748673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38518	NC_009727	AGA	2	6	1748718	1748723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38519	NC_009727	A	6	6	1748734	1748739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38520	NC_009727	A	7	7	1748741	1748747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38521	NC_009727	TCCA	2	8	1748776	1748783	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38522	NC_009727	T	7	7	1748807	1748813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38523	NC_009727	AAT	2	6	1748886	1748891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38524	NC_009727	CTC	2	6	1748937	1748942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38525	NC_009727	ACT	2	6	1748943	1748948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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38527	NC_009727	ATTA	2	8	1749003	1749010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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38529	NC_009727	CAT	2	6	1749113	1749118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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38531	NC_009727	TAA	2	6	1749207	1749212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38532	NC_009727	GAG	2	6	1749221	1749226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38533	NC_009727	ATA	2	6	1749251	1749256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38534	NC_009727	A	8	8	1749260	1749267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38535	NC_009727	GTT	2	6	1749314	1749319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38536	NC_009727	TCT	2	6	1749367	1749372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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38538	NC_009727	TAA	2	6	1749465	1749470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38539	NC_009727	TAA	2	6	1749522	1749527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38540	NC_009727	TGC	2	6	1749530	1749535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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38542	NC_009727	GTTT	2	8	1749627	1749634	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38543	NC_009727	TTC	2	6	1749662	1749667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38544	NC_009727	A	6	6	1749747	1749752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38545	NC_009727	CAAAT	2	10	1749841	1749850	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
38546	NC_009727	AATA	2	8	1749856	1749863	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38547	NC_009727	T	7	7	1749933	1749939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38548	NC_009727	CA	3	6	1749979	1749984	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38549	NC_009727	AAAT	2	8	1749990	1749997	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38550	NC_009727	TTA	2	6	1750020	1750025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38551	NC_009727	AAAAT	2	10	1750026	1750035	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38552	NC_009727	AGG	2	6	1750079	1750084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38553	NC_009727	A	7	7	1750090	1750096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38554	NC_009727	GAT	2	6	1750123	1750128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38555	NC_009727	GTC	2	6	1750136	1750141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38556	NC_009727	TCT	2	6	1750155	1750160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38557	NC_009727	ATC	2	6	1750205	1750210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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38559	NC_009727	CT	3	6	1750311	1750316	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38560	NC_009727	T	6	6	1750337	1750342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38561	NC_009727	TA	3	6	1750372	1750377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38562	NC_009727	TCAGTT	2	12	1750434	1750445	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38563	NC_009727	AG	4	8	1750494	1750501	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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38578	NC_009727	T	7	7	1751188	1751194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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