MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii Dugway 5J108-111 chromosome

Total Repeats: 47475

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28002	NC_009727	GTT	2	6	1257698	1257703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154706198
28003	NC_009727	TC	3	6	1257775	1257780	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28004	NC_009727	CAT	2	6	1257807	1257812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28005	NC_009727	T	6	6	1257843	1257848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28006	NC_009727	ATTTCT	2	12	1257936	1257947	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28007	NC_009727	AAAAT	2	10	1257975	1257984	80 %	20 %	0 %	0 %	209364023
28008	NC_009727	TGA	2	6	1258018	1258023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209364023
28009	NC_009727	CTT	2	6	1258033	1258038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209364023
28010	NC_009727	TCA	2	6	1258113	1258118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209364023
28011	NC_009727	AAG	2	6	1258143	1258148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209364023
28012	NC_009727	TGG	2	6	1258237	1258242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209364023
28013	NC_009727	GCG	2	6	1258245	1258250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209364023
28014	NC_009727	GGT	2	6	1258256	1258261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209364023
28015	NC_009727	GGC	2	6	1258265	1258270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209364023
28016	NC_009727	GGC	2	6	1258277	1258282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209364023
28017	NC_009727	CAA	2	6	1258311	1258316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28018	NC_009727	CTC	2	6	1258332	1258337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28019	NC_009727	AGGA	2	8	1258364	1258371	50 %	0 %	50 %	0 %	154706922
28020	NC_009727	TCT	2	6	1258418	1258423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154706922
28021	NC_009727	CTG	2	6	1258452	1258457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154706922
28022	NC_009727	GTTTGG	2	12	1258462	1258473	0 %	50 %	50 %	0 %	154706922
28023	NC_009727	G	6	6	1258472	1258477	0 %	0 %	100 %	0 %	154706922
28024	NC_009727	AAAT	2	8	1258555	1258562	75 %	25 %	0 %	0 %	154706922
28025	NC_009727	TAA	2	6	1258563	1258568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154706922
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28027	NC_009727	CTT	2	6	1258708	1258713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154706922
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28029	NC_009727	C	6	6	1258738	1258743	0 %	0 %	0 %	100 %	154706922
28030	NC_009727	GCG	2	6	1258839	1258844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154706922
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28034	NC_009727	TGTT	2	8	1258987	1258994	0 %	75 %	25 %	0 %	154706922
28035	NC_009727	T	6	6	1258993	1258998	0 %	100 %	0 %	0 %	154706922
28036	NC_009727	A	7	7	1259056	1259062	100 %	0 %	0 %	0 %	154706922
28037	NC_009727	AAT	2	6	1259127	1259132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28038	NC_009727	GGCA	2	8	1259210	1259217	25 %	0 %	50 %	25 %	154706355
28039	NC_009727	TTC	2	6	1259268	1259273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154706355
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28041	NC_009727	CGT	2	6	1259329	1259334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154706355
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28049	NC_009727	GCCTTC	2	12	1259652	1259663	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	154706355
28050	NC_009727	ATC	2	6	1259712	1259717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154706355
28051	NC_009727	TCG	2	6	1259745	1259750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154706355
28052	NC_009727	T	6	6	1259757	1259762	0 %	100 %	0 %	0 %	154706355
28053	NC_009727	AAC	2	6	1259784	1259789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154706355
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28057	NC_009727	GCTC	2	8	1260065	1260072	0 %	25 %	25 %	50 %	154706355
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28068	NC_009727	A	7	7	1260549	1260555	100 %	0 %	0 %	0 %	154706355
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28086	NC_009727	TA	3	6	1261234	1261239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28087	NC_009727	GAG	2	6	1261247	1261252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28088	NC_009727	GCCTA	2	10	1261256	1261265	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
28089	NC_009727	GAT	2	6	1261327	1261332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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28091	NC_009727	GC	3	6	1261424	1261429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28092	NC_009727	GCC	2	6	1261496	1261501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28093	NC_009727	GAC	2	6	1261551	1261556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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28099	NC_009727	ATA	2	6	1261888	1261893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28100	NC_009727	ACTA	2	8	1261904	1261911	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28101	NC_009727	A	6	6	1261917	1261922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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28106	NC_009727	AC	3	6	1262089	1262094	50 %	0 %	0 %	50 %	154707752
28107	NC_009727	A	6	6	1262104	1262109	100 %	0 %	0 %	0 %	154707752
28108	NC_009727	AGC	2	6	1262135	1262140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154707752
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28114	NC_009727	CAC	2	6	1262537	1262542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154707752
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28472	NC_009727	TGC	2	6	1280122	1280127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209364030
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