MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii Dugway 5J108-111 chromosome

Total Repeats: 47475

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25502	NC_009727	GCC	2	6	1149240	1149245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154706159
25503	NC_009727	TAT	2	6	1149347	1149352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154706159
25504	NC_009727	A	6	6	1149382	1149387	100 %	0 %	0 %	0 %	154706159
25505	NC_009727	GC	3	6	1149388	1149393	0 %	0 %	50 %	50 %	154706159
25506	NC_009727	GGT	2	6	1149432	1149437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154706159
25507	NC_009727	GTG	2	6	1149561	1149566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154706159
25508	NC_009727	TGT	2	6	1149644	1149649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154706159
25509	NC_009727	ATGG	2	8	1149655	1149662	25 %	25 %	50 %	0 %	154706159
25510	NC_009727	TCA	2	6	1149670	1149675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154706159
25511	NC_009727	C	6	6	1149733	1149738	0 %	0 %	0 %	100 %	154706159
25512	NC_009727	GCT	2	6	1149754	1149759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154706159
25513	NC_009727	TGT	2	6	1149870	1149875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154706159
25514	NC_009727	T	6	6	1149875	1149880	0 %	100 %	0 %	0 %	154706159
25515	NC_009727	AATT	2	8	1149886	1149893	50 %	50 %	0 %	0 %	154706159
25516	NC_009727	GAA	2	6	1149914	1149919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154707144
25517	NC_009727	TC	3	6	1149938	1149943	0 %	50 %	0 %	50 %	154707144
25518	NC_009727	ATT	2	6	1149990	1149995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154707144
25519	NC_009727	T	6	6	1149994	1149999	0 %	100 %	0 %	0 %	154707144
25520	NC_009727	GAA	2	6	1150026	1150031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154707144
25521	NC_009727	GCA	2	6	1150054	1150059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154707144
25522	NC_009727	ATTT	2	8	1150106	1150113	25 %	75 %	0 %	0 %	154707144
25523	NC_009727	A	6	6	1150115	1150120	100 %	0 %	0 %	0 %	154707144
25524	NC_009727	TTA	2	6	1150161	1150166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154707144
25525	NC_009727	GGC	2	6	1150177	1150182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154707144
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25528	NC_009727	CCGT	2	8	1150246	1150253	0 %	25 %	25 %	50 %	154707144
25529	NC_009727	AAT	2	6	1150302	1150307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154707144
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25531	NC_009727	AATTA	2	10	1150354	1150363	60 %	40 %	0 %	0 %	154707144
25532	NC_009727	ATTA	2	8	1150388	1150395	50 %	50 %	0 %	0 %	154707144
25533	NC_009727	TAA	2	6	1150416	1150421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154707144
25534	NC_009727	TCC	2	6	1150427	1150432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25535	NC_009727	T	8	8	1150434	1150441	0 %	100 %	0 %	0 %	209363985
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25539	NC_009727	T	6	6	1150632	1150637	0 %	100 %	0 %	0 %	209363985
25540	NC_009727	AAT	2	6	1150640	1150645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209363985
25541	NC_009727	AAT	2	6	1150647	1150652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209363985
25542	NC_009727	ATC	2	6	1150683	1150688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209363985
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25547	NC_009727	GT	3	6	1150913	1150918	0 %	50 %	50 %	0 %	209363985
25548	NC_009727	ATC	2	6	1150996	1151001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209363985
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25551	NC_009727	T	7	7	1151065	1151071	0 %	100 %	0 %	0 %	154706204
25552	NC_009727	TAA	2	6	1151074	1151079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154706204
25553	NC_009727	ATT	2	6	1151159	1151164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154706204
25554	NC_009727	T	6	6	1151163	1151168	0 %	100 %	0 %	0 %	154706204
25555	NC_009727	GTT	2	6	1151198	1151203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154706204
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25561	NC_009727	GCCA	2	8	1151484	1151491	25 %	0 %	25 %	50 %	154706204
25562	NC_009727	ATC	2	6	1151570	1151575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154706204
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25570	NC_009727	CG	3	6	1151718	1151723	0 %	0 %	50 %	50 %	154706204
25571	NC_009727	TCT	2	6	1151801	1151806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154706204
25572	NC_009727	A	6	6	1151835	1151840	100 %	0 %	0 %	0 %	154706204
25573	NC_009727	AAC	2	6	1151842	1151847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154706204
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25586	NC_009727	CGG	2	6	1152257	1152262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154707601
25587	NC_009727	TCGCT	2	10	1152287	1152296	0 %	40 %	20 %	40 %	154707601
25588	NC_009727	TACTT	2	10	1152306	1152315	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25589	NC_009727	CCCG	2	8	1152365	1152372	0 %	0 %	25 %	75 %	154707124
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25592	NC_009727	TGA	2	6	1152568	1152573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154707124
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25595	NC_009727	GGGC	2	8	1152670	1152677	0 %	0 %	75 %	25 %	154707124
25596	NC_009727	ATA	2	6	1152678	1152683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154707124
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25601	NC_009727	ATTCG	2	10	1152828	1152837	20 %	40 %	20 %	20 %	154707124
25602	NC_009727	CAA	2	6	1152874	1152879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154707124
25603	NC_009727	CAC	2	6	1152889	1152894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154707124
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25606	NC_009727	C	7	7	1153112	1153118	0 %	0 %	0 %	100 %	154707124
25607	NC_009727	T	7	7	1153150	1153156	0 %	100 %	0 %	0 %	154707124
25608	NC_009727	AATAA	2	10	1153209	1153218	80 %	20 %	0 %	0 %	154707124
25609	NC_009727	GCG	2	6	1153258	1153263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154707124
25610	NC_009727	AAT	2	6	1153286	1153291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154707124
25611	NC_009727	TGGC	2	8	1153321	1153328	0 %	25 %	50 %	25 %	154705881
25612	NC_009727	TTG	2	6	1153329	1153334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154705881
25613	NC_009727	GAT	2	6	1153348	1153353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154705881
25614	NC_009727	CTT	2	6	1153396	1153401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154705881
25615	NC_009727	TCA	2	6	1153410	1153415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154705881
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