MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii Dugway 5J108-111 chromosome

Total Repeats: 47475

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25002	NC_009727	GCAA	2	8	1128063	1128070	50 %	0 %	25 %	25 %	154707310
25003	NC_009727	CTT	2	6	1128218	1128223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25004	NC_009727	GTATA	2	10	1128281	1128290	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25005	NC_009727	CAG	2	6	1128331	1128336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25006	NC_009727	TTCTT	2	10	1128419	1128428	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
25007	NC_009727	CGT	2	6	1128448	1128453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25008	NC_009727	CAAT	2	8	1128513	1128520	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25009	NC_009727	TAT	2	6	1128540	1128545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25010	NC_009727	AGG	2	6	1128625	1128630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25011	NC_009727	TAT	2	6	1128697	1128702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25012	NC_009727	TTG	2	6	1128725	1128730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25013	NC_009727	GGT	2	6	1128760	1128765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25014	NC_009727	TTCT	2	8	1128801	1128808	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25015	NC_009727	AAT	3	9	1128829	1128837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25016	NC_009727	CA	3	6	1128871	1128876	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25017	NC_009727	ATT	2	6	1128902	1128907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25018	NC_009727	ATT	2	6	1128950	1128955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25019	NC_009727	ATT	2	6	1129036	1129041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25020	NC_009727	GGGTG	2	10	1129042	1129051	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
25021	NC_009727	AGG	2	6	1129066	1129071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25022	NC_009727	ACC	2	6	1129121	1129126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25023	NC_009727	T	6	6	1129130	1129135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25024	NC_009727	TTG	2	6	1129151	1129156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25025	NC_009727	ATT	2	6	1129161	1129166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25027	NC_009727	CAT	2	6	1129279	1129284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25028	NC_009727	GCAA	2	8	1129291	1129298	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25029	NC_009727	T	6	6	1129311	1129316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25030	NC_009727	TTA	2	6	1129337	1129342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25031	NC_009727	ATT	2	6	1129364	1129369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25032	NC_009727	ATGAAA	2	12	1129513	1129524	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25033	NC_009727	TG	3	6	1129570	1129575	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25034	NC_009727	AGG	2	6	1129598	1129603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25035	NC_009727	ATT	3	9	1129611	1129619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25036	NC_009727	GAG	2	6	1129642	1129647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25037	NC_009727	T	6	6	1129665	1129670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25038	NC_009727	ATT	2	6	1129686	1129691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25039	NC_009727	TAA	2	6	1129727	1129732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25040	NC_009727	TTG	2	6	1129876	1129881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25041	NC_009727	CTAA	2	8	1129894	1129901	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25042	NC_009727	CTAG	2	8	1129910	1129917	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25043	NC_009727	CAC	2	6	1129937	1129942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25044	NC_009727	AT	3	6	1129950	1129955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25045	NC_009727	GCCT	2	8	1129963	1129970	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25046	NC_009727	CTC	2	6	1129980	1129985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25047	NC_009727	GA	4	8	1130051	1130058	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25048	NC_009727	AGTT	2	8	1130061	1130068	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25049	NC_009727	TTGA	2	8	1130069	1130076	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25050	NC_009727	ATC	2	6	1130088	1130093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25051	NC_009727	AT	3	6	1130107	1130112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25052	NC_009727	CAAA	2	8	1130142	1130149	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
25053	NC_009727	GAC	2	6	1130326	1130331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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25055	NC_009727	TTC	2	6	1130400	1130405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25056	NC_009727	TA	3	6	1130427	1130432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25057	NC_009727	GTTTG	2	10	1130435	1130444	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
25058	NC_009727	TTA	2	6	1130446	1130451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25059	NC_009727	GCA	2	6	1130459	1130464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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25061	NC_009727	T	6	6	1130505	1130510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25063	NC_009727	T	6	6	1130601	1130606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25064	NC_009727	TTC	2	6	1130634	1130639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25065	NC_009727	CTT	2	6	1130676	1130681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25066	NC_009727	T	6	6	1130695	1130700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25092	NC_009727	CTTTT	2	10	1131628	1131637	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
25093	NC_009727	GA	3	6	1131729	1131734	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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25101	NC_009727	T	6	6	1132004	1132009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25102	NC_009727	TTC	2	6	1132026	1132031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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25105	NC_009727	TAA	2	6	1132095	1132100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25118	NC_009727	A	6	6	1132556	1132561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25119	NC_009727	TTAT	2	8	1132619	1132626	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25129	NC_009727	T	6	6	1132992	1132997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25499	NC_009727	ATGGG	2	10	1149009	1149018	20 %	20 %	60 %	0 %	154706159
25500	NC_009727	G	6	6	1149042	1149047	0 %	0 %	100 %	0 %	154706159

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