MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii Dugway 5J108-111 chromosome

Total Repeats: 47475

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_009727	CCA	2	6	632719	632724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154707634
14003	NC_009727	T	7	7	632785	632791	0 %	100 %	0 %	0 %	154707634
14004	NC_009727	GCGG	2	8	632840	632847	0 %	0 %	75 %	25 %	154707634
14005	NC_009727	AAT	2	6	632857	632862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154707634
14006	NC_009727	AGGA	2	8	632886	632893	50 %	0 %	50 %	0 %	154707634
14007	NC_009727	GTT	2	6	632899	632904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154707634
14008	NC_009727	CG	3	6	632925	632930	0 %	0 %	50 %	50 %	154707634
14009	NC_009727	TAAA	2	8	632943	632950	75 %	25 %	0 %	0 %	154707634
14010	NC_009727	ATT	2	6	632951	632956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154707634
14011	NC_009727	GCCT	2	8	632986	632993	0 %	25 %	25 %	50 %	154707634
14012	NC_009727	GTT	2	6	633008	633013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154707634
14013	NC_009727	GAA	2	6	633017	633022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154707634
14014	NC_009727	CAG	2	6	633057	633062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154707634
14015	NC_009727	ATT	2	6	633091	633096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154707634
14016	NC_009727	AAG	2	6	633283	633288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154707634
14017	NC_009727	GAA	3	9	633344	633352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154707634
14018	NC_009727	GAA	2	6	633361	633366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154707634
14019	NC_009727	GGA	2	6	633535	633540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14020	NC_009727	TTTTAA	2	12	633585	633596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154707273
14021	NC_009727	TATTGT	2	12	633664	633675	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	154707273
14022	NC_009727	TTCA	2	8	633677	633684	25 %	50 %	0 %	25 %	154707273
14023	NC_009727	TGTT	2	8	633695	633702	0 %	75 %	25 %	0 %	154707273
14024	NC_009727	TGC	2	6	633771	633776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154707273
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14027	NC_009727	TTTG	2	8	633888	633895	0 %	75 %	25 %	0 %	154707273
14028	NC_009727	AGC	2	6	634051	634056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154707273
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14031	NC_009727	CTACC	2	10	634125	634134	20 %	20 %	0 %	60 %	154707273
14032	NC_009727	TAT	2	6	634141	634146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154707273
14033	NC_009727	ACT	2	6	634271	634276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154707273
14034	NC_009727	TAG	2	6	634279	634284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154707273
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14041	NC_009727	CTTT	2	8	634560	634567	0 %	75 %	0 %	25 %	154706334
14042	NC_009727	GTT	2	6	634595	634600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154706334
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14051	NC_009727	GTA	2	6	635021	635026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154706334
14052	NC_009727	TTG	2	6	635033	635038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154706334
14053	NC_009727	A	7	7	635135	635141	100 %	0 %	0 %	0 %	154706334
14054	NC_009727	CGG	2	6	635146	635151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154706334
14055	NC_009727	CAT	2	6	635177	635182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154706334
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14057	NC_009727	A	7	7	635309	635315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14058	NC_009727	TTAT	2	8	635333	635340	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_009727	A	6	6	635355	635360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14061	NC_009727	A	6	6	635424	635429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14062	NC_009727	CTT	2	6	635463	635468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14063	NC_009727	TCTT	2	8	635489	635496	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14064	NC_009727	T	6	6	635549	635554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14065	NC_009727	T	6	6	635567	635572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14066	NC_009727	TA	3	6	635593	635598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14074	NC_009727	GCTT	2	8	636314	636321	0 %	50 %	25 %	25 %	154705754
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14082	NC_009727	CCA	2	6	636639	636644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154705754
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14089	NC_009727	TAA	2	6	637158	637163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154707526
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14095	NC_009727	AATA	2	8	637490	637497	75 %	25 %	0 %	0 %	154707526
14096	NC_009727	GCC	2	6	637540	637545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154707526
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14098	NC_009727	GTC	2	6	637689	637694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154707526
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14100	NC_009727	CT	3	6	637762	637767	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14101	NC_009727	GC	3	6	637855	637860	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14102	NC_009727	GC	3	6	637866	637871	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14103	NC_009727	TC	3	6	637954	637959	0 %	50 %	0 %	50 %	154706960
14104	NC_009727	TC	3	6	637966	637971	0 %	50 %	0 %	50 %	154706960
14105	NC_009727	TAT	2	6	637991	637996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154706960
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14107	NC_009727	TTC	2	6	638094	638099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154706960
14108	NC_009727	ACC	2	6	638101	638106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154706960
14109	NC_009727	CTT	2	6	638114	638119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154706960
14110	NC_009727	CTT	2	6	638144	638149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154706960
14111	NC_009727	TTC	2	6	638229	638234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154706960
14112	NC_009727	CAT	2	6	638255	638260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154706960
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14114	NC_009727	AG	3	6	638289	638294	50 %	0 %	50 %	0 %	154706960
14115	NC_009727	TCC	2	6	638313	638318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154706960
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14122	NC_009727	GC	4	8	638587	638594	0 %	0 %	50 %	50 %	154706960
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