MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium botulinum F str. Langeland plasmid pCLI

Total Repeats: 532

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009700	CTT	2	6	17	22	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009700	TATTT	2	10	38	47	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009700	A	6	6	92	97	100 %	0 %	0 %	0 %	153941553
4	NC_009700	GA	3	6	120	125	50 %	0 %	50 %	0 %	153941553
5	NC_009700	TGG	3	9	138	146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153941553
6	NC_009700	GCT	2	6	181	186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153941553
7	NC_009700	GGT	2	6	187	192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153941553
8	NC_009700	TGG	2	6	201	206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153941553
9	NC_009700	ATG	2	6	215	220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153941553
10	NC_009700	A	7	7	228	234	100 %	0 %	0 %	0 %	153941553
11	NC_009700	TA	3	6	243	248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009700	AGG	2	6	254	259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009700	TGG	2	6	309	314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153941557
14	NC_009700	GGT	2	6	319	324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153941557
15	NC_009700	GCT	2	6	349	354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153941557
16	NC_009700	TGG	2	6	366	371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153941557
17	NC_009700	TGT	2	6	372	377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153941557
18	NC_009700	AGC	2	6	391	396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153941557
19	NC_009700	TGG	2	6	408	413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153941557
20	NC_009700	TGG	2	6	420	425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153941557
21	NC_009700	ATG	2	6	451	456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153941557
22	NC_009700	AAT	2	6	470	475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009700	ATTT	2	8	486	493	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009700	TAAA	2	8	507	514	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009700	T	6	6	522	527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009700	TA	3	6	545	550	50 %	50 %	0 %	0 %	153941554
27	NC_009700	TCT	2	6	590	595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153941554
28	NC_009700	CTA	2	6	619	624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153941554
29	NC_009700	T	7	7	655	661	0 %	100 %	0 %	0 %	153941554
30	NC_009700	ATT	2	6	668	673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153941554
31	NC_009700	ATTT	2	8	679	686	25 %	75 %	0 %	0 %	153941554
32	NC_009700	A	8	8	689	696	100 %	0 %	0 %	0 %	153941554
33	NC_009700	CTAT	2	8	756	763	25 %	50 %	0 %	25 %	153941554
34	NC_009700	TTA	2	6	784	789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153941554
35	NC_009700	TAAC	2	8	929	936	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009700	T	6	6	942	947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009700	TAA	2	6	957	962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009700	ATG	2	6	971	976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009700	A	7	7	1040	1046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009700	GTA	2	6	1047	1052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009700	T	6	6	1066	1071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009700	CTAT	2	8	1076	1083	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009700	TATC	2	8	1093	1100	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_009700	TATGA	2	10	1110	1119	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009700	TATTCA	2	12	1163	1174	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	153941563
46	NC_009700	CAA	2	6	1210	1215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153941563
47	NC_009700	CT	3	6	1224	1229	0 %	50 %	0 %	50 %	153941563
48	NC_009700	CT	3	6	1247	1252	0 %	50 %	0 %	50 %	153941563
49	NC_009700	TTGT	2	8	1283	1290	0 %	75 %	25 %	0 %	153941563
50	NC_009700	AT	3	6	1291	1296	50 %	50 %	0 %	0 %	153941563
51	NC_009700	CAC	2	6	1312	1317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153941563
52	NC_009700	AC	3	6	1343	1348	50 %	0 %	0 %	50 %	153941563
53	NC_009700	A	6	6	1358	1363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009700	ATA	2	6	1409	1414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009700	TA	3	6	1413	1418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009700	AAT	2	6	1434	1439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009700	A	6	6	1456	1461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009700	TTATAA	2	12	1485	1496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009700	T	6	6	1503	1508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009700	A	7	7	1510	1516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009700	A	6	6	1550	1555	100 %	0 %	0 %	0 %	153941569
62	NC_009700	AGA	2	6	1572	1577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153941569
63	NC_009700	TGG	2	6	1584	1589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153941569
64	NC_009700	TATAA	2	10	1675	1684	60 %	40 %	0 %	0 %	153941569
65	NC_009700	TAAT	2	8	1695	1702	50 %	50 %	0 %	0 %	153941569
66	NC_009700	AGG	2	6	1707	1712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009700	A	6	6	1714	1719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009700	TTA	2	6	1736	1741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153941552
69	NC_009700	TGA	2	6	1747	1752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153941552
70	NC_009700	TTA	2	6	1760	1765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153941552
71	NC_009700	GTG	2	6	1806	1811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153941552
72	NC_009700	TGC	2	6	1819	1824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153941552
73	NC_009700	GTT	3	9	1841	1849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153941552
74	NC_009700	ACA	2	6	1856	1861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153941552
75	NC_009700	ATA	2	6	1894	1899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153941552
76	NC_009700	A	6	6	1922	1927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009700	ATT	2	6	1930	1935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009700	T	7	7	1934	1940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009700	TAT	2	6	1979	1984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153941566
80	NC_009700	TA	4	8	1986	1993	50 %	50 %	0 %	0 %	153941566
81	NC_009700	TA	4	8	2004	2011	50 %	50 %	0 %	0 %	153941566
82	NC_009700	AAT	2	6	2031	2036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153941566
83	NC_009700	TAA	3	9	2088	2096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153941566
84	NC_009700	CAC	2	6	2105	2110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153941566
85	NC_009700	TA	3	6	2139	2144	50 %	50 %	0 %	0 %	153941566
86	NC_009700	ATA	2	6	2191	2196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153941566
87	NC_009700	T	7	7	2218	2224	0 %	100 %	0 %	0 %	153941566
88	NC_009700	ATAA	2	8	2243	2250	75 %	25 %	0 %	0 %	153941566
89	NC_009700	A	7	7	2266	2272	100 %	0 %	0 %	0 %	153941566
90	NC_009700	TA	3	6	2291	2296	50 %	50 %	0 %	0 %	153941566
91	NC_009700	TAT	2	6	2300	2305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153941566
92	NC_009700	AT	3	6	2304	2309	50 %	50 %	0 %	0 %	153941566
93	NC_009700	TCA	2	6	2323	2328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153941566
94	NC_009700	TTC	2	6	2343	2348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153941566
95	NC_009700	TAT	2	6	2369	2374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153941566
96	NC_009700	TAAT	2	8	2381	2388	50 %	50 %	0 %	0 %	153941566
97	NC_009700	AAAT	2	8	2396	2403	75 %	25 %	0 %	0 %	153941561
98	NC_009700	TTA	2	6	2415	2420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153941561
99	NC_009700	CCT	2	6	2585	2590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_009700	ATT	2	6	2593	2598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009700	TA	3	6	2620	2625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009700	TA	5	10	2628	2637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009700	TAA	2	6	2645	2650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009700	TA	3	6	2651	2656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009700	ATTTTT	2	12	2824	2835	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009700	TTA	2	6	2859	2864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009700	ATT	2	6	2869	2874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009700	ATA	2	6	2875	2880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009700	AGG	2	6	2891	2896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009700	A	6	6	2969	2974	100 %	0 %	0 %	0 %	153941565
111	NC_009700	A	7	7	3072	3078	100 %	0 %	0 %	0 %	153941565
112	NC_009700	AT	3	6	3096	3101	50 %	50 %	0 %	0 %	153941565
113	NC_009700	ATTAA	2	10	3129	3138	60 %	40 %	0 %	0 %	153941565
114	NC_009700	AT	3	6	3185	3190	50 %	50 %	0 %	0 %	153941565
115	NC_009700	ATGA	2	8	3195	3202	50 %	25 %	25 %	0 %	153941565
116	NC_009700	ACA	2	6	3248	3253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153941565
117	NC_009700	AT	3	6	3262	3267	50 %	50 %	0 %	0 %	153941565
118	NC_009700	GCT	2	6	3276	3281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153941565
119	NC_009700	GGCT	2	8	3353	3360	0 %	25 %	50 %	25 %	153941565
120	NC_009700	GAT	2	6	3438	3443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153941565
121	NC_009700	ATTA	2	8	3475	3482	50 %	50 %	0 %	0 %	153941565
122	NC_009700	GGGT	2	8	3490	3497	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009700	AATT	2	8	3506	3513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009700	AAGG	2	8	3526	3533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009700	TTAC	2	8	3642	3649	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_009700	TC	3	6	3656	3661	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_009700	AT	3	6	3866	3871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009700	TTTA	2	8	3888	3895	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009700	TAG	2	6	4008	4013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153941556
130	NC_009700	ATAAA	2	10	4071	4080	80 %	20 %	0 %	0 %	153941556
131	NC_009700	TAC	2	6	4162	4167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_009700	TAT	2	6	4192	4197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009700	TTA	2	6	4204	4209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009700	TAT	2	6	4214	4219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009700	TAT	2	6	4234	4239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009700	TAAA	2	8	4257	4264	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009700	T	6	6	4305	4310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009700	ATTA	2	8	4322	4329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009700	TATT	2	8	4345	4352	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009700	TAT	2	6	4355	4360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009700	TATT	2	8	4368	4375	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009700	TAT	2	6	4378	4383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009700	ATT	2	6	4394	4399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009700	ACTT	2	8	4448	4455	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_009700	TTA	2	6	4465	4470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009700	TA	3	6	4469	4474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009700	TAC	2	6	4480	4485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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290	NC_009700	TTC	2	6	8873	8878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153941560
291	NC_009700	CTA	2	6	8890	8895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153941560
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301	NC_009700	AT	3	6	9177	9182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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