MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 chromosome

Total Repeats: 104857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_009480	GC	3	6	368567	368572	0 %	0 %	50 %	50 %	148271487
11003	NC_009480	CGA	2	6	368630	368635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271487
11004	NC_009480	CTC	2	6	368652	368657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271487
11005	NC_009480	GAG	2	6	368685	368690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271487
11006	NC_009480	ACC	2	6	368820	368825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271487
11007	NC_009480	CGA	4	12	368840	368851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271487
11008	NC_009480	CCGCG	2	10	368855	368864	0 %	0 %	40 %	60 %	148271487
11009	NC_009480	TCG	2	6	368875	368880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271487
11010	NC_009480	GCG	2	6	368908	368913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271487
11011	NC_009480	TCG	2	6	368956	368961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271487
11012	NC_009480	CGCGGG	2	12	369017	369028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271487
11013	NC_009480	TCA	2	6	369034	369039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271487
11014	NC_009480	CG	3	6	369040	369045	0 %	0 %	50 %	50 %	148271487
11015	NC_009480	GC	3	6	369131	369136	0 %	0 %	50 %	50 %	148271487
11016	NC_009480	TCG	2	6	369139	369144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271487
11017	NC_009480	CCG	2	6	369163	369168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271487
11018	NC_009480	CGC	2	6	369191	369196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271487
11019	NC_009480	CAC	2	6	369230	369235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271487
11020	NC_009480	CG	3	6	369236	369241	0 %	0 %	50 %	50 %	148271487
11021	NC_009480	ATC	2	6	369264	369269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271487
11022	NC_009480	TCC	2	6	369349	369354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11023	NC_009480	TCA	2	6	369360	369365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11024	NC_009480	TGC	2	6	369368	369373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11025	NC_009480	CGT	2	6	369382	369387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271488
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11027	NC_009480	CCG	2	6	369422	369427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271488
11028	NC_009480	GTCG	2	8	369450	369457	0 %	25 %	50 %	25 %	148271488
11029	NC_009480	CGG	2	6	369476	369481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271488
11030	NC_009480	GCCGCG	2	12	369502	369513	0 %	0 %	50 %	50 %	148271488
11031	NC_009480	CGATC	2	10	369540	369549	20 %	20 %	20 %	40 %	148271488
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11033	NC_009480	CGT	2	6	369581	369586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271488
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11039	NC_009480	TCCGC	2	10	369731	369740	0 %	20 %	20 %	60 %	148271488
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11043	NC_009480	CGT	2	6	369855	369860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271488
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11045	NC_009480	CG	3	6	369932	369937	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11046	NC_009480	GACG	2	8	369944	369951	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11047	NC_009480	CGC	3	9	369952	369960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11048	NC_009480	TGAAG	2	10	370074	370083	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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11051	NC_009480	CGT	2	6	370164	370169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271489
11052	NC_009480	CCG	2	6	370182	370187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271489
11053	NC_009480	TCGT	2	8	370198	370205	0 %	50 %	25 %	25 %	148271489
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11056	NC_009480	GCTCG	2	10	370308	370317	0 %	20 %	40 %	40 %	148271489
11057	NC_009480	CGG	2	6	370335	370340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271489
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11060	NC_009480	CTCG	2	8	370422	370429	0 %	25 %	25 %	50 %	148271489
11061	NC_009480	CGA	2	6	370449	370454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271489
11062	NC_009480	CG	3	6	370458	370463	0 %	0 %	50 %	50 %	148271489
11063	NC_009480	TGA	2	6	370490	370495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271489
11064	NC_009480	CG	3	6	370514	370519	0 %	0 %	50 %	50 %	148271489
11065	NC_009480	ACC	2	6	370556	370561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271489
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11085	NC_009480	CGA	2	6	371370	371375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271489
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11089	NC_009480	TCG	2	6	371570	371575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271489
11090	NC_009480	GCC	2	6	371598	371603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271489
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11093	NC_009480	CGC	2	6	371664	371669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11094	NC_009480	CGGC	2	8	371675	371682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11095	NC_009480	CGT	2	6	371686	371691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11099	NC_009480	CG	4	8	371782	371789	0 %	0 %	50 %	50 %	148271490
11100	NC_009480	CTG	2	6	371797	371802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271490
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11102	NC_009480	CGACC	2	10	371865	371874	20 %	0 %	20 %	60 %	148271490
11103	NC_009480	GAC	2	6	371887	371892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271490
11104	NC_009480	GTC	2	6	371893	371898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271490
11105	NC_009480	ACG	2	6	371906	371911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271490
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11107	NC_009480	GGCGAG	2	12	371971	371982	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
11108	NC_009480	GGC	2	6	371983	371988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11109	NC_009480	GCC	2	6	371996	372001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11110	NC_009480	CGG	2	6	372005	372010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11111	NC_009480	AGC	2	6	372069	372074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11112	NC_009480	TCC	2	6	372122	372127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11113	NC_009480	CCG	2	6	372158	372163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11114	NC_009480	GCCGG	2	10	372169	372178	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11115	NC_009480	GAG	2	6	372196	372201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11116	NC_009480	CGC	2	6	372210	372215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11117	NC_009480	G	6	6	372222	372227	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11118	NC_009480	GC	3	6	372236	372241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11119	NC_009480	TGC	2	6	372271	372276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11120	NC_009480	GCA	2	6	372297	372302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271491
11121	NC_009480	ATCACG	2	12	372308	372319	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148271491
11122	NC_009480	GGC	2	6	372357	372362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271491
11123	NC_009480	CCT	2	6	372363	372368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271491
11124	NC_009480	CG	3	6	372379	372384	0 %	0 %	50 %	50 %	148271491
11125	NC_009480	CGG	2	6	372395	372400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271491
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11131	NC_009480	CGTC	2	8	372594	372601	0 %	25 %	25 %	50 %	148271491
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11134	NC_009480	GGTGCG	2	12	372661	372672	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	148271491
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11142	NC_009480	GCC	2	6	372893	372898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11143	NC_009480	CGC	2	6	372901	372906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11145	NC_009480	GCC	2	6	372965	372970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271492
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11157	NC_009480	CGC	2	6	373298	373303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11158	NC_009480	GAC	2	6	373304	373309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11159	NC_009480	TCT	2	6	373338	373343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11160	NC_009480	GGAT	2	8	373353	373360	25 %	25 %	50 %	0 %	148271493
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11219	NC_009480	CG	3	6	375276	375281	0 %	0 %	50 %	50 %	148271494
11220	NC_009480	GGC	2	6	375323	375328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271494
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11222	NC_009480	GGA	2	6	375461	375466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271494
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11224	NC_009480	GA	3	6	375574	375579	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11225	NC_009480	GC	3	6	375604	375609	0 %	0 %	50 %	50 %	148271495
11226	NC_009480	CGA	2	6	375617	375622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271495
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11230	NC_009480	TCG	2	6	375802	375807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271495
11231	NC_009480	TCG	2	6	375826	375831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271495
11232	NC_009480	AGC	2	6	375862	375867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271495
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11234	NC_009480	TCG	2	6	375892	375897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271495
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11241	NC_009480	GC	3	6	376068	376073	0 %	0 %	50 %	50 %	148271495
11242	NC_009480	CCA	2	6	376096	376101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271495
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11483	NC_009480	CGG	2	6	383332	383337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271501
11484	NC_009480	GC	3	6	383346	383351	0 %	0 %	50 %	50 %	148271501
11485	NC_009480	GC	4	8	383362	383369	0 %	0 %	50 %	50 %	148271501
11486	NC_009480	CGAC	2	8	383427	383434	25 %	0 %	25 %	50 %	148271501
11487	NC_009480	CAC	2	6	383444	383449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271501
11488	NC_009480	GCG	2	6	383459	383464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271501
11489	NC_009480	GTG	2	6	383474	383479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271501
11490	NC_009480	TCG	2	6	383505	383510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271501
11491	NC_009480	CGCC	2	8	383557	383564	0 %	0 %	25 %	75 %	148271501
11492	NC_009480	GC	5	10	383589	383598	0 %	0 %	50 %	50 %	148271501
11493	NC_009480	CGA	2	6	383626	383631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271501
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11497	NC_009480	CGC	2	6	383788	383793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271501
11498	NC_009480	CG	4	8	383814	383821	0 %	0 %	50 %	50 %	148271501
11499	NC_009480	CGT	2	6	383833	383838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271501
11500	NC_009480	ACG	2	6	383901	383906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271501

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