MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 plasmid pCM1

Total Repeats: 683

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009478	CCGC	2	8	19271	19278	0 %	0 %	25 %	75 %	148245203
502	NC_009478	ACG	2	6	19286	19291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245203
503	NC_009478	ACT	2	6	19308	19313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245203
504	NC_009478	CAG	2	6	19393	19398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245203
505	NC_009478	GCC	2	6	19415	19420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148245203
506	NC_009478	CAT	2	6	19561	19566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245203
507	NC_009478	CCGG	2	8	19595	19602	0 %	0 %	50 %	50 %	148245203
508	NC_009478	AAG	2	6	19626	19631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148245203
509	NC_009478	TGG	2	6	19643	19648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148245203
510	NC_009478	GACC	2	8	19795	19802	25 %	0 %	25 %	50 %	148245203
511	NC_009478	CG	3	6	19811	19816	0 %	0 %	50 %	50 %	148245203
512	NC_009478	CGG	2	6	19938	19943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_009478	AG	3	6	19952	19957	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
514	NC_009478	TGC	2	6	19975	19980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_009478	TC	3	6	19985	19990	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
516	NC_009478	CAG	2	6	20024	20029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_009478	GCC	2	6	20204	20209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_009478	TGC	2	6	20217	20222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_009478	TGG	2	6	20223	20228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
520	NC_009478	CTA	2	6	20243	20248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_009478	TC	3	6	20374	20379	0 %	50 %	0 %	50 %	148245204
522	NC_009478	TGC	2	6	20430	20435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245204
523	NC_009478	AGG	2	6	20603	20608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148245204
524	NC_009478	CA	3	6	20640	20645	50 %	0 %	0 %	50 %	148245204
525	NC_009478	CGA	2	6	20727	20732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_009478	CTC	2	6	20886	20891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245205
527	NC_009478	CGG	2	6	20952	20957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148245205
528	NC_009478	CGG	2	6	20964	20969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148245205
529	NC_009478	GCA	2	6	21023	21028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245205
530	NC_009478	CGG	2	6	21158	21163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148245206
531	NC_009478	ACG	2	6	21182	21187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245206
532	NC_009478	TCC	2	6	21190	21195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245206
533	NC_009478	CCG	2	6	21203	21208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148245206
534	NC_009478	ATG	2	6	21230	21235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148245206
535	NC_009478	GC	3	6	21417	21422	0 %	0 %	50 %	50 %	148245206
536	NC_009478	TGC	2	6	21488	21493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245206
537	NC_009478	GCG	2	6	21575	21580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148245206
538	NC_009478	GT	3	6	21599	21604	0 %	50 %	50 %	0 %	148245206
539	NC_009478	CTCG	2	8	21606	21613	0 %	25 %	25 %	50 %	148245206
540	NC_009478	ACC	2	6	21743	21748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148245206
541	NC_009478	TCG	2	6	21848	21853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245206
542	NC_009478	TG	3	6	21869	21874	0 %	50 %	50 %	0 %	148245206
543	NC_009478	GCTGAC	2	12	21944	21955	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148245206
544	NC_009478	GAG	2	6	21976	21981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148245206
545	NC_009478	CTC	2	6	22059	22064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_009478	GGA	2	6	22100	22105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
547	NC_009478	GTTC	2	8	22134	22141	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
548	NC_009478	ACG	2	6	22152	22157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_009478	TCGG	2	8	22271	22278	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
550	NC_009478	GCG	2	6	22319	22324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_009478	CGTT	2	8	22426	22433	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
552	NC_009478	GCGT	2	8	22463	22470	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
553	NC_009478	TGG	2	6	22560	22565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
554	NC_009478	CTG	2	6	22638	22643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_009478	ATC	2	6	22693	22698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245207
556	NC_009478	GGC	2	6	22713	22718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148245207
557	NC_009478	GAT	2	6	22764	22769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148245207
558	NC_009478	TCG	2	6	22803	22808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245207
559	NC_009478	GCG	2	6	22843	22848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148245207
560	NC_009478	GGT	2	6	22862	22867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148245207
561	NC_009478	CCG	2	6	22875	22880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148245207
562	NC_009478	CTG	2	6	22886	22891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245207
563	NC_009478	GAG	2	6	22911	22916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148245207
564	NC_009478	GAGC	2	8	23027	23034	25 %	0 %	50 %	25 %	148245207
565	NC_009478	CGG	2	6	23045	23050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148245207
566	NC_009478	GCTC	2	8	23069	23076	0 %	25 %	25 %	50 %	148245207
567	NC_009478	CGC	2	6	23110	23115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148245207
568	NC_009478	TCG	2	6	23155	23160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245207
569	NC_009478	TCG	2	6	23218	23223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245207
570	NC_009478	TCG	3	9	23253	23261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245208
571	NC_009478	GTG	2	6	23289	23294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148245208
572	NC_009478	CCA	2	6	23515	23520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148245208
573	NC_009478	CAG	2	6	23537	23542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245208
574	NC_009478	CGC	2	6	23575	23580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148245208
575	NC_009478	GTCG	2	8	23624	23631	0 %	25 %	50 %	25 %	148245208
576	NC_009478	CGC	2	6	23696	23701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148245208
577	NC_009478	CCGG	2	8	23719	23726	0 %	0 %	50 %	50 %	148245208
578	NC_009478	CGA	2	6	23848	23853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245208
579	NC_009478	ACC	2	6	23914	23919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
580	NC_009478	GGA	2	6	23949	23954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
581	NC_009478	GCG	2	6	23955	23960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_009478	TGA	2	6	24110	24115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_009478	GCCG	2	8	24141	24148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
584	NC_009478	CT	3	6	24188	24193	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
585	NC_009478	CGG	2	6	24247	24252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_009478	GCC	2	6	24253	24258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_009478	GCCG	2	8	24299	24306	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
588	NC_009478	CG	4	8	24314	24321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
589	NC_009478	CGG	2	6	24351	24356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_009478	CGC	2	6	24403	24408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
591	NC_009478	CGG	2	6	24422	24427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_009478	GCC	2	6	24492	24497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148245209
593	NC_009478	AGA	2	6	24519	24524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148245209
594	NC_009478	GTC	2	6	24535	24540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245209
595	NC_009478	TCT	2	6	24645	24650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245209
596	NC_009478	CGT	2	6	24660	24665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245209
597	NC_009478	GCC	2	6	24730	24735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_009478	CAC	2	6	24737	24742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
599	NC_009478	CCG	2	6	24775	24780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_009478	GCC	2	6	24947	24952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148245210
601	NC_009478	CTG	2	6	24974	24979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245210
602	NC_009478	CCGG	2	8	25008	25015	0 %	0 %	50 %	50 %	148245210
603	NC_009478	TGG	2	6	25022	25027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148245210
604	NC_009478	GAC	3	9	25034	25042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245210
605	NC_009478	GAG	2	6	25046	25051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148245210
606	NC_009478	C	6	6	25082	25087	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
607	NC_009478	AGA	2	6	25164	25169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_009478	CAT	2	6	25231	25236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_009478	CGAG	2	8	25311	25318	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
610	NC_009478	GC	3	6	25347	25352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
611	NC_009478	GGA	2	6	25360	25365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
612	NC_009478	TGCCGG	2	12	25386	25397	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148245211
613	NC_009478	GCCG	2	8	25432	25439	0 %	0 %	50 %	50 %	148245211
614	NC_009478	GCC	2	6	25448	25453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148245211
615	NC_009478	CT	3	6	25469	25474	0 %	50 %	0 %	50 %	148245211
616	NC_009478	CGC	2	6	25486	25491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148245211
617	NC_009478	CCG	2	6	25492	25497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148245211
618	NC_009478	TGGCCG	2	12	25527	25538	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148245211
619	NC_009478	TCG	2	6	25539	25544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245211
620	NC_009478	GCG	2	6	25553	25558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148245211
621	NC_009478	ACG	2	6	25583	25588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245211
622	NC_009478	GCG	2	6	25606	25611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148245211
623	NC_009478	GC	4	8	25657	25664	0 %	0 %	50 %	50 %	148245211
624	NC_009478	GCT	2	6	25669	25674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245211
625	NC_009478	CG	3	6	25678	25683	0 %	0 %	50 %	50 %	148245211
626	NC_009478	TCG	2	6	25701	25706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245211
627	NC_009478	CGA	2	6	25726	25731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245211
628	NC_009478	GGA	2	6	25735	25740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148245211
629	NC_009478	CGG	2	6	25773	25778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148245211
630	NC_009478	GGC	2	6	25832	25837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148245211
631	NC_009478	GCC	2	6	25896	25901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148245211
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633	NC_009478	GC	3	6	25939	25944	0 %	0 %	50 %	50 %	148245211
634	NC_009478	CG	3	6	25948	25953	0 %	0 %	50 %	50 %	148245211
635	NC_009478	CGGC	2	8	25970	25977	0 %	0 %	50 %	50 %	148245211
636	NC_009478	CGA	2	6	25980	25985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245211
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638	NC_009478	CGA	2	6	26031	26036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245211
639	NC_009478	GCG	2	6	26045	26050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148245211
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653	NC_009478	C	7	7	26521	26527	0 %	0 %	0 %	100 %	148245211
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665	NC_009478	CGG	2	6	26793	26798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148245211
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672	NC_009478	CGC	2	6	26987	26992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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675	NC_009478	GCAA	2	8	27069	27076	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
676	NC_009478	AG	4	8	27079	27086	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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681	NC_009478	GCTC	3	12	27272	27283	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
682	NC_009478	TCG	2	6	27285	27290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
683	NC_009478	CAGC	2	8	27350	27357	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

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