MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium thermocellum ATCC 27405 chromosome

Total Repeats: 82983

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27502	NC_009012	TAA	2	6	1273210	1273215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27503	NC_009012	AAGT	2	8	1273216	1273223	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27504	NC_009012	TCC	2	6	1273232	1273237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27505	NC_009012	ATC	2	6	1273287	1273292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27506	NC_009012	TGA	2	6	1273299	1273304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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27508	NC_009012	T	8	8	1273438	1273445	0 %	100 %	0 %	0 %	125973581
27509	NC_009012	T	7	7	1273493	1273499	0 %	100 %	0 %	0 %	125973581
27510	NC_009012	TCTT	2	8	1273504	1273511	0 %	75 %	0 %	25 %	125973581
27511	NC_009012	AC	3	6	1273548	1273553	50 %	0 %	0 %	50 %	125973581
27512	NC_009012	TGC	2	6	1273668	1273673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125973581
27513	NC_009012	ATAC	2	8	1273702	1273709	50 %	25 %	0 %	25 %	125973581
27514	NC_009012	TGC	2	6	1273722	1273727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125973581
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27519	NC_009012	CTGT	2	8	1273817	1273824	0 %	50 %	25 %	25 %	125973581
27520	NC_009012	A	7	7	1273850	1273856	100 %	0 %	0 %	0 %	125973581
27521	NC_009012	CAA	2	6	1273861	1273866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125973581
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27523	NC_009012	CAT	2	6	1273912	1273917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125973581
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27534	NC_009012	A	6	6	1274293	1274298	100 %	0 %	0 %	0 %	346980502
27535	NC_009012	AT	3	6	1274300	1274305	50 %	50 %	0 %	0 %	346980502
27536	NC_009012	ATA	2	6	1274385	1274390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27537	NC_009012	ATTT	2	8	1274408	1274415	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27538	NC_009012	ATC	2	6	1274432	1274437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27539	NC_009012	ATT	2	6	1274543	1274548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125973582
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27553	NC_009012	T	6	6	1275313	1275318	0 %	100 %	0 %	0 %	125973582
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27557	NC_009012	TCA	2	6	1275601	1275606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125973583
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27564	NC_009012	TC	3	6	1276040	1276045	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27565	NC_009012	CT	3	6	1276051	1276056	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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27616	NC_009012	TTA	2	6	1278554	1278559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125973585
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27982	NC_009012	CCAA	2	8	1294186	1294193	50 %	0 %	0 %	50 %	125973601
27983	NC_009012	AGA	2	6	1294257	1294262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125973601
27984	NC_009012	TAAA	2	8	1294359	1294366	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27985	NC_009012	AAT	2	6	1294402	1294407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125973602
27986	NC_009012	GTA	3	9	1294425	1294433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125973602
27987	NC_009012	CAG	2	6	1294491	1294496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125973602
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27990	NC_009012	ATA	3	9	1294659	1294667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125973602
27991	NC_009012	AC	3	6	1294695	1294700	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27992	NC_009012	CTT	2	6	1294746	1294751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125973603
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