MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium thermocellum ATCC 27405 chromosome

Total Repeats: 82983

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
26501	NC_009012	T	6	6	1229694	1229699	0 %	100 %	0 %	0 %	125973543
26502	NC_009012	CTC	2	6	1229732	1229737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125973543
26503	NC_009012	CTT	2	6	1229791	1229796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125973543
26504	NC_009012	CTTCT	2	10	1229860	1229869	0 %	60 %	0 %	40 %	125973543
26505	NC_009012	TA	3	6	1229870	1229875	50 %	50 %	0 %	0 %	125973543
26506	NC_009012	ACC	2	6	1229907	1229912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125973543
26507	NC_009012	AT	3	6	1229937	1229942	50 %	50 %	0 %	0 %	125973543
26508	NC_009012	AT	3	6	1229949	1229954	50 %	50 %	0 %	0 %	125973543
26509	NC_009012	T	6	6	1230112	1230117	0 %	100 %	0 %	0 %	125973543
26510	NC_009012	GCC	2	6	1230312	1230317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125973543
26511	NC_009012	AT	3	6	1230380	1230385	50 %	50 %	0 %	0 %	125973543
26512	NC_009012	AGGG	2	8	1230392	1230399	25 %	0 %	75 %	0 %	125973543
26513	NC_009012	AT	3	6	1230405	1230410	50 %	50 %	0 %	0 %	125973543
26514	NC_009012	TGA	2	6	1230429	1230434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125973543
26515	NC_009012	GGAGC	2	10	1230520	1230529	20 %	0 %	60 %	20 %	125973543
26516	NC_009012	TCA	2	6	1230567	1230572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125973543
26517	NC_009012	TC	3	6	1230595	1230600	0 %	50 %	0 %	50 %	125973543
26518	NC_009012	T	6	6	1230661	1230666	0 %	100 %	0 %	0 %	125973543
26519	NC_009012	CCT	2	6	1230688	1230693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125973543
26520	NC_009012	CA	4	8	1230793	1230800	50 %	0 %	0 %	50 %	125973543
26521	NC_009012	TGTCA	2	10	1230824	1230833	20 %	40 %	20 %	20 %	125973543
26522	NC_009012	TGA	2	6	1230851	1230856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125973543
26523	NC_009012	TAA	2	6	1230868	1230873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125973543
26524	NC_009012	ACTC	2	8	1230894	1230901	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26525	NC_009012	T	8	8	1230910	1230917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26526	NC_009012	TTCCTA	2	12	1230922	1230933	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26527	NC_009012	TTA	2	6	1230955	1230960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26528	NC_009012	CTT	2	6	1230976	1230981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26529	NC_009012	GGC	2	6	1231262	1231267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125973544
26530	NC_009012	AAG	2	6	1231372	1231377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125973544
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26533	NC_009012	GAT	2	6	1231557	1231562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125973544
26534	NC_009012	CCA	2	6	1231642	1231647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125973544
26535	NC_009012	T	7	7	1231664	1231670	0 %	100 %	0 %	0 %	125973544
26536	NC_009012	CAT	2	6	1231673	1231678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125973544
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26539	NC_009012	ATC	2	6	1231806	1231811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125973544
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26543	NC_009012	TTC	2	6	1232006	1232011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125973544
26544	NC_009012	TA	3	6	1232068	1232073	50 %	50 %	0 %	0 %	125973544
26545	NC_009012	TAA	2	6	1232085	1232090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26546	NC_009012	TA	3	6	1232141	1232146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26547	NC_009012	T	6	6	1232154	1232159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26548	NC_009012	ACA	2	6	1232164	1232169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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26550	NC_009012	T	7	7	1232181	1232187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26551	NC_009012	ATAA	2	8	1232199	1232206	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26552	NC_009012	TCT	2	6	1232262	1232267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26553	NC_009012	ATT	2	6	1232270	1232275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125973545
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26555	NC_009012	CTC	2	6	1232325	1232330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125973545
26556	NC_009012	TATAGT	2	12	1232429	1232440	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	125973545
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26558	NC_009012	CCT	2	6	1232576	1232581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125973545
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26568	NC_009012	A	6	6	1233034	1233039	100 %	0 %	0 %	0 %	125973545
26569	NC_009012	T	7	7	1233085	1233091	0 %	100 %	0 %	0 %	125973545
26570	NC_009012	CCT	2	6	1233103	1233108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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26596	NC_009012	AT	3	6	1234275	1234280	50 %	50 %	0 %	0 %	125973546
26597	NC_009012	TCCTG	2	10	1234354	1234363	0 %	40 %	20 %	40 %	125973546
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26604	NC_009012	ATT	2	6	1234572	1234577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125973546
26605	NC_009012	AC	4	8	1234593	1234600	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26606	NC_009012	T	7	7	1234616	1234622	0 %	100 %	0 %	0 %	125973547
26607	NC_009012	GCA	2	6	1234661	1234666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125973547
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26609	NC_009012	TA	4	8	1234781	1234788	50 %	50 %	0 %	0 %	125973547
26610	NC_009012	T	6	6	1234818	1234823	0 %	100 %	0 %	0 %	125973547
26611	NC_009012	T	6	6	1234932	1234937	0 %	100 %	0 %	0 %	125973547
26612	NC_009012	ATA	2	6	1234938	1234943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125973547
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26616	NC_009012	ATA	2	6	1235128	1235133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125973547
26617	NC_009012	TAA	2	6	1235134	1235139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125973547
26618	NC_009012	T	6	6	1235229	1235234	0 %	100 %	0 %	0 %	125973547
26619	NC_009012	TGT	2	6	1235249	1235254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125973547
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26989	NC_009012	AT	3	6	1250297	1250302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26990	NC_009012	CAG	2	6	1250320	1250325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26991	NC_009012	TAT	3	9	1250372	1250380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26992	NC_009012	A	9	9	1250463	1250471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26993	NC_009012	TACT	2	8	1250515	1250522	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26994	NC_009012	CATA	2	8	1250710	1250717	50 %	25 %	0 %	25 %	125973562
26995	NC_009012	AT	3	6	1250738	1250743	50 %	50 %	0 %	0 %	125973562
26996	NC_009012	TCTT	2	8	1250768	1250775	0 %	75 %	0 %	25 %	125973562
26997	NC_009012	GAA	2	6	1250799	1250804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125973562
26998	NC_009012	TTCA	2	8	1250851	1250858	25 %	50 %	0 %	25 %	125973562
26999	NC_009012	CAAA	2	8	1250889	1250896	75 %	0 %	0 %	25 %	125973562
27000	NC_009012	T	6	6	1250960	1250965	0 %	100 %	0 %	0 %	125973562

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