MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium thermocellum ATCC 27405 chromosome

Total Repeats: 82983

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21502	NC_009012	TAAT	2	8	1004151	1004158	50 %	50 %	0 %	0 %	125973342
21503	NC_009012	TA	3	6	1004250	1004255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21505	NC_009012	AGTCA	2	10	1004439	1004448	40 %	20 %	20 %	20 %	125973343
21506	NC_009012	TCA	2	6	1004467	1004472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125973343
21507	NC_009012	TCC	3	9	1004622	1004630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125973343
21508	NC_009012	AGG	2	6	1004697	1004702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125973343
21509	NC_009012	TGT	2	6	1004732	1004737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125973343
21510	NC_009012	TTC	2	6	1004744	1004749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125973343
21511	NC_009012	AGC	2	6	1004775	1004780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125973343
21512	NC_009012	TTG	2	6	1004794	1004799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125973343
21513	NC_009012	GTCT	2	8	1004833	1004840	0 %	50 %	25 %	25 %	125973343
21514	NC_009012	TGT	2	6	1004871	1004876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125973343
21515	NC_009012	T	7	7	1005053	1005059	0 %	100 %	0 %	0 %	125973343
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21519	NC_009012	TTC	2	6	1005223	1005228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125973343
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21521	NC_009012	TCG	2	6	1005370	1005375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125973343
21522	NC_009012	GTTC	2	8	1005377	1005384	0 %	50 %	25 %	25 %	125973343
21523	NC_009012	GCC	2	6	1005399	1005404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125973343
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21528	NC_009012	TA	3	6	1005684	1005689	50 %	50 %	0 %	0 %	125973343
21529	NC_009012	CAT	2	6	1005701	1005706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125973343
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21539	NC_009012	T	6	6	1006197	1006202	0 %	100 %	0 %	0 %	125973343
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21545	NC_009012	ATT	3	9	1006328	1006336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21546	NC_009012	TAT	2	6	1006346	1006351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21547	NC_009012	GAACT	2	10	1006397	1006406	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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21551	NC_009012	A	7	7	1006487	1006493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21552	NC_009012	TAT	2	6	1006532	1006537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21553	NC_009012	AAT	2	6	1006553	1006558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21554	NC_009012	CAATA	2	10	1006567	1006576	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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21557	NC_009012	TAT	2	6	1006608	1006613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21559	NC_009012	TAT	2	6	1006622	1006627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21602	NC_009012	TTTA	2	8	1008430	1008437	25 %	75 %	0 %	0 %	125973346
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21621	NC_009012	TCT	2	6	1009679	1009684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125973346
21622	NC_009012	CCT	2	6	1009739	1009744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125973346
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21666	NC_009012	CTCA	2	8	1011413	1011420	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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21688	NC_009012	AC	3	6	1012381	1012386	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21689	NC_009012	CCAA	2	8	1012392	1012399	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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21980	NC_009012	AATA	2	8	1024785	1024792	75 %	25 %	0 %	0 %	125973366
21981	NC_009012	CAT	2	6	1024875	1024880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125973366
21982	NC_009012	ATT	2	6	1024952	1024957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125973366
21983	NC_009012	GCG	2	6	1024958	1024963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125973366
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21985	NC_009012	TAAA	2	8	1025067	1025074	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21986	NC_009012	CATGT	2	10	1025075	1025084	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
21987	NC_009012	CAA	2	6	1025085	1025090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21988	NC_009012	CATGT	2	10	1025091	1025100	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
21989	NC_009012	TAA	2	6	1025101	1025106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21990	NC_009012	ATC	2	6	1025115	1025120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125973367
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