MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium thermocellum ATCC 27405 chromosome

Total Repeats: 82983

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_009012	ATT	2	6	887749	887754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19002	NC_009012	TCAAC	2	10	887802	887811	40 %	20 %	0 %	40 %	125973248
19003	NC_009012	T	6	6	887830	887835	0 %	100 %	0 %	0 %	125973248
19004	NC_009012	AT	3	6	887881	887886	50 %	50 %	0 %	0 %	125973248
19005	NC_009012	TTA	2	6	887905	887910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125973248
19006	NC_009012	TGATTC	2	12	887934	887945	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	125973248
19007	NC_009012	TGC	2	6	888040	888045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125973248
19008	NC_009012	T	6	6	888075	888080	0 %	100 %	0 %	0 %	125973248
19009	NC_009012	GCC	2	6	888086	888091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125973248
19010	NC_009012	TGC	2	6	888124	888129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125973248
19011	NC_009012	GTT	2	6	888161	888166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125973248
19012	NC_009012	AATT	2	8	888175	888182	50 %	50 %	0 %	0 %	125973248
19013	NC_009012	AGA	2	6	888192	888197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125973248
19014	NC_009012	GAC	2	6	888257	888262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125973248
19015	NC_009012	AAG	2	6	888269	888274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125973248
19016	NC_009012	TGA	2	6	888385	888390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125973248
19017	NC_009012	AGTAT	2	10	888416	888425	40 %	40 %	20 %	0 %	125973248
19018	NC_009012	AATG	2	8	888430	888437	50 %	25 %	25 %	0 %	125973248
19019	NC_009012	TTA	2	6	888483	888488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19020	NC_009012	ATTTTT	2	12	888521	888532	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19021	NC_009012	TTG	2	6	888533	888538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19022	NC_009012	A	6	6	888606	888611	100 %	0 %	0 %	0 %	125973249
19023	NC_009012	AAT	3	9	888709	888717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125973249
19024	NC_009012	GAAA	2	8	888721	888728	75 %	0 %	25 %	0 %	125973249
19025	NC_009012	A	6	6	888726	888731	100 %	0 %	0 %	0 %	125973249
19026	NC_009012	CAG	2	6	888785	888790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125973249
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19030	NC_009012	TTC	2	6	889042	889047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125973249
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19032	NC_009012	TGA	2	6	889116	889121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19033	NC_009012	TCT	2	6	889141	889146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19034	NC_009012	GA	3	6	889164	889169	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19035	NC_009012	GTT	2	6	889271	889276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125973250
19036	NC_009012	CTG	2	6	889327	889332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125973250
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19040	NC_009012	TA	3	6	889411	889416	50 %	50 %	0 %	0 %	125973250
19041	NC_009012	T	6	6	889417	889422	0 %	100 %	0 %	0 %	125973250
19042	NC_009012	GAT	2	6	889437	889442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125973250
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19052	NC_009012	TTA	2	6	890033	890038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125973250
19053	NC_009012	ATCAGA	2	12	890118	890129	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	125973250
19054	NC_009012	CTA	2	6	890149	890154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125973250
19055	NC_009012	TA	3	6	890296	890301	50 %	50 %	0 %	0 %	125973250
19056	NC_009012	CAG	2	6	890324	890329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125973250
19057	NC_009012	A	6	6	890370	890375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19058	NC_009012	A	7	7	890388	890394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19059	NC_009012	ATA	2	6	890410	890415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19060	NC_009012	T	7	7	890429	890435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19061	NC_009012	ATT	2	6	890436	890441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19062	NC_009012	T	6	6	890440	890445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19063	NC_009012	CTT	2	6	890485	890490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125973251
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19072	NC_009012	AAC	2	6	891012	891017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125973251
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19081	NC_009012	T	6	6	891313	891318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19082	NC_009012	A	7	7	891329	891335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19085	NC_009012	TTA	2	6	891404	891409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19086	NC_009012	TAT	2	6	891431	891436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19089	NC_009012	T	6	6	891531	891536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19090	NC_009012	A	6	6	891539	891544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19091	NC_009012	CCTC	2	8	891545	891552	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
19092	NC_009012	T	8	8	891591	891598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19095	NC_009012	ATT	2	6	891728	891733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19096	NC_009012	AT	4	8	891740	891747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19097	NC_009012	AAG	2	6	891896	891901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125973252
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19104	NC_009012	GCA	2	6	892008	892013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125973252
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19106	NC_009012	CCG	2	6	892146	892151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125973252
19107	NC_009012	ATTTG	2	10	892185	892194	20 %	60 %	20 %	0 %	125973252
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19110	NC_009012	TTTC	2	8	892319	892326	0 %	75 %	0 %	25 %	125973252
19111	NC_009012	TA	3	6	892355	892360	50 %	50 %	0 %	0 %	125973252
19112	NC_009012	T	6	6	892392	892397	0 %	100 %	0 %	0 %	125973252
19113	NC_009012	CTTT	2	8	892408	892415	0 %	75 %	0 %	25 %	125973252
19114	NC_009012	T	6	6	892430	892435	0 %	100 %	0 %	0 %	125973252
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19123	NC_009012	TATC	2	8	892729	892736	25 %	50 %	0 %	25 %	125973252
19124	NC_009012	TGCT	2	8	892746	892753	0 %	50 %	25 %	25 %	125973252
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