MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium thermocellum ATCC 27405 chromosome

Total Repeats: 82983

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_009012	GAAA	2	8	660491	660498	75 %	0 %	25 %	0 %	125973059
14002	NC_009012	TGAC	2	8	660538	660545	25 %	25 %	25 %	25 %	125973059
14003	NC_009012	AT	3	6	660578	660583	50 %	50 %	0 %	0 %	125973059
14004	NC_009012	TA	3	6	660593	660598	50 %	50 %	0 %	0 %	125973059
14005	NC_009012	AGG	2	6	660625	660630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125973059
14006	NC_009012	CAA	2	6	660865	660870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125973059
14007	NC_009012	CGC	2	6	660882	660887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125973059
14008	NC_009012	ATG	2	6	660942	660947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125973059
14009	NC_009012	CTG	2	6	660960	660965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125973059
14010	NC_009012	CTTAT	2	10	661015	661024	20 %	60 %	0 %	20 %	125973059
14011	NC_009012	T	6	6	661059	661064	0 %	100 %	0 %	0 %	125973059
14012	NC_009012	TAG	2	6	661108	661113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125973059
14013	NC_009012	CAA	2	6	661120	661125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125973059
14014	NC_009012	A	6	6	661148	661153	100 %	0 %	0 %	0 %	125973059
14015	NC_009012	T	6	6	661256	661261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14016	NC_009012	TAT	2	6	661364	661369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14017	NC_009012	GTT	2	6	661386	661391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14018	NC_009012	ATG	2	6	661449	661454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125973060
14019	NC_009012	GGA	2	6	661859	661864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125973060
14020	NC_009012	GAA	2	6	661884	661889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125973060
14021	NC_009012	TGG	2	6	661933	661938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125973060
14022	NC_009012	AGG	2	6	661939	661944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125973060
14023	NC_009012	GGA	2	6	662049	662054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125973060
14024	NC_009012	TGCCG	2	10	662072	662081	0 %	20 %	40 %	40 %	125973060
14025	NC_009012	ATACC	2	10	662156	662165	40 %	20 %	0 %	40 %	125973060
14026	NC_009012	ACAT	2	8	662178	662185	50 %	25 %	0 %	25 %	125973060
14027	NC_009012	A	6	6	662226	662231	100 %	0 %	0 %	0 %	125973060
14028	NC_009012	AAAAT	2	10	662245	662254	80 %	20 %	0 %	0 %	125973060
14029	NC_009012	TGA	2	6	662318	662323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125973060
14030	NC_009012	TCA	2	6	662330	662335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125973060
14031	NC_009012	GAAG	2	8	662441	662448	50 %	0 %	50 %	0 %	125973060
14032	NC_009012	GGA	2	6	662535	662540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125973060
14033	NC_009012	AACA	2	8	662647	662654	75 %	0 %	0 %	25 %	125973061
14034	NC_009012	CCGAAG	2	12	662674	662685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125973061
14035	NC_009012	GGTGA	2	10	662717	662726	20 %	20 %	60 %	0 %	125973061
14036	NC_009012	ATA	2	6	662771	662776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125973061
14037	NC_009012	AAG	2	6	662780	662785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125973061
14038	NC_009012	AGG	2	6	662808	662813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125973061
14039	NC_009012	GAA	2	6	662831	662836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125973061
14040	NC_009012	T	6	6	662872	662877	0 %	100 %	0 %	0 %	125973061
14041	NC_009012	GAA	2	6	662942	662947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125973061
14042	NC_009012	GTT	2	6	662957	662962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125973061
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14044	NC_009012	TTG	2	6	663042	663047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125973061
14045	NC_009012	GGAT	2	8	663063	663070	25 %	25 %	50 %	0 %	125973061
14046	NC_009012	T	6	6	663070	663075	0 %	100 %	0 %	0 %	125973061
14047	NC_009012	AGC	2	6	663146	663151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125973061
14048	NC_009012	GAAA	2	8	663238	663245	75 %	0 %	25 %	0 %	125973061
14049	NC_009012	ATT	2	6	663261	663266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125973061
14050	NC_009012	TGC	2	6	663370	663375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14051	NC_009012	GAT	2	6	663488	663493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14052	NC_009012	AT	3	6	663501	663506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14053	NC_009012	AT	3	6	663518	663523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14054	NC_009012	TCA	2	6	663605	663610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14055	NC_009012	A	6	6	663673	663678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14056	NC_009012	A	7	7	663720	663726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14057	NC_009012	AAT	2	6	663737	663742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14058	NC_009012	TAA	2	6	663747	663752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_009012	TAA	2	6	663766	663771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14060	NC_009012	GAA	2	6	663790	663795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125973062
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14062	NC_009012	AGT	2	6	663832	663837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125973062
14063	NC_009012	TGC	2	6	663865	663870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125973062
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14070	NC_009012	CTG	2	6	664254	664259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125973062
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14082	NC_009012	CAC	2	6	664985	664990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125973062
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14085	NC_009012	CGGAC	2	10	665071	665080	20 %	0 %	40 %	40 %	125973062
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14093	NC_009012	TAT	2	6	665480	665485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125973062
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14103	NC_009012	TTTTAT	2	12	666067	666078	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14104	NC_009012	TAT	2	6	666093	666098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14105	NC_009012	AAT	2	6	666110	666115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14106	NC_009012	AG	3	6	666117	666122	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14107	NC_009012	GT	3	6	666158	666163	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14108	NC_009012	TGTA	2	8	666169	666176	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14109	NC_009012	AAG	2	6	666210	666215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125973063
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14111	NC_009012	A	8	8	666295	666302	100 %	0 %	0 %	0 %	125973063
14112	NC_009012	T	7	7	666317	666323	0 %	100 %	0 %	0 %	125973063
14113	NC_009012	GGA	2	6	666340	666345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125973063
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14117	NC_009012	A	7	7	666514	666520	100 %	0 %	0 %	0 %	125973063
14118	NC_009012	GGTT	2	8	666552	666559	0 %	50 %	50 %	0 %	125973063
14119	NC_009012	TTTA	2	8	666577	666584	25 %	75 %	0 %	0 %	125973063
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14495	NC_009012	GAA	2	6	684435	684440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125973076
14496	NC_009012	ACC	2	6	684471	684476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125973076
14497	NC_009012	ACA	2	6	684488	684493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125973076
14498	NC_009012	TACAA	2	10	684531	684540	60 %	20 %	0 %	20 %	125973076
14499	NC_009012	CTG	2	6	684578	684583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125973076
14500	NC_009012	A	6	6	684591	684596	100 %	0 %	0 %	0 %	125973076

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