MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium thermocellum ATCC 27405 chromosome

Total Repeats: 82983

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10003	NC_009012	AT	3	6	466164	466169	50 %	50 %	0 %	0 %	125972892
10004	NC_009012	TCC	2	6	466282	466287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125972892
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10006	NC_009012	TCT	2	6	466355	466360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125972892
10007	NC_009012	TA	3	6	466418	466423	50 %	50 %	0 %	0 %	125972892
10008	NC_009012	ATTG	2	8	466536	466543	25 %	50 %	25 %	0 %	125972892
10009	NC_009012	AT	3	6	466708	466713	50 %	50 %	0 %	0 %	125972892
10010	NC_009012	CTT	2	6	466719	466724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125972892
10011	NC_009012	CAA	2	6	466727	466732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125972892
10012	NC_009012	T	6	6	466741	466746	0 %	100 %	0 %	0 %	125972892
10013	NC_009012	AATA	2	8	466767	466774	75 %	25 %	0 %	0 %	125972892
10014	NC_009012	GTA	2	6	466826	466831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972892
10015	NC_009012	CTTA	2	8	466845	466852	25 %	50 %	0 %	25 %	125972892
10016	NC_009012	TAT	2	6	466938	466943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125972892
10017	NC_009012	CTT	2	6	467096	467101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125972892
10018	NC_009012	GTATC	2	10	467162	467171	20 %	40 %	20 %	20 %	125972892
10019	NC_009012	TGT	2	6	467219	467224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125972892
10020	NC_009012	CTTT	2	8	467252	467259	0 %	75 %	0 %	25 %	125972892
10021	NC_009012	TTA	2	6	467267	467272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125972892
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10024	NC_009012	TAT	2	6	467309	467314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_009012	TAT	2	6	467364	467369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_009012	T	6	6	467369	467374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_009012	T	6	6	467423	467428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_009012	ATTCA	2	10	467444	467453	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10029	NC_009012	T	6	6	467463	467468	0 %	100 %	0 %	0 %	125972893
10030	NC_009012	T	6	6	467502	467507	0 %	100 %	0 %	0 %	125972893
10031	NC_009012	CCG	2	6	467557	467562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125972893
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10043	NC_009012	CTT	2	6	467962	467967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125972893
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10103	NC_009012	GAA	2	6	471268	471273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972895
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10107	NC_009012	AAAAT	2	10	471545	471554	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_009012	T	6	6	471592	471597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_009012	T	7	7	471608	471614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10111	NC_009012	T	7	7	471641	471647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_009012	TTA	2	6	471654	471659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_009012	TTTTG	2	10	471662	471671	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_009012	ATA	2	6	471692	471697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_009012	CAT	2	6	471701	471706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10496	NC_009012	GAAAG	2	10	489904	489913	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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10499	NC_009012	GAAA	2	8	490009	490016	75 %	0 %	25 %	0 %	125972915
10500	NC_009012	AAG	2	6	490074	490079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972915

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