MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium thermocellum ATCC 27405 chromosome

Total Repeats: 82983

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
74501	NC_009012	ATA	2	6	3450560	3450565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74502	NC_009012	TAT	2	6	3450585	3450590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74503	NC_009012	TAT	2	6	3450593	3450598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125975416
74504	NC_009012	T	6	6	3450631	3450636	0 %	100 %	0 %	0 %	125975416
74505	NC_009012	TAA	2	6	3450639	3450644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125975416
74506	NC_009012	CTTT	2	8	3450777	3450784	0 %	75 %	0 %	25 %	125975416
74507	NC_009012	GGA	2	6	3450797	3450802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125975416
74508	NC_009012	ATCA	2	8	3450928	3450935	50 %	25 %	0 %	25 %	125975416
74509	NC_009012	GAA	2	6	3450947	3450952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125975416
74510	NC_009012	GGA	2	6	3451025	3451030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125975416
74511	NC_009012	CTT	2	6	3451067	3451072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125975416
74512	NC_009012	CAT	2	6	3451143	3451148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125975416
74513	NC_009012	TAA	2	6	3451172	3451177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125975416
74514	NC_009012	TAAA	2	8	3451241	3451248	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74515	NC_009012	AT	4	8	3451259	3451266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74516	NC_009012	AT	4	8	3451275	3451282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74517	NC_009012	AT	4	8	3451289	3451296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74518	NC_009012	TA	3	6	3451327	3451332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74519	NC_009012	TTA	2	6	3451344	3451349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74520	NC_009012	ATATAA	2	12	3451442	3451453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74521	NC_009012	AGCATA	2	12	3451476	3451487	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74522	NC_009012	A	6	6	3451500	3451505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74523	NC_009012	ATAA	2	8	3451521	3451528	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74524	NC_009012	TAAAC	2	10	3451540	3451549	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
74525	NC_009012	GAG	2	6	3451607	3451612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74526	NC_009012	A	8	8	3451673	3451680	100 %	0 %	0 %	0 %	125975417
74527	NC_009012	AC	3	6	3451737	3451742	50 %	0 %	0 %	50 %	125975417
74528	NC_009012	GT	3	6	3451805	3451810	0 %	50 %	50 %	0 %	125975417
74529	NC_009012	GAA	2	6	3451822	3451827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125975417
74530	NC_009012	A	6	6	3451855	3451860	100 %	0 %	0 %	0 %	125975417
74531	NC_009012	GTG	2	6	3451946	3451951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125975417
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74533	NC_009012	GAA	2	6	3452149	3452154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125975417
74534	NC_009012	GGA	2	6	3452223	3452228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125975417
74535	NC_009012	AGTGAT	2	12	3452250	3452261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125975417
74536	NC_009012	GGA	2	6	3452325	3452330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125975417
74537	NC_009012	TGA	2	6	3452363	3452368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125975417
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74539	NC_009012	GAAA	2	8	3452376	3452383	75 %	0 %	25 %	0 %	125975417
74540	NC_009012	A	6	6	3452381	3452386	100 %	0 %	0 %	0 %	125975417
74541	NC_009012	GAC	2	6	3452401	3452406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125975417
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74543	NC_009012	AT	3	6	3452445	3452450	50 %	50 %	0 %	0 %	125975417
74544	NC_009012	TGT	2	6	3452623	3452628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125975418
74545	NC_009012	GCC	2	6	3452642	3452647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125975418
74546	NC_009012	TTTA	2	8	3452657	3452664	25 %	75 %	0 %	0 %	125975418
74547	NC_009012	CGG	2	6	3452793	3452798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125975418
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74551	NC_009012	GCT	2	6	3452893	3452898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125975418
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74553	NC_009012	AAT	2	6	3452998	3453003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125975418
74554	NC_009012	G	6	6	3453021	3453026	0 %	0 %	100 %	0 %	125975418
74555	NC_009012	GTT	2	6	3453088	3453093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125975418
74556	NC_009012	CGA	2	6	3453115	3453120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125975418
74557	NC_009012	GCAATG	2	12	3453125	3453136	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	125975418
74558	NC_009012	GCT	2	6	3453144	3453149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125975418
74559	NC_009012	ATGT	2	8	3453269	3453276	25 %	50 %	25 %	0 %	125975418
74560	NC_009012	ATA	2	6	3453277	3453282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125975418
74561	NC_009012	TA	3	6	3453281	3453286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74562	NC_009012	TA	3	6	3453290	3453295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74563	NC_009012	A	6	6	3453304	3453309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74564	NC_009012	TATAA	2	10	3453311	3453320	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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74582	NC_009012	AT	3	6	3454108	3454113	50 %	50 %	0 %	0 %	125975419
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74591	NC_009012	TTA	2	6	3454404	3454409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125975420
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74609	NC_009012	TGT	2	6	3455279	3455284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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74612	NC_009012	GTA	2	6	3455340	3455345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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74616	NC_009012	AT	3	6	3455459	3455464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74617	NC_009012	T	8	8	3455487	3455494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74618	NC_009012	GGA	2	6	3455503	3455508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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74981	NC_009012	GTC	2	6	3472742	3472747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125975435
74982	NC_009012	TAC	2	6	3472756	3472761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125975435
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74985	NC_009012	TTA	2	6	3472908	3472913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125975435
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74987	NC_009012	T	6	6	3473054	3473059	0 %	100 %	0 %	0 %	125975435
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