MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium thermocellum ATCC 27405 chromosome

Total Repeats: 82983

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_009012	ATA	2	6	323850	323855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125972784
7002	NC_009012	CTT	2	6	323875	323880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7003	NC_009012	T	6	6	323953	323958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_009012	TGTTT	2	10	324038	324047	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
7005	NC_009012	TGC	2	6	324067	324072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7006	NC_009012	GAA	2	6	324094	324099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_009012	AGGGG	2	10	324104	324113	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_009012	GAT	2	6	324163	324168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972785
7009	NC_009012	GAAG	2	8	324209	324216	50 %	0 %	50 %	0 %	125972785
7010	NC_009012	ACA	2	6	324297	324302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125972785
7011	NC_009012	AGT	2	6	324310	324315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972785
7012	NC_009012	TAT	2	6	324334	324339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125972785
7013	NC_009012	GAA	2	6	324366	324371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972785
7014	NC_009012	GGA	2	6	324429	324434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125972785
7015	NC_009012	AAT	2	6	324496	324501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_009012	ATA	2	6	324537	324542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7017	NC_009012	GGA	2	6	324684	324689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125972786
7018	NC_009012	TC	3	6	324719	324724	0 %	50 %	0 %	50 %	125972786
7019	NC_009012	TTA	2	6	324748	324753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125972786
7020	NC_009012	CCT	2	6	324765	324770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125972786
7021	NC_009012	TA	3	6	324885	324890	50 %	50 %	0 %	0 %	125972786
7022	NC_009012	TGGA	2	8	324926	324933	25 %	25 %	50 %	0 %	125972786
7023	NC_009012	T	6	6	325060	325065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7024	NC_009012	AT	3	6	325087	325092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7025	NC_009012	TTA	2	6	325128	325133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_009012	AATC	2	8	325144	325151	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7027	NC_009012	TG	3	6	325201	325206	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_009012	TAA	2	6	325210	325215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_009012	A	6	6	325234	325239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7030	NC_009012	AAT	2	6	325241	325246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_009012	AG	3	6	325251	325256	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_009012	AAG	2	6	325320	325325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972787
7033	NC_009012	GGA	2	6	325359	325364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125972787
7034	NC_009012	T	6	6	325369	325374	0 %	100 %	0 %	0 %	125972787
7035	NC_009012	ATG	2	6	325427	325432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972787
7036	NC_009012	GGA	2	6	325567	325572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125972787
7037	NC_009012	AGG	2	6	325776	325781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125972787
7038	NC_009012	TGT	2	6	325815	325820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125972787
7039	NC_009012	CCG	2	6	325852	325857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125972787
7040	NC_009012	GACT	2	8	325859	325866	25 %	25 %	25 %	25 %	125972787
7041	NC_009012	AAAG	2	8	325907	325914	75 %	0 %	25 %	0 %	125972787
7042	NC_009012	ATA	2	6	325921	325926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125972787
7043	NC_009012	TTA	2	6	325929	325934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125972787
7044	NC_009012	GGT	2	6	325973	325978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125972787
7045	NC_009012	AC	3	6	325985	325990	50 %	0 %	0 %	50 %	125972787
7046	NC_009012	GAC	2	6	326044	326049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125972787
7047	NC_009012	GA	3	6	326059	326064	50 %	0 %	50 %	0 %	125972787
7048	NC_009012	GCT	2	6	326092	326097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125972787
7049	NC_009012	CAGA	2	8	326102	326109	50 %	0 %	25 %	25 %	125972787
7050	NC_009012	AT	3	6	326189	326194	50 %	50 %	0 %	0 %	125972787
7051	NC_009012	AT	3	6	326219	326224	50 %	50 %	0 %	0 %	125972787
7052	NC_009012	T	6	6	326244	326249	0 %	100 %	0 %	0 %	125972787
7053	NC_009012	A	6	6	326416	326421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_009012	ATTTT	2	10	326494	326503	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_009012	T	6	6	326500	326505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7056	NC_009012	TTTCTG	2	12	326511	326522	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7057	NC_009012	TG	4	8	326521	326528	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_009012	GTT	2	6	326546	326551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7059	NC_009012	GTTT	2	8	326566	326573	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7060	NC_009012	ATT	2	6	326585	326590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7061	NC_009012	AGA	2	6	326644	326649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972788
7062	NC_009012	TATT	2	8	326666	326673	25 %	75 %	0 %	0 %	125972788
7063	NC_009012	T	7	7	326685	326691	0 %	100 %	0 %	0 %	125972788
7064	NC_009012	GT	3	6	326692	326697	0 %	50 %	50 %	0 %	125972788
7065	NC_009012	T	7	7	326765	326771	0 %	100 %	0 %	0 %	125972788
7066	NC_009012	CAA	2	6	326789	326794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125972788
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7068	NC_009012	GTTT	2	8	326983	326990	0 %	75 %	25 %	0 %	125972788
7069	NC_009012	TA	3	6	327020	327025	50 %	50 %	0 %	0 %	125972788
7070	NC_009012	ATTT	2	8	327045	327052	25 %	75 %	0 %	0 %	125972788
7071	NC_009012	ATTTT	2	10	327071	327080	20 %	80 %	0 %	0 %	125972788
7072	NC_009012	GTT	2	6	327081	327086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125972788
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7082	NC_009012	CAA	2	6	327791	327796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125972788
7083	NC_009012	A	6	6	327817	327822	100 %	0 %	0 %	0 %	125972788
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7090	NC_009012	ATA	2	6	328115	328120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7091	NC_009012	T	6	6	328121	328126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7092	NC_009012	TTA	2	6	328131	328136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7093	NC_009012	AAAT	2	8	328153	328160	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7094	NC_009012	GCT	2	6	328165	328170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7095	NC_009012	TGTT	2	8	328199	328206	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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7097	NC_009012	GAA	2	6	328284	328289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972789
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7099	NC_009012	AGT	2	6	328303	328308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972789
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7103	NC_009012	AG	3	6	328595	328600	50 %	0 %	50 %	0 %	125972789
7104	NC_009012	GAT	2	6	328749	328754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972789
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7106	NC_009012	AGGTGT	2	12	329039	329050	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	125972789
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7109	NC_009012	CTA	2	6	329170	329175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125972789
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7111	NC_009012	GGT	2	6	329216	329221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125972789
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7118	NC_009012	GAACA	2	10	329750	329759	60 %	0 %	20 %	20 %	125972789
7119	NC_009012	TA	3	6	329777	329782	50 %	50 %	0 %	0 %	125972789
7120	NC_009012	CGT	2	6	329821	329826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125972789
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7124	NC_009012	GCAGCG	2	12	330018	330029	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	125972789
7125	NC_009012	GTCA	2	8	330167	330174	25 %	25 %	25 %	25 %	125972789
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