MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium thermocellum ATCC 27405 chromosome

Total Repeats: 82983

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
73001	NC_009012	CTTAAG	2	12	3380906	3380917	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73002	NC_009012	AT	4	8	3380973	3380980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73003	NC_009012	TA	3	6	3380987	3380992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73004	NC_009012	CTTT	2	8	3381077	3381084	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
73005	NC_009012	ATGG	2	8	3381089	3381096	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
73006	NC_009012	GTT	2	6	3381124	3381129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73007	NC_009012	GCTG	2	8	3381214	3381221	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73008	NC_009012	GGC	2	6	3381235	3381240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73009	NC_009012	TTG	2	6	3381258	3381263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73010	NC_009012	CGA	2	6	3381336	3381341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73011	NC_009012	GA	3	6	3381391	3381396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73012	NC_009012	ACG	2	6	3381398	3381403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73013	NC_009012	CAAT	2	8	3381420	3381427	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73014	NC_009012	TTG	2	6	3381483	3381488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73015	NC_009012	GGTT	2	8	3381516	3381523	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73016	NC_009012	GTA	2	6	3381684	3381689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73017	NC_009012	CAG	2	6	3381729	3381734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73018	NC_009012	AAAG	2	8	3381735	3381742	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73019	NC_009012	AAT	2	6	3381781	3381786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73020	NC_009012	TAA	2	6	3381828	3381833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73021	NC_009012	TTA	2	6	3381930	3381935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73022	NC_009012	CTG	2	6	3381960	3381965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73023	NC_009012	TAT	2	6	3382054	3382059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73024	NC_009012	AGG	2	6	3382061	3382066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73025	NC_009012	TAA	2	6	3382067	3382072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73026	NC_009012	TA	3	6	3382146	3382151	50 %	50 %	0 %	0 %	346980576
73027	NC_009012	GAT	2	6	3382166	3382171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	346980576
73028	NC_009012	TAAT	2	8	3382173	3382180	50 %	50 %	0 %	0 %	346980576
73029	NC_009012	AGA	2	6	3382303	3382308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	346980576
73030	NC_009012	CA	3	6	3382328	3382333	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73031	NC_009012	T	6	6	3382352	3382357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73032	NC_009012	CAA	2	6	3382404	3382409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73033	NC_009012	AGG	2	6	3382417	3382422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73034	NC_009012	AAT	2	6	3382426	3382431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125975345
73035	NC_009012	ATT	2	6	3382499	3382504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125975345
73036	NC_009012	AAGC	2	8	3382530	3382537	50 %	0 %	25 %	25 %	125975345
73037	NC_009012	CTG	2	6	3382635	3382640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125975345
73038	NC_009012	AGA	2	6	3382648	3382653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125975345
73039	NC_009012	CTT	2	6	3382676	3382681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125975345
73040	NC_009012	TGA	3	9	3382758	3382766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125975345
73041	NC_009012	AAG	2	6	3382790	3382795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125975345
73042	NC_009012	GGA	2	6	3383055	3383060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73043	NC_009012	ATG	2	6	3383082	3383087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125975346
73044	NC_009012	GCA	2	6	3383091	3383096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125975346
73045	NC_009012	GCTCCT	2	12	3383155	3383166	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	125975346
73046	NC_009012	TA	3	6	3383209	3383214	50 %	50 %	0 %	0 %	125975346
73047	NC_009012	CTG	2	6	3383236	3383241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125975346
73048	NC_009012	TGG	2	6	3383262	3383267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125975346
73049	NC_009012	CTGG	2	8	3383318	3383325	0 %	25 %	50 %	25 %	125975346
73050	NC_009012	GAT	2	6	3383337	3383342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125975346
73051	NC_009012	TGA	2	6	3383348	3383353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125975346
73052	NC_009012	CTG	2	6	3383404	3383409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125975346
73053	NC_009012	TTA	2	6	3383619	3383624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125975346
73054	NC_009012	TAT	2	6	3383675	3383680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125975346
73055	NC_009012	AAGG	2	8	3383691	3383698	50 %	0 %	50 %	0 %	125975346
73056	NC_009012	AGA	2	6	3383756	3383761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125975346
73057	NC_009012	GCA	2	6	3383772	3383777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125975346
73058	NC_009012	TCC	2	6	3383807	3383812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125975346
73059	NC_009012	TGA	2	6	3383816	3383821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125975346
73060	NC_009012	TCC	2	6	3383870	3383875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125975346
73061	NC_009012	GAA	2	6	3383879	3383884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125975346
73062	NC_009012	GACA	2	8	3383897	3383904	50 %	0 %	25 %	25 %	125975346
73063	NC_009012	TGGT	2	8	3383973	3383980	0 %	50 %	50 %	0 %	125975346
73064	NC_009012	GGA	2	6	3383998	3384003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125975346
73065	NC_009012	AAGC	2	8	3384061	3384068	50 %	0 %	25 %	25 %	125975346
73066	NC_009012	AAGAA	2	10	3384089	3384098	80 %	0 %	20 %	0 %	125975346
73067	NC_009012	GCCAT	2	10	3384106	3384115	20 %	20 %	20 %	40 %	125975346
73068	NC_009012	GCAG	2	8	3384129	3384136	25 %	0 %	50 %	25 %	125975346
73069	NC_009012	AT	3	6	3384208	3384213	50 %	50 %	0 %	0 %	125975346
73070	NC_009012	AGC	2	6	3384321	3384326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125975346
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73072	NC_009012	GGA	2	6	3384366	3384371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125975346
73073	NC_009012	TCCG	2	8	3384533	3384540	0 %	25 %	25 %	50 %	125975346
73074	NC_009012	AAAT	2	8	3384622	3384629	75 %	25 %	0 %	0 %	125975346
73075	NC_009012	CT	3	6	3384642	3384647	0 %	50 %	0 %	50 %	125975346
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73079	NC_009012	GAAG	2	8	3384926	3384933	50 %	0 %	50 %	0 %	125975346
73080	NC_009012	TGA	2	6	3384947	3384952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125975346
73081	NC_009012	AAG	2	6	3384958	3384963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125975346
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73086	NC_009012	GAG	2	6	3385209	3385214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125975346
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73088	NC_009012	TA	4	8	3385273	3385280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73089	NC_009012	T	6	6	3385281	3385286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73090	NC_009012	A	6	6	3385304	3385309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73091	NC_009012	TGA	2	6	3385351	3385356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73092	NC_009012	GAGGG	2	10	3385357	3385366	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
73093	NC_009012	A	7	7	3385421	3385427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73094	NC_009012	A	7	7	3385468	3385474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73095	NC_009012	GGA	2	6	3385487	3385492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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73102	NC_009012	TAA	2	6	3385885	3385890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125975347
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73241	NC_009012	A	6	6	3392118	3392123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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