MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium thermocellum ATCC 27405 chromosome

Total Repeats: 82983

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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71002	NC_009012	TTA	2	6	3288369	3288374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125975269
71003	NC_009012	GAATT	2	10	3288546	3288555	40 %	40 %	20 %	0 %	125975269
71004	NC_009012	ATC	2	6	3288624	3288629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125975269
71005	NC_009012	A	6	6	3288636	3288641	100 %	0 %	0 %	0 %	125975269
71006	NC_009012	TCT	2	6	3288658	3288663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125975269
71007	NC_009012	CTTT	2	8	3288727	3288734	0 %	75 %	0 %	25 %	125975269
71008	NC_009012	AGG	2	6	3288846	3288851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125975269
71009	NC_009012	ATT	2	6	3288855	3288860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71010	NC_009012	GCT	2	6	3288886	3288891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125975270
71011	NC_009012	A	6	6	3288925	3288930	100 %	0 %	0 %	0 %	125975270
71012	NC_009012	CGG	2	6	3289033	3289038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125975270
71013	NC_009012	TTA	2	6	3289055	3289060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125975270
71014	NC_009012	ATT	2	6	3289086	3289091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125975270
71015	NC_009012	A	8	8	3289115	3289122	100 %	0 %	0 %	0 %	125975270
71016	NC_009012	ATGA	2	8	3289149	3289156	50 %	25 %	25 %	0 %	125975270
71017	NC_009012	AGA	2	6	3289256	3289261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125975270
71018	NC_009012	A	6	6	3289333	3289338	100 %	0 %	0 %	0 %	125975270
71019	NC_009012	GTT	2	6	3289382	3289387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125975270
71020	NC_009012	CGG	2	6	3289453	3289458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125975270
71021	NC_009012	TAT	2	6	3289482	3289487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125975270
71022	NC_009012	TGA	2	6	3289499	3289504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125975270
71023	NC_009012	A	6	6	3289516	3289521	100 %	0 %	0 %	0 %	125975270
71024	NC_009012	ATGAAA	2	12	3289541	3289552	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	125975271
71025	NC_009012	A	6	6	3289550	3289555	100 %	0 %	0 %	0 %	125975271
71026	NC_009012	CGGG	2	8	3289675	3289682	0 %	0 %	75 %	25 %	125975271
71027	NC_009012	GAA	2	6	3289687	3289692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125975271
71028	NC_009012	GAAA	2	8	3289744	3289751	75 %	0 %	25 %	0 %	125975271
71029	NC_009012	T	6	6	3289757	3289762	0 %	100 %	0 %	0 %	125975271
71030	NC_009012	GAA	3	9	3289763	3289771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125975271
71031	NC_009012	CGG	2	6	3289863	3289868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125975271
71032	NC_009012	CAC	2	6	3289869	3289874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125975271
71033	NC_009012	GCA	2	6	3289918	3289923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125975271
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71035	NC_009012	TG	3	6	3290158	3290163	0 %	50 %	50 %	0 %	125975271
71036	NC_009012	TTA	2	6	3290172	3290177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125975271
71037	NC_009012	TGC	2	6	3290243	3290248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125975271
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71040	NC_009012	GAA	2	6	3290408	3290413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125975271
71041	NC_009012	AT	3	6	3290427	3290432	50 %	50 %	0 %	0 %	125975271
71042	NC_009012	CCTGAC	2	12	3290441	3290452	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	125975271
71043	NC_009012	AT	3	6	3290497	3290502	50 %	50 %	0 %	0 %	125975271
71044	NC_009012	ATG	2	6	3290586	3290591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125975271
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71046	NC_009012	TTGC	2	8	3290656	3290663	0 %	50 %	25 %	25 %	125975272
71047	NC_009012	GAA	2	6	3290684	3290689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125975272
71048	NC_009012	ATC	2	6	3290756	3290761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125975272
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71050	NC_009012	AT	3	6	3290830	3290835	50 %	50 %	0 %	0 %	125975272
71051	NC_009012	GTT	2	6	3290882	3290887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125975272
71052	NC_009012	ATT	2	6	3290895	3290900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125975272
71053	NC_009012	A	7	7	3290963	3290969	100 %	0 %	0 %	0 %	125975272
71054	NC_009012	TGG	2	6	3291012	3291017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125975272
71055	NC_009012	GCA	2	6	3291067	3291072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125975272
71056	NC_009012	TTGCCA	2	12	3291078	3291089	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	125975272
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71058	NC_009012	A	6	6	3291151	3291156	100 %	0 %	0 %	0 %	125975272
71059	NC_009012	CTT	2	6	3291176	3291181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125975272
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71062	NC_009012	GCCGG	2	10	3291284	3291293	0 %	0 %	60 %	40 %	125975272
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71074	NC_009012	TA	3	6	3291606	3291611	50 %	50 %	0 %	0 %	125975273
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71083	NC_009012	TGCCAT	2	12	3291965	3291976	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	125975273
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71097	NC_009012	A	7	7	3292633	3292639	100 %	0 %	0 %	0 %	125975274
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71102	NC_009012	GTT	2	6	3292778	3292783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125975274
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71106	NC_009012	GCT	2	6	3292922	3292927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125975274
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71108	NC_009012	A	6	6	3293004	3293009	100 %	0 %	0 %	0 %	125975274
71109	NC_009012	CAA	2	6	3293042	3293047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125975274
71110	NC_009012	GAG	2	6	3293103	3293108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125975274
71111	NC_009012	GA	3	6	3293181	3293186	50 %	0 %	50 %	0 %	125975274
71112	NC_009012	TGG	2	6	3293200	3293205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125975274
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