MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium thermocellum ATCC 27405 chromosome

Total Repeats: 82983

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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70002	NC_009012	GACG	2	8	3240544	3240551	25 %	0 %	50 %	25 %	125975228
70003	NC_009012	GAA	2	6	3240591	3240596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125975228
70004	NC_009012	TAATA	2	10	3240597	3240606	60 %	40 %	0 %	0 %	125975228
70005	NC_009012	GAA	2	6	3240613	3240618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125975228
70006	NC_009012	CCG	2	6	3240679	3240684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125975228
70007	NC_009012	ATT	2	6	3240701	3240706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125975228
70008	NC_009012	ACA	2	6	3240728	3240733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70009	NC_009012	TATG	2	8	3240744	3240751	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70010	NC_009012	ATTC	2	8	3240792	3240799	25 %	50 %	0 %	25 %	125975229
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70015	NC_009012	A	6	6	3241057	3241062	100 %	0 %	0 %	0 %	125975229
70016	NC_009012	A	6	6	3241066	3241071	100 %	0 %	0 %	0 %	125975229
70017	NC_009012	ATT	2	6	3241083	3241088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125975229
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70029	NC_009012	TAA	2	6	3241692	3241697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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70032	NC_009012	TA	3	6	3241720	3241725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70033	NC_009012	GTA	2	6	3241788	3241793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70034	NC_009012	GAA	2	6	3241805	3241810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125975230
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70038	NC_009012	GCAT	2	8	3241980	3241987	25 %	25 %	25 %	25 %	125975230
70039	NC_009012	AT	3	6	3242010	3242015	50 %	50 %	0 %	0 %	125975230
70040	NC_009012	CAA	2	6	3242017	3242022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125975230
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70044	NC_009012	AG	3	6	3242222	3242227	50 %	0 %	50 %	0 %	125975230
70045	NC_009012	TAGA	2	8	3242254	3242261	50 %	25 %	25 %	0 %	125975230
70046	NC_009012	TATAT	2	10	3242271	3242280	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70047	NC_009012	TTG	2	6	3242325	3242330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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70051	NC_009012	ATA	2	6	3242762	3242767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70052	NC_009012	ATT	2	6	3242775	3242780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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70056	NC_009012	GCT	2	6	3242865	3242870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346980570
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70065	NC_009012	T	6	6	3243139	3243144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70066	NC_009012	A	6	6	3243206	3243211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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70070	NC_009012	T	6	6	3243306	3243311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70071	NC_009012	TAA	2	6	3243345	3243350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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70076	NC_009012	GGTT	2	8	3243538	3243545	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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70119	NC_009012	A	6	6	3245642	3245647	100 %	0 %	0 %	0 %	125975232
70120	NC_009012	TCAA	2	8	3245766	3245773	50 %	25 %	0 %	25 %	125975232
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70230	NC_009012	TA	3	6	3250998	3251003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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70233	NC_009012	ATC	2	6	3251202	3251207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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70237	NC_009012	TTGTTT	2	12	3251317	3251328	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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70240	NC_009012	T	7	7	3251451	3251457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70241	NC_009012	A	6	6	3251515	3251520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70242	NC_009012	AT	3	6	3251527	3251532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70243	NC_009012	ATA	2	6	3251534	3251539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70244	NC_009012	AT	3	6	3251560	3251565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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70246	NC_009012	TTA	2	6	3251650	3251655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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70487	NC_009012	AAAT	2	8	3263677	3263684	75 %	25 %	0 %	0 %	125975246
70488	NC_009012	A	6	6	3263734	3263739	100 %	0 %	0 %	0 %	125975246
70489	NC_009012	GCT	2	6	3263744	3263749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125975246
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