MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Ruthia magnifica str. Cm (Calyptogena magnifica)

Total Repeats: 27349

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_008610	AAG	2	6	360944	360949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8502	NC_008610	ATTG	2	8	361035	361042	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8503	NC_008610	GTA	2	6	361078	361083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8504	NC_008610	GTT	2	6	361227	361232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118602368
8505	NC_008610	TGT	2	6	361322	361327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118602368
8506	NC_008610	TGG	2	6	361352	361357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118602368
8507	NC_008610	TGG	2	6	361397	361402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118602368
8508	NC_008610	TAT	2	6	361407	361412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602368
8509	NC_008610	CTG	2	6	361460	361465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118602368
8510	NC_008610	ATA	2	6	361481	361486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602368
8511	NC_008610	GTT	2	6	361503	361508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118602368
8512	NC_008610	TAA	2	6	361590	361595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602368
8513	NC_008610	T	6	6	361616	361621	0 %	100 %	0 %	0 %	118602368
8514	NC_008610	CTTT	2	8	361640	361647	0 %	75 %	0 %	25 %	118602368
8515	NC_008610	TTA	2	6	361682	361687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602368
8516	NC_008610	TTA	2	6	361745	361750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602368
8517	NC_008610	TTG	2	6	361754	361759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118602368
8518	NC_008610	GGT	2	6	361774	361779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118602368
8519	NC_008610	TATGG	2	10	361812	361821	20 %	40 %	40 %	0 %	118602368
8520	NC_008610	TTG	2	6	361832	361837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118602368
8521	NC_008610	T	6	6	361849	361854	0 %	100 %	0 %	0 %	118602368
8522	NC_008610	CAT	2	6	361868	361873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118602368
8523	NC_008610	TGT	2	6	361884	361889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118602368
8524	NC_008610	GTCA	2	8	361936	361943	25 %	25 %	25 %	25 %	118602368
8525	NC_008610	GGT	2	6	361966	361971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118602368
8526	NC_008610	TTG	2	6	361979	361984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118602368
8527	NC_008610	TAT	2	6	361992	361997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602368
8528	NC_008610	ATT	2	6	362002	362007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602368
8529	NC_008610	AGTT	2	8	362013	362020	25 %	50 %	25 %	0 %	118602368
8530	NC_008610	ACC	2	6	362040	362045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118602368
8531	NC_008610	ATG	2	6	362056	362061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602368
8532	NC_008610	TGC	2	6	362085	362090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118602368
8533	NC_008610	TTATT	2	10	362091	362100	20 %	80 %	0 %	0 %	118602368
8534	NC_008610	CAA	2	6	362122	362127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118602368
8535	NC_008610	A	6	6	362146	362151	100 %	0 %	0 %	0 %	118602368
8536	NC_008610	TGG	2	6	362208	362213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118602368
8537	NC_008610	TGG	2	6	362291	362296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118602368
8538	NC_008610	ATA	2	6	362318	362323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602368
8539	NC_008610	GTT	2	6	362379	362384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118602368
8540	NC_008610	GTGG	2	8	362404	362411	0 %	25 %	75 %	0 %	118602368
8541	NC_008610	CTG	2	6	362432	362437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118602368
8542	NC_008610	TTA	2	6	362545	362550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602368
8543	NC_008610	TTA	2	6	362591	362596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602369
8544	NC_008610	ATG	2	6	362634	362639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602369
8545	NC_008610	TTA	2	6	362655	362660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602369
8546	NC_008610	TG	3	6	362711	362716	0 %	50 %	50 %	0 %	118602369
8547	NC_008610	AT	3	6	362727	362732	50 %	50 %	0 %	0 %	118602369
8548	NC_008610	TAA	2	6	362743	362748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602369
8549	NC_008610	GTTG	2	8	362829	362836	0 %	50 %	50 %	0 %	118602369
8550	NC_008610	CAAA	2	8	362866	362873	75 %	0 %	0 %	25 %	118602369
8551	NC_008610	ATT	2	6	362882	362887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602369
8552	NC_008610	AGG	2	6	362941	362946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118602369
8553	NC_008610	TTA	2	6	362949	362954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602369
8554	NC_008610	CAA	2	6	363008	363013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118602369
8555	NC_008610	AAG	2	6	363045	363050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118602369
8556	NC_008610	TTG	2	6	363135	363140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118602369
8557	NC_008610	AAT	2	6	363163	363168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602369
8558	NC_008610	TCA	2	6	363199	363204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118602369
8559	NC_008610	ATT	2	6	363363	363368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602370
8560	NC_008610	T	6	6	363419	363424	0 %	100 %	0 %	0 %	118602370
8561	NC_008610	TAC	2	6	363445	363450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118602370
8562	NC_008610	ATT	2	6	363453	363458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602370
8563	NC_008610	AGATA	2	10	363460	363469	60 %	20 %	20 %	0 %	118602370
8564	NC_008610	CAA	2	6	363537	363542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118602370
8565	NC_008610	GTTG	2	8	363612	363619	0 %	50 %	50 %	0 %	118602370
8566	NC_008610	CA	3	6	363768	363773	50 %	0 %	0 %	50 %	118602370
8567	NC_008610	GAA	2	6	363836	363841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118602370
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8570	NC_008610	TAA	2	6	363939	363944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602370
8571	NC_008610	CAA	3	9	363965	363973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118602370
8572	NC_008610	CCTGAA	2	12	364040	364051	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118602370
8573	NC_008610	CTG	2	6	364140	364145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118602370
8574	NC_008610	AAAT	2	8	364258	364265	75 %	25 %	0 %	0 %	118602370
8575	NC_008610	GTG	2	6	364280	364285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118602370
8576	NC_008610	TAT	2	6	364333	364338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602370
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8578	NC_008610	ATT	2	6	364418	364423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602370
8579	NC_008610	ATTA	2	8	364493	364500	50 %	50 %	0 %	0 %	118602370
8580	NC_008610	TCG	2	6	364554	364559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118602371
8581	NC_008610	ATA	2	6	364601	364606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602371
8582	NC_008610	ATT	2	6	364708	364713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602371
8583	NC_008610	AAGC	2	8	364720	364727	50 %	0 %	25 %	25 %	118602371
8584	NC_008610	TTA	2	6	364780	364785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602371
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8586	NC_008610	AAT	2	6	364855	364860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602371
8587	NC_008610	TGAGGA	2	12	364938	364949	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	118602371
8588	NC_008610	A	7	7	364953	364959	100 %	0 %	0 %	0 %	118602371
8589	NC_008610	TGA	2	6	364980	364985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602371
8590	NC_008610	ATA	2	6	365008	365013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602371
8591	NC_008610	TGG	2	6	365016	365021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118602371
8592	NC_008610	GAA	2	6	365066	365071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118602371
8593	NC_008610	GAA	2	6	365095	365100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118602371
8594	NC_008610	TAA	2	6	365157	365162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602371
8595	NC_008610	ATT	2	6	365183	365188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602371
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8597	NC_008610	T	6	6	365332	365337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8598	NC_008610	AAACA	2	10	365369	365378	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8599	NC_008610	TTA	2	6	365420	365425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8600	NC_008610	A	7	7	365433	365439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8601	NC_008610	ATTAA	2	10	365454	365463	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8602	NC_008610	A	6	6	365491	365496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8603	NC_008610	TGT	2	6	365497	365502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8604	NC_008610	A	6	6	365534	365539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8605	NC_008610	T	7	7	365576	365582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8606	NC_008610	A	6	6	365679	365684	100 %	0 %	0 %	0 %	118602372
8607	NC_008610	ATG	2	6	365692	365697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602372
8608	NC_008610	CAG	2	6	365718	365723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118602372
8609	NC_008610	GTTT	2	8	365741	365748	0 %	75 %	25 %	0 %	118602372
8610	NC_008610	TCC	2	6	365759	365764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118602372
8611	NC_008610	TCAAA	2	10	365827	365836	60 %	20 %	0 %	20 %	118602372
8612	NC_008610	A	8	8	365911	365918	100 %	0 %	0 %	0 %	118602372
8613	NC_008610	CAA	2	6	365985	365990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118602372
8614	NC_008610	CAAA	2	8	365996	366003	75 %	0 %	0 %	25 %	118602372
8615	NC_008610	AATC	2	8	366204	366211	50 %	25 %	0 %	25 %	118602372
8616	NC_008610	TGA	2	6	366242	366247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602372
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8619	NC_008610	TTGC	2	8	366384	366391	0 %	50 %	25 %	25 %	118602372
8620	NC_008610	TAT	2	6	366518	366523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602372
8621	NC_008610	GTGCA	2	10	366559	366568	20 %	20 %	40 %	20 %	118602372
8622	NC_008610	AAG	2	6	366589	366594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118602372
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8624	NC_008610	GT	3	6	366652	366657	0 %	50 %	50 %	0 %	118602372
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8995	NC_008610	T	6	6	381601	381606	0 %	100 %	0 %	0 %	118602385
8996	NC_008610	T	6	6	381637	381642	0 %	100 %	0 %	0 %	118602385
8997	NC_008610	TCA	2	6	381644	381649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118602385
8998	NC_008610	TCA	3	9	381701	381709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118602385
8999	NC_008610	T	6	6	381719	381724	0 %	100 %	0 %	0 %	118602385
9000	NC_008610	TTC	2	6	381727	381732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118602385

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