MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium perfringens ATCC 13124 chromosome

Total Repeats: 91288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008261	TCA	2	6	130225	130230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110800767
3502	NC_008261	AAT	2	6	130234	130239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110800767
3503	NC_008261	AAATAA	2	12	130242	130253	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	110800767
3504	NC_008261	TAA	2	6	130266	130271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110800767
3505	NC_008261	GTAAT	2	10	130313	130322	40 %	40 %	20 %	0 %	110800767
3506	NC_008261	GAA	2	6	130345	130350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110800767
3507	NC_008261	TGG	2	6	130365	130370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110800767
3508	NC_008261	TA	3	6	130429	130434	50 %	50 %	0 %	0 %	110800767
3509	NC_008261	GAA	2	6	130446	130451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110800767
3510	NC_008261	ATG	2	6	130463	130468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110800767
3511	NC_008261	AG	3	6	130477	130482	50 %	0 %	50 %	0 %	110800767
3512	NC_008261	TGA	2	6	130515	130520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110800767
3513	NC_008261	TAT	2	6	130552	130557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_008261	A	7	7	130584	130590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_008261	TTA	2	6	130596	130601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_008261	T	8	8	130605	130612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_008261	ATT	2	6	130613	130618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_008261	ACA	2	6	130621	130626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_008261	TA	3	6	130649	130654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_008261	GAT	2	6	130731	130736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110800124
3521	NC_008261	ATC	2	6	130838	130843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110800124
3522	NC_008261	AGA	2	6	130865	130870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110800124
3523	NC_008261	TGA	2	6	130886	130891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110800124
3524	NC_008261	AAT	2	6	130897	130902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110800124
3525	NC_008261	TAA	2	6	130904	130909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_008261	GTA	2	6	130937	130942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_008261	A	7	7	130946	130952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_008261	AG	3	6	130996	131001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_008261	AGA	2	6	131123	131128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_008261	AGA	2	6	131135	131140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_008261	ATA	2	6	131155	131160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_008261	AAAAG	2	10	131172	131181	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_008261	GGA	2	6	131236	131241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110798567
3534	NC_008261	GAA	2	6	131290	131295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110798567
3535	NC_008261	A	6	6	131312	131317	100 %	0 %	0 %	0 %	110798567
3536	NC_008261	AT	3	6	131330	131335	50 %	50 %	0 %	0 %	110798567
3537	NC_008261	G	6	6	131346	131351	0 %	0 %	100 %	0 %	110798567
3538	NC_008261	TAG	2	6	131381	131386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110798567
3539	NC_008261	ACA	2	6	131392	131397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110798567
3540	NC_008261	AAT	2	6	131430	131435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_008261	TTA	2	6	131436	131441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_008261	TAAT	2	8	131492	131499	50 %	50 %	0 %	0 %	110799774
3543	NC_008261	TA	3	6	131527	131532	50 %	50 %	0 %	0 %	110799774
3544	NC_008261	ATC	2	6	131632	131637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110799774
3545	NC_008261	ACA	3	9	131642	131650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110799774
3546	NC_008261	T	6	6	131657	131662	0 %	100 %	0 %	0 %	110799774
3547	NC_008261	T	6	6	131694	131699	0 %	100 %	0 %	0 %	110799774
3548	NC_008261	AT	3	6	131724	131729	50 %	50 %	0 %	0 %	110799774
3549	NC_008261	CAC	2	6	131772	131777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110799774
3550	NC_008261	ATT	2	6	131830	131835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110799774
3551	NC_008261	TTCT	2	8	131853	131860	0 %	75 %	0 %	25 %	110799774
3552	NC_008261	GCT	2	6	131871	131876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110799774
3553	NC_008261	AAG	2	6	131923	131928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110799774
3554	NC_008261	T	7	7	131929	131935	0 %	100 %	0 %	0 %	110799774
3555	NC_008261	TTC	2	6	131938	131943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110799774
3556	NC_008261	T	6	6	132021	132026	0 %	100 %	0 %	0 %	110799774
3557	NC_008261	TTA	2	6	132104	132109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110799774
3558	NC_008261	TTA	2	6	132113	132118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110799774
3559	NC_008261	T	8	8	132149	132156	0 %	100 %	0 %	0 %	110799774
3560	NC_008261	ATTTT	2	10	132185	132194	20 %	80 %	0 %	0 %	110799774
3561	NC_008261	TTTC	2	8	132195	132202	0 %	75 %	0 %	25 %	110799774
3562	NC_008261	T	7	7	132233	132239	0 %	100 %	0 %	0 %	110799774
3563	NC_008261	TAT	3	9	132243	132251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110799774
3564	NC_008261	ATT	2	6	132256	132261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110799774
3565	NC_008261	T	7	7	132269	132275	0 %	100 %	0 %	0 %	110799774
3566	NC_008261	ATT	2	6	132283	132288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110799774
3567	NC_008261	ATT	2	6	132301	132306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110799774
3568	NC_008261	TTA	2	6	132323	132328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110799774
3569	NC_008261	AGA	2	6	132373	132378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_008261	AAT	2	6	132379	132384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_008261	T	6	6	132409	132414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_008261	ATC	2	6	132421	132426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_008261	T	6	6	132467	132472	0 %	100 %	0 %	0 %	110800644
3574	NC_008261	TCA	2	6	132497	132502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110800644
3575	NC_008261	GAT	2	6	132522	132527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110800644
3576	NC_008261	ATTTC	2	10	132596	132605	20 %	60 %	0 %	20 %	110800644
3577	NC_008261	TAT	2	6	132627	132632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110800644
3578	NC_008261	ATAA	2	8	132654	132661	75 %	25 %	0 %	0 %	110800644
3579	NC_008261	GAA	2	6	132662	132667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110800644
3580	NC_008261	AT	3	6	132703	132708	50 %	50 %	0 %	0 %	110800644
3581	NC_008261	TA	3	6	132747	132752	50 %	50 %	0 %	0 %	110800644
3582	NC_008261	GAA	2	6	132776	132781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110800644
3583	NC_008261	T	7	7	132800	132806	0 %	100 %	0 %	0 %	110800644
3584	NC_008261	ATC	2	6	132811	132816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110800644
3585	NC_008261	CTAAAT	2	12	132858	132869	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	110800644
3586	NC_008261	CAGT	2	8	132878	132885	25 %	25 %	25 %	25 %	110800644
3587	NC_008261	ATTTTT	2	12	132889	132900	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	110800644
3588	NC_008261	TTTA	2	8	132916	132923	25 %	75 %	0 %	0 %	110800644
3589	NC_008261	GAA	2	6	132980	132985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110800644
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3591	NC_008261	TAA	2	6	133033	133038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110800644
3592	NC_008261	ATC	2	6	133039	133044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110800644
3593	NC_008261	TAA	2	6	133073	133078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110800644
3594	NC_008261	TGA	2	6	133096	133101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110800644
3595	NC_008261	TA	3	6	133131	133136	50 %	50 %	0 %	0 %	110800644
3596	NC_008261	A	6	6	133151	133156	100 %	0 %	0 %	0 %	110800644
3597	NC_008261	TAT	2	6	133171	133176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110800644
3598	NC_008261	CTA	2	6	133185	133190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110800644
3599	NC_008261	TTA	2	6	133203	133208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110800644
3600	NC_008261	T	8	8	133214	133221	0 %	100 %	0 %	0 %	110800644
3601	NC_008261	TCA	2	6	133268	133273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110800644
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3604	NC_008261	TAT	2	6	133326	133331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110800644
3605	NC_008261	ATT	2	6	133360	133365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110800644
3606	NC_008261	T	7	7	133399	133405	0 %	100 %	0 %	0 %	110800644
3607	NC_008261	ATT	2	6	133441	133446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110800644
3608	NC_008261	T	6	6	133465	133470	0 %	100 %	0 %	0 %	110800644
3609	NC_008261	TCT	2	6	133481	133486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110800644
3610	NC_008261	CAC	2	6	133533	133538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110800644
3611	NC_008261	TTA	2	6	133571	133576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110800644
3612	NC_008261	T	6	6	133653	133658	0 %	100 %	0 %	0 %	110799338
3613	NC_008261	ATT	2	6	133758	133763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110799338
3614	NC_008261	CTT	2	6	133836	133841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110799338
3615	NC_008261	TA	3	6	133884	133889	50 %	50 %	0 %	0 %	110799338
3616	NC_008261	T	6	6	133959	133964	0 %	100 %	0 %	0 %	110799338
3617	NC_008261	TTTATA	2	12	133999	134010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110799338
3618	NC_008261	GAA	2	6	134017	134022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110799338
3619	NC_008261	CAT	2	6	134027	134032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110799338
3620	NC_008261	TTA	2	6	134042	134047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110799338
3621	NC_008261	T	7	7	134048	134054	0 %	100 %	0 %	0 %	110799338
3622	NC_008261	ATAA	2	8	134076	134083	75 %	25 %	0 %	0 %	110799338
3623	NC_008261	TAT	2	6	134144	134149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110799338
3624	NC_008261	TAA	2	6	134195	134200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110799338
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