MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406 chromosome

Total Repeats: 99689

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008255	AGC	2	6	59	64	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008255	TTTC	2	8	80	87	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_008255	TAG	2	6	94	99	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008255	ATT	2	6	124	129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008255	GCA	2	6	139	144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008255	TTG	2	6	165	170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008255	TGA	2	6	199	204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636428
8	NC_008255	GAA	2	6	221	226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636428
9	NC_008255	A	6	6	251	256	100 %	0 %	0 %	0 %	110636428
10	NC_008255	A	7	7	266	272	100 %	0 %	0 %	0 %	110636428
11	NC_008255	ACC	2	6	278	283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110636428
12	NC_008255	CAT	2	6	289	294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636428
13	NC_008255	T	7	7	301	307	0 %	100 %	0 %	0 %	110636428
14	NC_008255	GAAA	2	8	316	323	75 %	0 %	25 %	0 %	110636428
15	NC_008255	GCA	2	6	395	400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636428
16	NC_008255	ATT	2	6	405	410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636428
17	NC_008255	GCT	2	6	451	456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636428
18	NC_008255	CTT	2	6	489	494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110636428
19	NC_008255	TCA	2	6	517	522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636428
20	NC_008255	T	7	7	528	534	0 %	100 %	0 %	0 %	110636428
21	NC_008255	TA	3	6	551	556	50 %	50 %	0 %	0 %	110636428
22	NC_008255	GATG	2	8	628	635	25 %	25 %	50 %	0 %	110636428
23	NC_008255	AAC	2	6	716	721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636428
24	NC_008255	TTG	2	6	732	737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636428
25	NC_008255	TAT	2	6	797	802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636428
26	NC_008255	TG	4	8	1046	1053	0 %	50 %	50 %	0 %	110636429
27	NC_008255	CGG	2	6	1061	1066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110636429
28	NC_008255	A	8	8	1087	1094	100 %	0 %	0 %	0 %	110636429
29	NC_008255	TGT	2	6	1134	1139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636429
30	NC_008255	A	8	8	1164	1171	100 %	0 %	0 %	0 %	110636429
31	NC_008255	GAA	2	6	1202	1207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636429
32	NC_008255	A	7	7	1232	1238	100 %	0 %	0 %	0 %	110636429
33	NC_008255	GAA	2	6	1246	1251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636429
34	NC_008255	CTG	2	6	1253	1258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636429
35	NC_008255	GAA	2	6	1318	1323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636429
36	NC_008255	ATT	2	6	1339	1344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636429
37	NC_008255	GTTT	2	8	1394	1401	0 %	75 %	25 %	0 %	110636429
38	NC_008255	ATTTC	2	10	1487	1496	20 %	60 %	0 %	20 %	110636429
39	NC_008255	GCCG	2	8	1506	1513	0 %	0 %	50 %	50 %	110636429
40	NC_008255	GGA	2	6	1534	1539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110636429
41	NC_008255	T	6	6	1558	1563	0 %	100 %	0 %	0 %	110636429
42	NC_008255	TGC	2	6	1580	1585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636429
43	NC_008255	TCC	2	6	1593	1598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110636429
44	NC_008255	TG	3	6	1632	1637	0 %	50 %	50 %	0 %	110636429
45	NC_008255	TTA	2	6	1661	1666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636429
46	NC_008255	TAA	2	6	1682	1687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636429
47	NC_008255	CAA	2	6	1709	1714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636429
48	NC_008255	T	6	6	1808	1813	0 %	100 %	0 %	0 %	110636429
49	NC_008255	AATT	2	8	1891	1898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008255	T	6	6	1904	1909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008255	TA	3	6	1932	1937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008255	GAT	2	6	1982	1987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636430
53	NC_008255	AAG	2	6	2022	2027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636430
54	NC_008255	T	6	6	2039	2044	0 %	100 %	0 %	0 %	110636430
55	NC_008255	CAT	2	6	2065	2070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636430
56	NC_008255	CA	3	6	2106	2111	50 %	0 %	0 %	50 %	110636430
57	NC_008255	AGC	2	6	2133	2138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636430
58	NC_008255	GAA	2	6	2201	2206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636430
59	NC_008255	TGC	2	6	2265	2270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636430
60	NC_008255	CAG	2	6	2288	2293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636430
61	NC_008255	GAT	2	6	2294	2299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636430
62	NC_008255	AATTG	2	10	2311	2320	40 %	40 %	20 %	0 %	110636430
63	NC_008255	GAA	2	6	2405	2410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636430
64	NC_008255	TCAA	2	8	2411	2418	50 %	25 %	0 %	25 %	110636430
65	NC_008255	AGG	2	6	2427	2432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110636430
66	NC_008255	AG	3	6	2509	2514	50 %	0 %	50 %	0 %	110636430
67	NC_008255	CTT	2	6	2521	2526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110636430
68	NC_008255	CAAG	2	8	2593	2600	50 %	0 %	25 %	25 %	110636430
69	NC_008255	ACA	2	6	2673	2678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636430
70	NC_008255	TTC	2	6	2729	2734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110636430
71	NC_008255	T	6	6	2769	2774	0 %	100 %	0 %	0 %	110636430
72	NC_008255	ACA	2	6	2775	2780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636430
73	NC_008255	CATT	2	8	2923	2930	25 %	50 %	0 %	25 %	110636430
74	NC_008255	CAT	2	6	3013	3018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636430
75	NC_008255	GAA	2	6	3038	3043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636430
76	NC_008255	GTG	2	6	3108	3113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110636430
77	NC_008255	TGA	2	6	3151	3156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636430
78	NC_008255	TAT	2	6	3179	3184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636430
79	NC_008255	CAG	2	6	3207	3212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636430
80	NC_008255	GTT	2	6	3280	3285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636430
81	NC_008255	ATT	2	6	3319	3324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636430
82	NC_008255	AAAT	2	8	3346	3353	75 %	25 %	0 %	0 %	110636430
83	NC_008255	GA	3	6	3390	3395	50 %	0 %	50 %	0 %	110636431
84	NC_008255	AGA	2	6	3461	3466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636431
85	NC_008255	TTGG	2	8	3508	3515	0 %	50 %	50 %	0 %	110636431
86	NC_008255	TA	3	6	3559	3564	50 %	50 %	0 %	0 %	110636431
87	NC_008255	CAG	2	6	3568	3573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636431
88	NC_008255	AGG	2	6	3590	3595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110636431
89	NC_008255	TGA	2	6	3632	3637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636431
90	NC_008255	TAT	2	6	3757	3762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636431
91	NC_008255	A	6	6	3787	3792	100 %	0 %	0 %	0 %	110636431
92	NC_008255	TGA	2	6	3820	3825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636431
93	NC_008255	GTTC	2	8	3912	3919	0 %	50 %	25 %	25 %	110636431
94	NC_008255	TGG	2	6	3925	3930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110636431
95	NC_008255	AGTGC	2	10	3942	3951	20 %	20 %	40 %	20 %	110636431
96	NC_008255	AGAA	2	8	3982	3989	75 %	0 %	25 %	0 %	110636431
97	NC_008255	CAG	2	6	3990	3995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636431
98	NC_008255	T	6	6	3999	4004	0 %	100 %	0 %	0 %	110636431
99	NC_008255	TCA	2	6	4103	4108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636431
100	NC_008255	TGC	2	6	4157	4162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636432
101	NC_008255	TTC	2	6	4282	4287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110636432
102	NC_008255	TGC	2	6	4307	4312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636432
103	NC_008255	GCT	2	6	4349	4354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636432
104	NC_008255	AT	3	6	4415	4420	50 %	50 %	0 %	0 %	110636432
105	NC_008255	GGC	2	6	4521	4526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110636432
106	NC_008255	ATT	2	6	4603	4608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636432
107	NC_008255	TACA	2	8	4619	4626	50 %	25 %	0 %	25 %	110636432
108	NC_008255	AGG	2	6	4634	4639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110636432
109	NC_008255	ATT	2	6	4675	4680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636432
110	NC_008255	A	6	6	4703	4708	100 %	0 %	0 %	0 %	110636432
111	NC_008255	GTA	2	6	4758	4763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636432
112	NC_008255	TTC	2	6	4767	4772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110636432
113	NC_008255	A	6	6	4779	4784	100 %	0 %	0 %	0 %	110636432
114	NC_008255	GCA	2	6	4785	4790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636432
115	NC_008255	AC	3	6	4796	4801	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_008255	TA	3	6	4847	4852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008255	GCAA	2	8	4858	4865	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_008255	A	7	7	4917	4923	100 %	0 %	0 %	0 %	110636433
119	NC_008255	AGGA	2	8	4946	4953	50 %	0 %	50 %	0 %	110636433
120	NC_008255	AGA	2	6	5064	5069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636433
121	NC_008255	TTCCT	2	10	5075	5084	0 %	60 %	0 %	40 %	110636433
122	NC_008255	TGC	2	6	5097	5102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636433
123	NC_008255	ATT	2	6	5174	5179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636433
124	NC_008255	GAAG	2	8	5214	5221	50 %	0 %	50 %	0 %	110636433
125	NC_008255	CGG	2	6	5250	5255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110636433
126	NC_008255	GAA	2	6	5347	5352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636433
127	NC_008255	TA	3	6	5486	5491	50 %	50 %	0 %	0 %	110636433
128	NC_008255	GAA	2	6	5497	5502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636433
129	NC_008255	A	6	6	5515	5520	100 %	0 %	0 %	0 %	110636433
130	NC_008255	TGA	2	6	5543	5548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636433
131	NC_008255	GCAG	2	8	5571	5578	25 %	0 %	50 %	25 %	110636433
132	NC_008255	A	6	6	5609	5614	100 %	0 %	0 %	0 %	110636433
133	NC_008255	TAAAA	2	10	5627	5636	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008255	TGT	2	6	5673	5678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008255	ACC	2	6	5747	5752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110636434
136	NC_008255	CAC	2	6	5782	5787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110636434
137	NC_008255	CAG	2	6	5791	5796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636434
138	NC_008255	AGT	2	6	5798	5803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636434
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270	NC_008255	CTT	2	6	10969	10974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110636439
271	NC_008255	CT	3	6	11024	11029	0 %	50 %	0 %	50 %	110636439
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401	NC_008255	AT	3	6	17175	17180	50 %	50 %	0 %	0 %	110636442
402	NC_008255	CATG	2	8	17182	17189	25 %	25 %	25 %	25 %	110636442
403	NC_008255	T	6	6	17230	17235	0 %	100 %	0 %	0 %	110636442
404	NC_008255	A	6	6	17267	17272	100 %	0 %	0 %	0 %	110636442
405	NC_008255	ATA	2	6	17436	17441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636442
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409	NC_008255	GGT	2	6	17515	17520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110636442
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414	NC_008255	TAG	2	6	17810	17815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636442
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430	NC_008255	T	6	6	18509	18514	0 %	100 %	0 %	0 %	110636443
431	NC_008255	GCC	2	6	18517	18522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110636443
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437	NC_008255	TAAAT	2	10	18775	18784	60 %	40 %	0 %	0 %	110636444
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452	NC_008255	A	6	6	19501	19506	100 %	0 %	0 %	0 %	110636445
453	NC_008255	CAG	2	6	19536	19541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636445
454	NC_008255	T	6	6	19563	19568	0 %	100 %	0 %	0 %	110636445
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457	NC_008255	TGC	2	6	19638	19643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636445
458	NC_008255	TTG	2	6	19663	19668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636445
459	NC_008255	TTTCG	2	10	19687	19696	0 %	60 %	20 %	20 %	110636445
460	NC_008255	AAG	2	6	19703	19708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636445
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463	NC_008255	T	7	7	19784	19790	0 %	100 %	0 %	0 %	110636445
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466	NC_008255	AT	3	6	19860	19865	50 %	50 %	0 %	0 %	110636445
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472	NC_008255	ATT	2	6	20292	20297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636445
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479	NC_008255	GTT	2	6	20512	20517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636445
480	NC_008255	CTG	2	6	20590	20595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636445
481	NC_008255	TAC	2	6	20620	20625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636445
482	NC_008255	GTT	2	6	20763	20768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636445
483	NC_008255	AAAT	2	8	20808	20815	75 %	25 %	0 %	0 %	110636445
484	NC_008255	CAG	3	9	20864	20872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636445
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486	NC_008255	T	7	7	21010	21016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
487	NC_008255	ACA	2	6	21053	21058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636446
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492	NC_008255	AGTT	2	8	21180	21187	25 %	50 %	25 %	0 %	110636446
493	NC_008255	CTG	2	6	21329	21334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636446
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497	NC_008255	AAT	2	6	21563	21568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
498	NC_008255	ATT	3	9	21581	21589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636447
499	NC_008255	CA	4	8	21621	21628	50 %	0 %	0 %	50 %	110636447
500	NC_008255	AGA	2	6	21688	21693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636447

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