MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 megaplasmid

Total Repeats: 59922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007974	GTAT	2	8	16	23	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007974	GC	3	6	30	35	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_007974	ACGCA	2	10	49	58	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_007974	TAA	2	6	104	109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007974	CGC	2	6	274	279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_007974	ACA	2	6	429	434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_007974	CTG	2	6	515	520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007974	AGT	2	6	716	721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007974	GTATCG	2	12	728	739	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_007974	ATACGT	2	12	868	879	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_007974	CGA	2	6	972	977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314736
12	NC_007974	ATC	2	6	1018	1023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94314736
13	NC_007974	CGA	2	6	1077	1082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314736
14	NC_007974	GCC	2	6	1188	1193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314736
15	NC_007974	TGA	2	6	1226	1231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94314736
16	NC_007974	GCA	2	6	1251	1256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314736
17	NC_007974	CGGC	2	8	1278	1285	0 %	0 %	50 %	50 %	94314736
18	NC_007974	AAG	3	9	1378	1386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94314736
19	NC_007974	G	6	6	1482	1487	0 %	0 %	100 %	0 %	94314736
20	NC_007974	CAG	2	6	1516	1521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314736
21	NC_007974	GTT	2	6	1530	1535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94314736
22	NC_007974	CGA	2	6	1541	1546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314736
23	NC_007974	ATCG	3	12	1608	1619	25 %	25 %	25 %	25 %	94314736
24	NC_007974	TGG	2	6	1654	1659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94314736
25	NC_007974	GTG	2	6	1702	1707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94314736
26	NC_007974	TGCG	2	8	1760	1767	0 %	25 %	50 %	25 %	94314736
27	NC_007974	CTT	2	6	1827	1832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94314736
28	NC_007974	GCG	2	6	1842	1847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94314736
29	NC_007974	GAGC	2	8	1899	1906	25 %	0 %	50 %	25 %	94314736
30	NC_007974	TTC	2	6	1983	1988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94314736
31	NC_007974	A	6	6	2061	2066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007974	T	6	6	2086	2091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007974	TGG	3	9	2128	2136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007974	CAC	2	6	2274	2279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94314737
35	NC_007974	AAC	2	6	2385	2390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007974	CGA	2	6	2432	2437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_007974	CAT	2	6	2469	2474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_007974	AAG	3	9	2552	2560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007974	TC	3	6	2608	2613	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_007974	CAT	2	6	2731	2736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007974	GCA	2	6	2771	2776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314738
42	NC_007974	ATC	2	6	2780	2785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94314738
43	NC_007974	GGC	2	6	2804	2809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94314738
44	NC_007974	CAGT	2	8	2823	2830	25 %	25 %	25 %	25 %	94314738
45	NC_007974	TGG	2	6	2877	2882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94314738
46	NC_007974	CGA	2	6	2929	2934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314738
47	NC_007974	ATC	2	6	3098	3103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94314738
48	NC_007974	CGC	2	6	3117	3122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314738
49	NC_007974	GCC	2	6	3143	3148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314738
50	NC_007974	GCA	2	6	3160	3165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314738
51	NC_007974	TGA	2	6	3262	3267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94314738
52	NC_007974	ATG	2	6	3389	3394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94314738
53	NC_007974	CG	3	6	3516	3521	0 %	0 %	50 %	50 %	94314739
54	NC_007974	GGC	2	6	3528	3533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94314739
55	NC_007974	GC	4	8	3568	3575	0 %	0 %	50 %	50 %	94314739
56	NC_007974	CGC	2	6	3581	3586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314739
57	NC_007974	TGA	2	6	3609	3614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94314739
58	NC_007974	CGC	2	6	3685	3690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314739
59	NC_007974	CGG	2	6	3701	3706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94314739
60	NC_007974	GC	3	6	3717	3722	0 %	0 %	50 %	50 %	94314739
61	NC_007974	CCGAC	2	10	3770	3779	20 %	0 %	20 %	60 %	94314739
62	NC_007974	GC	3	6	3822	3827	0 %	0 %	50 %	50 %	94314739
63	NC_007974	GACC	2	8	3870	3877	25 %	0 %	25 %	50 %	94314739
64	NC_007974	TCCT	2	8	3904	3911	0 %	50 %	0 %	50 %	94314739
65	NC_007974	AGC	2	6	3920	3925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314739
66	NC_007974	AGG	2	6	3995	4000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94314739
67	NC_007974	CGGC	2	8	4028	4035	0 %	0 %	50 %	50 %	94314739
68	NC_007974	CAA	2	6	4041	4046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94314739
69	NC_007974	CG	3	6	4172	4177	0 %	0 %	50 %	50 %	94314739
70	NC_007974	CAT	2	6	4191	4196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94314739
71	NC_007974	ACG	2	6	4199	4204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314739
72	NC_007974	GGAAG	2	10	4248	4257	40 %	0 %	60 %	0 %	94314739
73	NC_007974	GCC	2	6	4280	4285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314739
74	NC_007974	ACCG	2	8	4372	4379	25 %	0 %	25 %	50 %	94314739
75	NC_007974	CTG	2	6	4396	4401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94314739
76	NC_007974	ACGTCG	2	12	4551	4562	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	94314740
77	NC_007974	ATCCC	2	10	4706	4715	20 %	20 %	0 %	60 %	94314740
78	NC_007974	GTCC	2	8	4745	4752	0 %	25 %	25 %	50 %	94314740
79	NC_007974	AGC	3	9	4827	4835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314740
80	NC_007974	CGA	2	6	4900	4905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314740
81	NC_007974	CGAG	2	8	4920	4927	25 %	0 %	50 %	25 %	94314740
82	NC_007974	GCC	2	6	4938	4943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314740
83	NC_007974	GTG	2	6	4960	4965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94314740
84	NC_007974	GCCAG	2	10	4984	4993	20 %	0 %	40 %	40 %	94314740
85	NC_007974	GGA	2	6	5033	5038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94314740
86	NC_007974	CAT	2	6	5059	5064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94314740
87	NC_007974	CGC	2	6	5071	5076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314740
88	NC_007974	GC	3	6	5122	5127	0 %	0 %	50 %	50 %	94314740
89	NC_007974	CGC	2	6	5141	5146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314740
90	NC_007974	GCC	2	6	5182	5187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314740
91	NC_007974	CCGG	2	8	5208	5215	0 %	0 %	50 %	50 %	94314740
92	NC_007974	ATG	2	6	5227	5232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94314740
93	NC_007974	TGC	2	6	5381	5386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94314740
94	NC_007974	TTC	2	6	5411	5416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94314740
95	NC_007974	GAT	2	6	5606	5611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94314740
96	NC_007974	CCA	2	6	5648	5653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94314740
97	NC_007974	GGTC	2	8	5677	5684	0 %	25 %	50 %	25 %	94314740
98	NC_007974	GTC	2	6	5719	5724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94314740
99	NC_007974	TCGA	2	8	5793	5800	25 %	25 %	25 %	25 %	94314740
100	NC_007974	TGC	2	6	5886	5891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94314740
101	NC_007974	TCG	5	15	5958	5972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94314740
102	NC_007974	ACG	2	6	6033	6038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314740
103	NC_007974	GGC	2	6	6065	6070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94314740
104	NC_007974	ACA	2	6	6192	6197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_007974	ATT	2	6	6255	6260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007974	T	6	6	6259	6264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007974	C	6	6	6375	6380	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
108	NC_007974	GAC	2	6	6404	6409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_007974	CGG	2	6	6414	6419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_007974	CAGGG	2	10	6421	6430	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
111	NC_007974	AC	3	6	6433	6438	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_007974	CTG	2	6	6469	6474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_007974	CCG	2	6	6506	6511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_007974	CAT	2	6	6532	6537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_007974	ATG	2	6	6558	6563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007974	TC	3	6	6566	6571	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_007974	CTT	2	6	6626	6631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_007974	CGCA	2	8	6639	6646	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_007974	TGA	2	6	6650	6655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007974	CGT	2	6	6676	6681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_007974	ATT	2	6	6760	6765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007974	CCA	2	6	6840	6845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_007974	CGTGC	2	10	6859	6868	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
124	NC_007974	GAA	2	6	6933	6938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007974	GCG	2	6	6974	6979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_007974	CGA	2	6	7150	7155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_007974	GCC	2	6	7193	7198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_007974	CACGC	2	10	7237	7246	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
129	NC_007974	GTGACA	2	12	7293	7304	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	94314741
130	NC_007974	GCG	2	6	7309	7314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94314741
131	NC_007974	GCC	2	6	7339	7344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314741
132	NC_007974	ATC	2	6	7359	7364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94314741
133	NC_007974	TGG	2	6	7392	7397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94314741
134	NC_007974	CGC	2	6	7399	7404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314741
135	NC_007974	CGC	2	6	7429	7434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314741
136	NC_007974	GCA	2	6	7462	7467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314741
137	NC_007974	GGCC	2	8	7486	7493	0 %	0 %	50 %	50 %	94314741
138	NC_007974	TGCGA	2	10	7512	7521	20 %	20 %	40 %	20 %	94314741
139	NC_007974	GCC	2	6	7523	7528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314741
140	NC_007974	TCT	2	6	7549	7554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94314741
141	NC_007974	CGA	2	6	7606	7611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314741
142	NC_007974	ATC	2	6	7652	7657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94314741
143	NC_007974	CCT	2	6	7668	7673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94314741
144	NC_007974	CGA	2	6	7699	7704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314741
145	NC_007974	GCA	2	6	7744	7749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314741
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147	NC_007974	CG	3	6	7794	7799	0 %	0 %	50 %	50 %	94314741
148	NC_007974	TGG	2	6	7819	7824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94314741
149	NC_007974	GCC	2	6	7889	7894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314741
150	NC_007974	GCTGCC	2	12	7918	7929	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	94314741
151	NC_007974	GGC	2	6	7972	7977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94314741
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153	NC_007974	AAC	2	6	8222	8227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94314741
154	NC_007974	CGC	2	6	8238	8243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314741
155	NC_007974	GCA	2	6	8296	8301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314741
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157	NC_007974	GGC	2	6	8347	8352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94314741
158	NC_007974	GGA	2	6	8371	8376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94314741
159	NC_007974	CGTCC	2	10	8378	8387	0 %	20 %	20 %	60 %	94314741
160	NC_007974	CTG	2	6	8402	8407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94314741
161	NC_007974	CCAT	2	8	8445	8452	25 %	25 %	0 %	50 %	94314741
162	NC_007974	CTG	2	6	8486	8491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94314741
163	NC_007974	CGC	2	6	8582	8587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314741
164	NC_007974	GGC	2	6	8611	8616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94314741
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166	NC_007974	CAG	2	6	8645	8650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314741
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172	NC_007974	CG	3	6	8836	8841	0 %	0 %	50 %	50 %	94314741
173	NC_007974	TC	3	6	8912	8917	0 %	50 %	0 %	50 %	94314741
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193	NC_007974	CGG	2	6	10014	10019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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195	NC_007974	GC	3	6	10047	10052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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251	NC_007974	AGT	2	6	12457	12462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94314744
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257	NC_007974	GAT	2	6	12581	12586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94314744
258	NC_007974	CGGCC	2	10	12670	12679	0 %	0 %	40 %	60 %	94314744
259	NC_007974	GTG	2	6	12687	12692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94314744
260	NC_007974	GAC	2	6	12737	12742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314744
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262	NC_007974	CCGG	2	8	12794	12801	0 %	0 %	50 %	50 %	94314744
263	NC_007974	TTG	2	6	12822	12827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94314744
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265	NC_007974	TG	3	6	12883	12888	0 %	50 %	50 %	0 %	94314744
266	NC_007974	CGG	2	6	12897	12902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94314744
267	NC_007974	CACG	2	8	12931	12938	25 %	0 %	25 %	50 %	94314745
268	NC_007974	CGC	2	6	12939	12944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314745
269	NC_007974	TGC	2	6	12959	12964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94314745
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271	NC_007974	CGC	2	6	13005	13010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314745
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403	NC_007974	GCGATT	2	12	19030	19041	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	94314749
404	NC_007974	AGC	2	6	19108	19113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314749
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406	NC_007974	GCC	2	6	19151	19156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314749
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