MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 chromosome

Total Repeats: 93799

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_007973	AGTC	2	8	645297	645304	25 %	25 %	25 %	25 %	94309542
16002	NC_007973	CAC	2	6	645415	645420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16003	NC_007973	GGC	2	6	645429	645434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16004	NC_007973	GGT	3	9	645437	645445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16005	NC_007973	GTG	4	12	645446	645457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16006	NC_007973	CAC	2	6	645512	645517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16007	NC_007973	AGG	2	6	645529	645534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16008	NC_007973	GGCG	2	8	645578	645585	0 %	0 %	75 %	25 %	94309543
16009	NC_007973	GCG	2	6	645627	645632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309543
16010	NC_007973	GCC	2	6	645692	645697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309543
16011	NC_007973	CG	4	8	645707	645714	0 %	0 %	50 %	50 %	94309543
16012	NC_007973	GGC	2	6	645734	645739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309543
16013	NC_007973	AGCC	2	8	645756	645763	25 %	0 %	25 %	50 %	94309543
16014	NC_007973	TCA	2	6	645769	645774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94309543
16015	NC_007973	CGA	2	6	645803	645808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309543
16016	NC_007973	GCC	3	9	645820	645828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309543
16017	NC_007973	CAT	2	6	645848	645853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94309543
16018	NC_007973	CGC	2	6	645856	645861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309543
16019	NC_007973	TGCG	2	8	645862	645869	0 %	25 %	50 %	25 %	94309543
16020	NC_007973	CCGG	2	8	646008	646015	0 %	0 %	50 %	50 %	94309543
16021	NC_007973	TGG	2	6	646018	646023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94309543
16022	NC_007973	GCGCA	2	10	646029	646038	20 %	0 %	40 %	40 %	94309543
16023	NC_007973	TGGC	2	8	646041	646048	0 %	25 %	50 %	25 %	94309543
16024	NC_007973	CGA	2	6	646049	646054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309543
16025	NC_007973	CG	3	6	646069	646074	0 %	0 %	50 %	50 %	94309543
16026	NC_007973	CG	3	6	646076	646081	0 %	0 %	50 %	50 %	94309543
16027	NC_007973	TCG	2	6	646084	646089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309543
16028	NC_007973	CG	3	6	646141	646146	0 %	0 %	50 %	50 %	94309543
16029	NC_007973	GC	3	6	646150	646155	0 %	0 %	50 %	50 %	94309543
16030	NC_007973	CCA	2	6	646211	646216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94309543
16031	NC_007973	GCG	2	6	646254	646259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309543
16032	NC_007973	CGCT	2	8	646260	646267	0 %	25 %	25 %	50 %	94309543
16033	NC_007973	GCCG	2	8	646280	646287	0 %	0 %	50 %	50 %	94309543
16034	NC_007973	GCT	2	6	646456	646461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309544
16035	NC_007973	GCC	2	6	646475	646480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309544
16036	NC_007973	GGT	2	6	646483	646488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94309544
16037	NC_007973	GTG	2	6	646493	646498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94309544
16038	NC_007973	GGT	2	6	646501	646506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94309544
16039	NC_007973	CG	3	6	646530	646535	0 %	0 %	50 %	50 %	94309544
16040	NC_007973	GC	4	8	646546	646553	0 %	0 %	50 %	50 %	94309544
16041	NC_007973	GTG	2	6	646604	646609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94309544
16042	NC_007973	CGG	2	6	646620	646625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309544
16043	NC_007973	GTG	2	6	646631	646636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94309544
16044	NC_007973	GCC	2	6	646678	646683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309544
16045	NC_007973	CGG	2	6	646710	646715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309544
16046	NC_007973	TCT	2	6	646749	646754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94309544
16047	NC_007973	TC	3	6	646827	646832	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16048	NC_007973	GTGG	2	8	646902	646909	0 %	25 %	75 %	0 %	94309545
16049	NC_007973	GCC	3	9	646916	646924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309545
16050	NC_007973	GC	3	6	646925	646930	0 %	0 %	50 %	50 %	94309545
16051	NC_007973	GCG	2	6	646937	646942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309545
16052	NC_007973	GC	3	6	646957	646962	0 %	0 %	50 %	50 %	94309545
16053	NC_007973	ACC	2	6	646980	646985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94309545
16054	NC_007973	ACC	2	6	647016	647021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94309545
16055	NC_007973	CCG	2	6	647025	647030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309545
16056	NC_007973	CAG	2	6	647102	647107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309545
16057	NC_007973	TCA	2	6	647122	647127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94309545
16058	NC_007973	GCA	2	6	647143	647148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309545
16059	NC_007973	TCGCG	2	10	647164	647173	0 %	20 %	40 %	40 %	94309545
16060	NC_007973	CGCGCT	2	12	647185	647196	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	94309545
16061	NC_007973	CCA	2	6	647200	647205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94309545
16062	NC_007973	CAT	2	6	647219	647224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94309545
16063	NC_007973	TTC	2	6	647232	647237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94309545
16064	NC_007973	CAG	2	6	647252	647257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309545
16065	NC_007973	GAT	2	6	647258	647263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94309545
16066	NC_007973	CAG	2	6	647312	647317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309545
16067	NC_007973	CGG	2	6	647329	647334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309545
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16071	NC_007973	CGC	2	6	647482	647487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309545
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16073	NC_007973	GCC	2	6	647500	647505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309545
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16077	NC_007973	ACGA	2	8	647649	647656	50 %	0 %	25 %	25 %	94309545
16078	NC_007973	GTC	2	6	647720	647725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309545
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16081	NC_007973	GGCCGC	2	12	647885	647896	0 %	0 %	50 %	50 %	94309545
16082	NC_007973	CTG	2	6	647903	647908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309545
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16087	NC_007973	CG	3	6	648111	648116	0 %	0 %	50 %	50 %	94309545
16088	NC_007973	GCCGTG	2	12	648129	648140	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	94309545
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16099	NC_007973	CAG	2	6	648395	648400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309545
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16102	NC_007973	GGCG	2	8	648514	648521	0 %	0 %	75 %	25 %	94309545
16103	NC_007973	CAT	2	6	648557	648562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94309545
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16105	NC_007973	GCCG	2	8	648637	648644	0 %	0 %	50 %	50 %	94309545
16106	NC_007973	GCC	2	6	648650	648655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309545
16107	NC_007973	CAG	3	9	648659	648667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309545
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16109	NC_007973	GCAGC	2	10	648736	648745	20 %	0 %	40 %	40 %	94309545
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16111	NC_007973	CAT	2	6	648805	648810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94309545
16112	NC_007973	CGA	3	9	648811	648819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309545
16113	NC_007973	CAG	2	6	648872	648877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309545
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16115	NC_007973	GAT	2	6	648965	648970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94309545
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16118	NC_007973	ACGTTG	2	12	649056	649067	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	94309545
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16122	NC_007973	CG	3	6	649172	649177	0 %	0 %	50 %	50 %	94309545
16123	NC_007973	GCG	3	9	649206	649214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309545
16124	NC_007973	GTT	2	6	649241	649246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94309545
16125	NC_007973	CGCGCA	2	12	649276	649287	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	94309545
16126	NC_007973	CG	3	6	649334	649339	0 %	0 %	50 %	50 %	94309545
16127	NC_007973	CGC	2	6	649418	649423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309545
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16129	NC_007973	CTG	2	6	649505	649510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309545
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16131	NC_007973	CTG	2	6	649553	649558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309545
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16182	NC_007973	CGA	2	6	651035	651040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309546
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16194	NC_007973	CTG	2	6	651593	651598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309547
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16231	NC_007973	CG	3	6	652986	652991	0 %	0 %	50 %	50 %	94309548
16232	NC_007973	CGA	2	6	653024	653029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309548
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16235	NC_007973	GCTG	2	8	653077	653084	0 %	25 %	50 %	25 %	94309548
16236	NC_007973	CG	3	6	653104	653109	0 %	0 %	50 %	50 %	94309548
16237	NC_007973	TGC	2	6	653131	653136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309548
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16240	NC_007973	CGA	2	6	653152	653157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309548
16241	NC_007973	TCG	2	6	653158	653163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309548
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16329	NC_007973	CTG	2	6	656701	656706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309550
16330	NC_007973	CAGC	2	8	656740	656747	25 %	0 %	25 %	50 %	94309550
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16332	NC_007973	ATG	2	6	656786	656791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94309550
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16335	NC_007973	GCG	3	9	656929	656937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309551
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16339	NC_007973	TCC	2	6	657126	657131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94309551
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16352	NC_007973	CCA	2	6	657478	657483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94309551
16353	NC_007973	GCCA	2	8	657485	657492	25 %	0 %	25 %	50 %	94309551
16354	NC_007973	GCG	2	6	657521	657526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309551
16355	NC_007973	CGGC	2	8	657550	657557	0 %	0 %	50 %	50 %	94309551
16356	NC_007973	AG	3	6	657564	657569	50 %	0 %	50 %	0 %	94309551
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16360	NC_007973	GGCC	2	8	657673	657680	0 %	0 %	50 %	50 %	94309551
16361	NC_007973	GC	3	6	657689	657694	0 %	0 %	50 %	50 %	94309551
16362	NC_007973	CGG	2	6	657712	657717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309551
16363	NC_007973	CGT	2	6	657722	657727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309551
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16365	NC_007973	CGG	2	6	657805	657810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309551
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16490	NC_007973	CG	3	6	662300	662305	0 %	0 %	50 %	50 %	94309554
16491	NC_007973	GCC	2	6	662339	662344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309554
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