MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 chromosome

Total Repeats: 93799

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_007973	ATGA	2	8	529299	529306	50 %	25 %	25 %	0 %	94309444
13003	NC_007973	CGTT	2	8	529327	529334	0 %	50 %	25 %	25 %	94309444
13004	NC_007973	GCG	2	6	529349	529354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309444
13005	NC_007973	GCA	2	6	529384	529389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309444
13006	NC_007973	GC	3	6	529450	529455	0 %	0 %	50 %	50 %	94309444
13007	NC_007973	GCTGC	2	10	529488	529497	0 %	20 %	40 %	40 %	94309444
13008	NC_007973	GTG	2	6	529589	529594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13009	NC_007973	GC	3	6	529672	529677	0 %	0 %	50 %	50 %	94309445
13010	NC_007973	GGCT	2	8	529704	529711	0 %	25 %	50 %	25 %	94309445
13011	NC_007973	CG	3	6	529739	529744	0 %	0 %	50 %	50 %	94309445
13012	NC_007973	CGG	2	6	529758	529763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309445
13013	NC_007973	AGC	2	6	529799	529804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309445
13014	NC_007973	TGGC	2	8	529874	529881	0 %	25 %	50 %	25 %	94309445
13015	NC_007973	GCA	2	6	529890	529895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309445
13016	NC_007973	GCC	2	6	529937	529942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309445
13017	NC_007973	GGC	2	6	529945	529950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309445
13018	NC_007973	GCA	2	6	529980	529985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309445
13019	NC_007973	GGT	2	6	530017	530022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94309445
13020	NC_007973	CAG	3	9	530074	530082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309445
13021	NC_007973	CCG	2	6	530083	530088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309445
13022	NC_007973	TCG	2	6	530154	530159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309445
13023	NC_007973	GATCGC	2	12	530182	530193	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	94309445
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13026	NC_007973	AGCG	2	8	530261	530268	25 %	0 %	50 %	25 %	94309445
13027	NC_007973	CAGG	2	8	530311	530318	25 %	0 %	50 %	25 %	94309445
13028	NC_007973	GAA	2	6	530347	530352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94309445
13029	NC_007973	CG	3	6	530397	530402	0 %	0 %	50 %	50 %	94309445
13030	NC_007973	ACC	2	6	530510	530515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94309445
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13032	NC_007973	GCGT	2	8	530564	530571	0 %	25 %	50 %	25 %	94309445
13033	NC_007973	ACGC	2	8	530592	530599	25 %	0 %	25 %	50 %	94309445
13034	NC_007973	TGC	2	6	530606	530611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309445
13035	NC_007973	CATG	2	8	530658	530665	25 %	25 %	25 %	25 %	94309445
13036	NC_007973	CGC	2	6	530701	530706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13037	NC_007973	ACC	2	6	530802	530807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13038	NC_007973	GTT	2	6	530874	530879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_007973	C	7	7	530897	530903	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13040	NC_007973	GCATG	2	10	530929	530938	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13041	NC_007973	CGT	2	6	530969	530974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13042	NC_007973	GTA	2	6	530978	530983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_007973	GCG	2	6	531022	531027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309446
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13045	NC_007973	GAC	2	6	531150	531155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309446
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13047	NC_007973	GCCT	2	8	531210	531217	0 %	25 %	25 %	50 %	94309446
13048	NC_007973	CCGA	2	8	531261	531268	25 %	0 %	25 %	50 %	94309446
13049	NC_007973	GGA	2	6	531284	531289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94309446
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13051	NC_007973	CGA	2	6	531440	531445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309446
13052	NC_007973	AGA	2	6	531454	531459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94309446
13053	NC_007973	ACG	2	6	531487	531492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309446
13054	NC_007973	CCA	2	6	531520	531525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94309446
13055	NC_007973	GCT	2	6	531569	531574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309446
13056	NC_007973	GCC	2	6	531576	531581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309446
13057	NC_007973	CG	3	6	531600	531605	0 %	0 %	50 %	50 %	94309446
13058	NC_007973	TGG	2	6	531628	531633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94309446
13059	NC_007973	TCG	2	6	531709	531714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309446
13060	NC_007973	GCG	2	6	531715	531720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309446
13061	NC_007973	TCGC	2	8	531768	531775	0 %	25 %	25 %	50 %	94309446
13062	NC_007973	ATC	2	6	531807	531812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94309446
13063	NC_007973	CAT	2	6	531815	531820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94309446
13064	NC_007973	CG	4	8	531824	531831	0 %	0 %	50 %	50 %	94309446
13065	NC_007973	GCG	2	6	531891	531896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309446
13066	NC_007973	CGA	3	9	531923	531931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309446
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13068	NC_007973	CGGTC	2	10	532010	532019	0 %	20 %	40 %	40 %	94309446
13069	NC_007973	GGC	2	6	532107	532112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309446
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13074	NC_007973	TGA	2	6	532251	532256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94309446
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13076	NC_007973	CCA	2	6	532347	532352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94309447
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13093	NC_007973	GC	3	6	532985	532990	0 %	0 %	50 %	50 %	94309447
13094	NC_007973	CTG	2	6	533048	533053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309447
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13096	NC_007973	GC	3	6	533075	533080	0 %	0 %	50 %	50 %	94309447
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13100	NC_007973	TGA	2	6	533274	533279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94309447
13101	NC_007973	GCCG	2	8	533297	533304	0 %	0 %	50 %	50 %	94309447
13102	NC_007973	TCTG	2	8	533340	533347	0 %	50 %	25 %	25 %	94309447
13103	NC_007973	GGT	2	6	533365	533370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94309447
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13105	NC_007973	ATC	2	6	533451	533456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94309447
13106	NC_007973	CGCAA	2	10	533565	533574	40 %	0 %	20 %	40 %	94309447
13107	NC_007973	TGCCGC	2	12	533598	533609	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	94309447
13108	NC_007973	CTG	3	9	533657	533665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309447
13109	NC_007973	GTG	2	6	533675	533680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94309447
13110	NC_007973	GCG	2	6	533685	533690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309447
13111	NC_007973	CGG	2	6	533731	533736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309447
13112	NC_007973	CG	3	6	533779	533784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13113	NC_007973	GC	3	6	533794	533799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13114	NC_007973	CAGA	2	8	533800	533807	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13115	NC_007973	GCA	2	6	533841	533846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13119	NC_007973	CAT	2	6	533995	534000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94309448
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13123	NC_007973	GGT	2	6	534127	534132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94309448
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13355	NC_007973	GTA	2	6	542632	542637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94309456
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13360	NC_007973	CG	3	6	542745	542750	0 %	0 %	50 %	50 %	94309456
13361	NC_007973	TCGCG	2	10	542754	542763	0 %	20 %	40 %	40 %	94309456
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13487	NC_007973	GATG	2	8	546866	546873	25 %	25 %	50 %	0 %	94309457
13488	NC_007973	TCA	2	6	546890	546895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94309457
13489	NC_007973	GCT	2	6	546922	546927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309458
13490	NC_007973	GCC	2	6	546929	546934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309458
13491	NC_007973	GCC	2	6	546947	546952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309458
13492	NC_007973	GCG	2	6	546977	546982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309458
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13499	NC_007973	TCA	2	6	547168	547173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94309458
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