MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 chromosome

Total Repeats: 93799

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007973	GGC	2	6	20897	20902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94308962
502	NC_007973	GCTG	2	8	20928	20935	0 %	25 %	50 %	25 %	94308962
503	NC_007973	CTG	2	6	20960	20965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308962
504	NC_007973	CG	3	6	21006	21011	0 %	0 %	50 %	50 %	94308962
505	NC_007973	CGGC	2	8	21013	21020	0 %	0 %	50 %	50 %	94308962
506	NC_007973	GCG	2	6	21093	21098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94308962
507	NC_007973	GCC	2	6	21128	21133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308962
508	NC_007973	CTG	2	6	21134	21139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308962
509	NC_007973	CTGGC	2	10	21167	21176	0 %	20 %	40 %	40 %	94308962
510	NC_007973	GCGCC	2	10	21181	21190	0 %	0 %	40 %	60 %	94308962
511	NC_007973	TGC	2	6	21201	21206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308962
512	NC_007973	CGC	2	6	21207	21212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308962
513	NC_007973	TGGGCG	2	12	21240	21251	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	94308962
514	NC_007973	CCCTGC	2	12	21294	21305	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	94308962
515	NC_007973	CTG	2	6	21347	21352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308962
516	NC_007973	GTG	2	6	21353	21358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94308962
517	NC_007973	CTG	2	6	21365	21370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308962
518	NC_007973	GTG	2	6	21392	21397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94308962
519	NC_007973	CGC	2	6	21408	21413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308962
520	NC_007973	CGG	2	6	21459	21464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94308962
521	NC_007973	GCTG	2	8	21478	21485	0 %	25 %	50 %	25 %	94308962
522	NC_007973	CTT	2	6	21508	21513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94308962
523	NC_007973	CTG	2	6	21518	21523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308962
524	NC_007973	CGG	2	6	21535	21540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94308962
525	NC_007973	TGC	2	6	21636	21641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308962
526	NC_007973	GC	3	6	21666	21671	0 %	0 %	50 %	50 %	94308962
527	NC_007973	GCT	2	6	21682	21687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308962
528	NC_007973	GC	3	6	21747	21752	0 %	0 %	50 %	50 %	94308962
529	NC_007973	GCTG	2	8	21805	21812	0 %	25 %	50 %	25 %	94308962
530	NC_007973	GCG	2	6	21813	21818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94308962
531	NC_007973	CGGC	2	8	21846	21853	0 %	0 %	50 %	50 %	94308962
532	NC_007973	ATC	2	6	21866	21871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94308962
533	NC_007973	GCT	2	6	21874	21879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308962
534	NC_007973	GCA	2	6	21912	21917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308962
535	NC_007973	CTC	2	6	22039	22044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_007973	CTGG	2	8	22108	22115	0 %	25 %	50 %	25 %	94308963
537	NC_007973	GCTG	2	8	22125	22132	0 %	25 %	50 %	25 %	94308963
538	NC_007973	CCG	2	6	22133	22138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308963
539	NC_007973	TGC	2	6	22148	22153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308963
540	NC_007973	CGC	2	6	22167	22172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308963
541	NC_007973	CGG	2	6	22187	22192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94308963
542	NC_007973	CGG	2	6	22202	22207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94308963
543	NC_007973	CGT	2	6	22220	22225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308963
544	NC_007973	CGC	2	6	22259	22264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308963
545	NC_007973	GGT	2	6	22290	22295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94308963
546	NC_007973	CGC	2	6	22331	22336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308963
547	NC_007973	TGG	2	6	22385	22390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94308963
548	NC_007973	ACA	2	6	22460	22465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94308963
549	NC_007973	CTG	2	6	22537	22542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308963
550	NC_007973	ACA	2	6	22622	22627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94308963
551	NC_007973	GAC	2	6	22642	22647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308963
552	NC_007973	GAA	2	6	22669	22674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94308963
553	NC_007973	CTG	2	6	22675	22680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308963
554	NC_007973	CG	3	6	22683	22688	0 %	0 %	50 %	50 %	94308963
555	NC_007973	ACA	2	6	22813	22818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_007973	GCG	2	6	22827	22832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_007973	AG	3	6	22833	22838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
558	NC_007973	GCGG	2	8	22865	22872	0 %	0 %	75 %	25 %	94308964
559	NC_007973	TGTC	2	8	22876	22883	0 %	50 %	25 %	25 %	94308964
560	NC_007973	CGA	2	6	22903	22908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308964
561	NC_007973	GTC	2	6	22922	22927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308964
562	NC_007973	TGG	2	6	22944	22949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94308964
563	NC_007973	GCG	2	6	22964	22969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94308964
564	NC_007973	GATC	2	8	22972	22979	25 %	25 %	25 %	25 %	94308964
565	NC_007973	CCCA	2	8	23032	23039	25 %	0 %	0 %	75 %	94308964
566	NC_007973	AGC	2	6	23040	23045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308964
567	NC_007973	TCG	2	6	23082	23087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308964
568	NC_007973	GCTG	2	8	23100	23107	0 %	25 %	50 %	25 %	94308964
569	NC_007973	TCG	2	6	23111	23116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308964
570	NC_007973	CAGG	2	8	23171	23178	25 %	0 %	50 %	25 %	94308964
571	NC_007973	CGG	2	6	23184	23189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94308964
572	NC_007973	TGG	2	6	23212	23217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94308964
573	NC_007973	TCC	2	6	23268	23273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94308964
574	NC_007973	CGCC	2	8	23395	23402	0 %	0 %	25 %	75 %	94308964
575	NC_007973	CGC	2	6	23420	23425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308964
576	NC_007973	GCCC	2	8	23590	23597	0 %	0 %	25 %	75 %	94308964
577	NC_007973	GAGAC	2	10	23680	23689	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
578	NC_007973	ACA	2	6	23783	23788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94308965
579	NC_007973	GGT	2	6	23856	23861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94308965
580	NC_007973	GCG	2	6	23891	23896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94308965
581	NC_007973	CGC	2	6	23937	23942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308965
582	NC_007973	ACCG	2	8	23961	23968	25 %	0 %	25 %	50 %	94308965
583	NC_007973	GTG	2	6	24073	24078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94308965
584	NC_007973	TG	3	6	24099	24104	0 %	50 %	50 %	0 %	94308965
585	NC_007973	ATG	2	6	24149	24154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94308965
586	NC_007973	GCG	2	6	24182	24187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94308965
587	NC_007973	CAAGGG	2	12	24198	24209	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	94308965
588	NC_007973	CGG	2	6	24227	24232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94308965
589	NC_007973	GCA	2	6	24320	24325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308965
590	NC_007973	CCA	2	6	24329	24334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94308965
591	NC_007973	CGA	2	6	24350	24355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308965
592	NC_007973	CGC	2	6	24416	24421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308965
593	NC_007973	GCC	2	6	24444	24449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308965
594	NC_007973	CGT	2	6	24516	24521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308965
595	NC_007973	CAGGG	2	10	24576	24585	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
596	NC_007973	CA	3	6	24637	24642	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
597	NC_007973	TCG	2	6	24645	24650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_007973	CA	3	6	24657	24662	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
599	NC_007973	TTC	2	6	24733	24738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_007973	GTCT	2	8	24859	24866	0 %	50 %	25 %	25 %	94308966
601	NC_007973	CCG	2	6	24952	24957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308966
602	NC_007973	CCA	2	6	24964	24969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94308966
603	NC_007973	TCG	2	6	25011	25016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308966
604	NC_007973	CGTGG	2	10	25052	25061	0 %	20 %	60 %	20 %	94308966
605	NC_007973	GTG	2	6	25073	25078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94308966
606	NC_007973	ACG	2	6	25182	25187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308966
607	NC_007973	ATG	2	6	25209	25214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94308966
608	NC_007973	CCG	2	6	25221	25226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308966
609	NC_007973	CG	3	6	25240	25245	0 %	0 %	50 %	50 %	94308966
610	NC_007973	GCCG	2	8	25297	25304	0 %	0 %	50 %	50 %	94308966
611	NC_007973	GCGG	2	8	25316	25323	0 %	0 %	75 %	25 %	94308966
612	NC_007973	TGCGA	2	10	25370	25379	20 %	20 %	40 %	20 %	94308966
613	NC_007973	G	6	6	25486	25491	0 %	0 %	100 %	0 %	94308966
614	NC_007973	CG	3	6	25498	25503	0 %	0 %	50 %	50 %	94308966
615	NC_007973	GATCC	2	10	25520	25529	20 %	20 %	20 %	40 %	94308966
616	NC_007973	GC	3	6	25571	25576	0 %	0 %	50 %	50 %	94308966
617	NC_007973	GTG	2	6	25601	25606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94308966
618	NC_007973	GC	4	8	25656	25663	0 %	0 %	50 %	50 %	94308966
619	NC_007973	AGC	2	6	25725	25730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308966
620	NC_007973	CGTG	2	8	25780	25787	0 %	25 %	50 %	25 %	94308966
621	NC_007973	TGG	2	6	25851	25856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94308966
622	NC_007973	GCA	2	6	25921	25926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308966
623	NC_007973	GCT	2	6	25972	25977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308966
624	NC_007973	GAC	2	6	26003	26008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308966
625	NC_007973	GGC	2	6	26023	26028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94308966
626	NC_007973	GAA	2	6	26090	26095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94308967
627	NC_007973	CGG	2	6	26102	26107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94308967
628	NC_007973	CGG	2	6	26121	26126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94308967
629	NC_007973	TCG	2	6	26131	26136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308967
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631	NC_007973	GCC	2	6	26196	26201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308967
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