MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 chromosome

Total Repeats: 93799

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_007973	GC	3	6	199949	199954	0 %	0 %	50 %	50 %	94309137
5002	NC_007973	ACG	2	6	199967	199972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309137
5003	NC_007973	CAC	2	6	199998	200003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94309137
5004	NC_007973	GGC	2	6	200056	200061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309137
5005	NC_007973	CG	3	6	200085	200090	0 %	0 %	50 %	50 %	94309137
5006	NC_007973	CGC	2	6	200150	200155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309137
5007	NC_007973	CAA	2	6	200202	200207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94309137
5008	NC_007973	GCG	2	6	200225	200230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309137
5009	NC_007973	CGCA	2	8	200274	200281	25 %	0 %	25 %	50 %	94309137
5010	NC_007973	CAT	2	6	200298	200303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94309137
5011	NC_007973	TGGG	2	8	200320	200327	0 %	25 %	75 %	0 %	94309137
5012	NC_007973	GGAC	2	8	200357	200364	25 %	0 %	50 %	25 %	94309137
5013	NC_007973	AAC	2	6	200425	200430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94309137
5014	NC_007973	CTG	2	6	200473	200478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309137
5015	NC_007973	TTCCG	2	10	200485	200494	0 %	40 %	20 %	40 %	94309137
5016	NC_007973	CTA	2	6	200496	200501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94309137
5017	NC_007973	TCG	2	6	200519	200524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309137
5018	NC_007973	CCTCG	2	10	200622	200631	0 %	20 %	20 %	60 %	94309137
5019	NC_007973	ACT	2	6	200648	200653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94309137
5020	NC_007973	CTA	2	6	200685	200690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94309137
5021	NC_007973	GAC	3	9	200766	200774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309137
5022	NC_007973	GTG	2	6	200783	200788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94309137
5023	NC_007973	CGC	2	6	200835	200840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309137
5024	NC_007973	AGC	2	6	200848	200853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309137
5025	NC_007973	ACA	2	6	200873	200878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94309137
5026	NC_007973	CGC	2	6	200947	200952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309137
5027	NC_007973	CGG	2	6	201011	201016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309137
5028	NC_007973	CGG	2	6	201041	201046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309137
5029	NC_007973	CCGG	2	8	201100	201107	0 %	0 %	50 %	50 %	94309137
5030	NC_007973	GCT	2	6	201264	201269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309137
5031	NC_007973	GTC	2	6	201374	201379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309137
5032	NC_007973	AGC	2	6	201397	201402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309137
5033	NC_007973	GT	3	6	201440	201445	0 %	50 %	50 %	0 %	94309137
5034	NC_007973	GCG	2	6	201499	201504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309137
5035	NC_007973	CGC	2	6	201515	201520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309137
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5037	NC_007973	CTG	2	6	201621	201626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309137
5038	NC_007973	TGGC	2	8	201666	201673	0 %	25 %	50 %	25 %	94309137
5039	NC_007973	ACG	2	6	201751	201756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309137
5040	NC_007973	CGG	2	6	201770	201775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309137
5041	NC_007973	GGC	2	6	201844	201849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309137
5042	NC_007973	CTT	2	6	201864	201869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94309137
5043	NC_007973	GCT	2	6	201897	201902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309137
5044	NC_007973	AGA	2	6	201968	201973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94309137
5045	NC_007973	GCA	2	6	201987	201992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309137
5046	NC_007973	CGT	2	6	202011	202016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309137
5047	NC_007973	TCG	2	6	202135	202140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309138
5048	NC_007973	TCG	2	6	202147	202152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309138
5049	NC_007973	GGC	2	6	202160	202165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309138
5050	NC_007973	GCA	2	6	202187	202192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309138
5051	NC_007973	TGC	2	6	202238	202243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309138
5052	NC_007973	ACG	2	6	202392	202397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309138
5053	NC_007973	ACGGCC	2	12	202401	202412	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	94309138
5054	NC_007973	GC	3	6	202423	202428	0 %	0 %	50 %	50 %	94309138
5055	NC_007973	TCA	2	6	202456	202461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94309138
5056	NC_007973	CTG	2	6	202517	202522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309138
5057	NC_007973	GCA	2	6	202527	202532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_007973	GC	4	8	202547	202554	0 %	0 %	50 %	50 %	335055480
5059	NC_007973	CAT	2	6	202611	202616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	335055480
5060	NC_007973	CGT	2	6	202630	202635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	335055480
5061	NC_007973	TAC	2	6	202651	202656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	335055480
5062	NC_007973	CGCTT	2	10	202691	202700	0 %	40 %	20 %	40 %	335055480
5063	NC_007973	GCCG	2	8	202749	202756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5064	NC_007973	CGC	2	6	202845	202850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5065	NC_007973	GCC	2	6	202860	202865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5066	NC_007973	GC	3	6	202868	202873	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5067	NC_007973	CCCGG	2	10	202878	202887	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5068	NC_007973	GCG	2	6	203141	203146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309139
5069	NC_007973	CTG	2	6	203197	203202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309139
5070	NC_007973	CG	3	6	203251	203256	0 %	0 %	50 %	50 %	94309139
5071	NC_007973	CGAT	2	8	203315	203322	25 %	25 %	25 %	25 %	94309139
5072	NC_007973	G	6	6	203363	203368	0 %	0 %	100 %	0 %	94309139
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5079	NC_007973	TCGAAA	2	12	203609	203620	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5080	NC_007973	ATCA	2	8	203809	203816	50 %	25 %	0 %	25 %	94309140
5081	NC_007973	CG	3	6	203829	203834	0 %	0 %	50 %	50 %	94309140
5082	NC_007973	TCGA	2	8	203887	203894	25 %	25 %	25 %	25 %	94309140
5083	NC_007973	GCT	3	9	203973	203981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309140
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5088	NC_007973	C	8	8	204392	204399	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5089	NC_007973	GC	3	6	204469	204474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5090	NC_007973	TGC	2	6	204479	204484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5091	NC_007973	GC	3	6	204524	204529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5092	NC_007973	TCG	2	6	204635	204640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_007973	GCC	2	6	204665	204670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5094	NC_007973	TGA	2	6	204720	204725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5097	NC_007973	CGG	2	6	204778	204783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309141
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5099	NC_007973	GAC	2	6	204831	204836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309141
5100	NC_007973	TCG	2	6	204847	204852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309141
5101	NC_007973	TGA	2	6	204997	205002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94309141
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5108	NC_007973	TGC	2	6	205170	205175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309141
5109	NC_007973	AAT	2	6	205224	205229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_007973	GAG	2	6	205257	205262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_007973	ACC	2	6	205274	205279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94309142
5112	NC_007973	GCC	2	6	205345	205350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309142
5113	NC_007973	GCG	2	6	205355	205360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309142
5114	NC_007973	GC	3	6	205367	205372	0 %	0 %	50 %	50 %	94309142
5115	NC_007973	GCG	2	6	205417	205422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309142
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5121	NC_007973	GCTC	2	8	205944	205951	0 %	25 %	25 %	50 %	94309142
5122	NC_007973	GC	3	6	205956	205961	0 %	0 %	50 %	50 %	94309142
5123	NC_007973	TGG	2	6	205974	205979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94309142
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5125	NC_007973	CCGGC	2	10	205998	206007	0 %	0 %	40 %	60 %	94309142
5126	NC_007973	CAA	2	6	206032	206037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94309142
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5241	NC_007973	CT	3	6	210427	210432	0 %	50 %	0 %	50 %	94309146
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5245	NC_007973	GGA	2	6	210599	210604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5246	NC_007973	ACG	2	6	210645	210650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309147
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5249	NC_007973	CCG	2	6	210686	210691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309147
5250	NC_007973	CTG	3	9	210692	210700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309147
5251	NC_007973	GGT	2	6	210769	210774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94309147
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5253	NC_007973	GGC	2	6	210856	210861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309147
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5255	NC_007973	GC	4	8	210927	210934	0 %	0 %	50 %	50 %	94309147
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5264	NC_007973	CTG	2	6	211454	211459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309147
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5274	NC_007973	GCA	2	6	211781	211786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5276	NC_007973	CTG	2	6	211811	211816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5279	NC_007973	TC	3	6	211996	212001	0 %	50 %	0 %	50 %	94309148
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5372	NC_007973	GCGCC	2	10	215970	215979	0 %	0 %	40 %	60 %	94309151
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5498	NC_007973	GATC	2	8	221322	221329	25 %	25 %	25 %	25 %	94309155
5499	NC_007973	TGC	2	6	221330	221335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309155
5500	NC_007973	CGG	2	6	221343	221348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309155

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