MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 plasmid pMOL30

Total Repeats: 4624

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007971	ATCCCT	2	12	26	37	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	94152465
2	NC_007971	TGC	2	6	75	80	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152465
3	NC_007971	ATC	2	6	115	120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152465
4	NC_007971	GTCG	2	8	162	169	0 %	25 %	50 %	25 %	94152465
5	NC_007971	ACT	2	6	179	184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152465
6	NC_007971	CG	3	6	207	212	0 %	0 %	50 %	50 %	94152465
7	NC_007971	GA	3	6	221	226	50 %	0 %	50 %	0 %	94152465
8	NC_007971	ACC	3	9	298	306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94152465
9	NC_007971	ATG	2	6	391	396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152465
10	NC_007971	CGG	2	6	416	421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152465
11	NC_007971	GTC	2	6	526	531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152465
12	NC_007971	AAG	2	6	532	537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94152465
13	NC_007971	CTCTG	2	10	597	606	0 %	40 %	20 %	40 %	94152465
14	NC_007971	TTC	2	6	643	648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94152465
15	NC_007971	ATC	2	6	703	708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152465
16	NC_007971	GCT	2	6	732	737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152465
17	NC_007971	TGG	2	6	752	757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94152465
18	NC_007971	CG	3	6	908	913	0 %	0 %	50 %	50 %	94152465
19	NC_007971	TCA	2	6	935	940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152465
20	NC_007971	GGA	2	6	984	989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94152465
21	NC_007971	GAG	2	6	1078	1083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94152465
22	NC_007971	CG	3	6	1089	1094	0 %	0 %	50 %	50 %	94152465
23	NC_007971	GCA	2	6	1152	1157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152464
24	NC_007971	GCC	2	6	1160	1165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152464
25	NC_007971	C	7	7	1294	1300	0 %	0 %	0 %	100 %	94152464
26	NC_007971	GCT	2	6	1329	1334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152464
27	NC_007971	C	8	8	1398	1405	0 %	0 %	0 %	100 %	94152464
28	NC_007971	CAG	2	6	1434	1439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152464
29	NC_007971	AT	3	6	1640	1645	50 %	50 %	0 %	0 %	94152464
30	NC_007971	GAAG	2	8	1673	1680	50 %	0 %	50 %	0 %	94152464
31	NC_007971	GT	3	6	1802	1807	0 %	50 %	50 %	0 %	94152464
32	NC_007971	TCG	2	6	1924	1929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152464
33	NC_007971	GTT	2	6	1971	1976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94152464
34	NC_007971	CGC	2	6	2070	2075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152464
35	NC_007971	GCT	2	6	2162	2167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152464
36	NC_007971	GCA	2	6	2223	2228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152464
37	NC_007971	GCC	2	6	2231	2236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152464
38	NC_007971	T	7	7	2276	2282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007971	GCC	2	6	2303	2308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_007971	GCG	2	6	2383	2388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007971	G	6	6	2408	2413	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007971	GA	3	6	2420	2425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007971	GGGC	2	8	2519	2526	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
44	NC_007971	CGG	2	6	2654	2659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007971	CTC	2	6	2730	2735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_007971	GCG	2	6	2786	2791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007971	CGA	2	6	2988	2993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152463
48	NC_007971	GC	3	6	3025	3030	0 %	0 %	50 %	50 %	94152463
49	NC_007971	AACG	2	8	3143	3150	50 %	0 %	25 %	25 %	94152463
50	NC_007971	GCCG	2	8	3156	3163	0 %	0 %	50 %	50 %	94152463
51	NC_007971	GAG	2	6	3222	3227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94152463
52	NC_007971	ATC	2	6	3301	3306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152463
53	NC_007971	CAG	2	6	3341	3346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152463
54	NC_007971	CGA	2	6	3426	3431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_007971	CG	3	6	3439	3444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_007971	GGC	2	6	3451	3456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_007971	GAG	2	6	3474	3479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007971	GCC	2	6	3565	3570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152462
59	NC_007971	GCC	2	6	3596	3601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152462
60	NC_007971	TCGT	2	8	3654	3661	0 %	50 %	25 %	25 %	94152462
61	NC_007971	CGTC	2	8	3662	3669	0 %	25 %	25 %	50 %	94152462
62	NC_007971	CTT	2	6	3692	3697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94152462
63	NC_007971	GC	3	6	3717	3722	0 %	0 %	50 %	50 %	94152462
64	NC_007971	CGC	2	6	3786	3791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152462
65	NC_007971	TAGG	2	8	3840	3847	25 %	25 %	50 %	0 %	94152462
66	NC_007971	CGC	2	6	3900	3905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152462
67	NC_007971	TGA	2	6	3941	3946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152462
68	NC_007971	GAATC	2	10	4068	4077	40 %	20 %	20 %	20 %	94152462
69	NC_007971	TTCGT	2	10	4108	4117	0 %	60 %	20 %	20 %	94152462
70	NC_007971	AACC	2	8	4170	4177	50 %	0 %	0 %	50 %	94152462
71	NC_007971	GTGA	2	8	4198	4205	25 %	25 %	50 %	0 %	94152462
72	NC_007971	GATA	2	8	4342	4349	50 %	25 %	25 %	0 %	94152462
73	NC_007971	ATC	2	6	4384	4389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152462
74	NC_007971	TCG	2	6	4390	4395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152462
75	NC_007971	CGCC	2	8	4411	4418	0 %	0 %	25 %	75 %	94152462
76	NC_007971	AAG	2	6	4437	4442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94152462
77	NC_007971	CGC	3	9	4466	4474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152462
78	NC_007971	CTT	2	6	4527	4532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94152462
79	NC_007971	GTT	2	6	4545	4550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94152462
80	NC_007971	CG	3	6	4718	4723	0 %	0 %	50 %	50 %	94152462
81	NC_007971	CTC	2	6	4755	4760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94152462
82	NC_007971	GCT	2	6	4790	4795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152462
83	NC_007971	T	6	6	4804	4809	0 %	100 %	0 %	0 %	94152462
84	NC_007971	CAAT	2	8	4931	4938	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_007971	CCA	2	6	4961	4966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_007971	GC	3	6	5001	5006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_007971	CCA	2	6	5049	5054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_007971	TGC	2	6	5177	5182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_007971	ATT	2	6	5197	5202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007971	GTTG	2	8	5226	5233	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007971	GCT	2	6	5249	5254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_007971	ACC	2	6	5286	5291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_007971	CA	3	6	5384	5389	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_007971	CCCT	2	8	5413	5420	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
95	NC_007971	CT	3	6	5419	5424	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_007971	CT	3	6	5658	5663	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_007971	GCG	2	6	5845	5850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_007971	AGC	2	6	5853	5858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_007971	ACA	2	6	6065	6070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_007971	CACT	2	8	6096	6103	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_007971	CCA	2	6	6129	6134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_007971	TTGC	2	8	6326	6333	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_007971	CAC	2	6	6388	6393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_007971	CGC	2	6	6523	6528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_007971	CGCA	2	8	6615	6622	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_007971	GGC	2	6	6654	6659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_007971	TGT	2	6	6670	6675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007971	TGGA	2	8	6841	6848	25 %	25 %	50 %	0 %	94152461
109	NC_007971	CGA	2	6	6858	6863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152461
110	NC_007971	AGA	3	9	6866	6874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94152461
111	NC_007971	CGG	2	6	6945	6950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152461
112	NC_007971	GA	3	6	7034	7039	50 %	0 %	50 %	0 %	94152461
113	NC_007971	AGG	2	6	7070	7075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94152461
114	NC_007971	AGT	2	6	7101	7106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152461
115	NC_007971	GAA	2	6	7110	7115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94152461
116	NC_007971	GC	4	8	7134	7141	0 %	0 %	50 %	50 %	94152461
117	NC_007971	GCC	2	6	7153	7158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152461
118	NC_007971	C	6	6	7174	7179	0 %	0 %	0 %	100 %	94152461
119	NC_007971	AGC	2	6	7203	7208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152461
120	NC_007971	GA	3	6	7254	7259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007971	T	8	8	7271	7278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007971	GGCGA	2	10	7298	7307	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
123	NC_007971	CG	3	6	7322	7327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_007971	GGGC	2	8	7340	7347	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
125	NC_007971	GGA	2	6	7370	7375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007971	GGC	2	6	7398	7403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_007971	CGC	2	6	7413	7418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_007971	TGC	2	6	7427	7432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_007971	TCCA	2	8	7467	7474	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_007971	GA	3	6	7516	7521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007971	TCT	2	6	7531	7536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_007971	GGC	2	6	7556	7561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_007971	GAG	2	6	7571	7576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007971	AGA	2	6	7579	7584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007971	GTT	2	6	7587	7592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007971	CAA	2	6	7666	7671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94152460
137	NC_007971	CTC	2	6	7759	7764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94152460
138	NC_007971	CCT	2	6	7781	7786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94152460
139	NC_007971	AATCTC	2	12	7841	7852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152460
140	NC_007971	GGC	2	6	7866	7871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152460
141	NC_007971	CGCT	2	8	8015	8022	0 %	25 %	25 %	50 %	94152460
142	NC_007971	CCG	2	6	8101	8106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152460
143	NC_007971	CGGC	2	8	8233	8240	0 %	0 %	50 %	50 %	94152460
144	NC_007971	TCC	2	6	8272	8277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94152460
145	NC_007971	TCG	2	6	8335	8340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152460
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149	NC_007971	GGGC	2	8	8551	8558	0 %	0 %	75 %	25 %	94152460
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262	NC_007971	AGG	2	6	14589	14594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_007971	CATT	2	8	14840	14847	25 %	50 %	0 %	25 %	94152454
271	NC_007971	GCCG	2	8	14881	14888	0 %	0 %	50 %	50 %	94152454
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279	NC_007971	CCA	2	6	15150	15155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94152454
280	NC_007971	CATC	2	8	15228	15235	25 %	25 %	0 %	50 %	94152454
281	NC_007971	CTG	2	6	15249	15254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152454
282	NC_007971	GA	4	8	15280	15287	50 %	0 %	50 %	0 %	94152454
283	NC_007971	GAT	3	9	15318	15326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152454
284	NC_007971	TGC	2	6	15348	15353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152454
285	NC_007971	CCAC	2	8	15401	15408	25 %	0 %	0 %	75 %	94152454
286	NC_007971	ACT	2	6	15457	15462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
287	NC_007971	CT	3	6	15469	15474	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
288	NC_007971	GCC	2	6	15551	15556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
289	NC_007971	ACG	2	6	15633	15638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_007971	GCT	2	6	15733	15738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_007971	TCG	2	6	15770	15775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
292	NC_007971	GTG	2	6	15809	15814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
293	NC_007971	TCG	2	6	15833	15838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
294	NC_007971	TGC	2	6	15853	15858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
295	NC_007971	CTA	2	6	15889	15894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152452
296	NC_007971	CGG	2	6	15895	15900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152452
297	NC_007971	TCA	2	6	15922	15927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152452
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299	NC_007971	TGC	2	6	15968	15973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152452
300	NC_007971	CGTG	2	8	16019	16026	0 %	25 %	50 %	25 %	94152452
301	NC_007971	TGG	2	6	16109	16114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94152452
302	NC_007971	GTA	2	6	16174	16179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152452
303	NC_007971	AGT	2	6	16226	16231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
304	NC_007971	TTGA	2	8	16355	16362	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
305	NC_007971	ATG	2	6	16379	16384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
306	NC_007971	GAAGGT	2	12	16429	16440	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	94152451
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312	NC_007971	GCG	2	6	16693	16698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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322	NC_007971	CTC	2	6	17494	17499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94152450
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357	NC_007971	TAT	2	6	19123	19128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
358	NC_007971	TTA	2	6	19138	19143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
359	NC_007971	GCG	2	6	19160	19165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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362	NC_007971	TGC	2	6	19511	19516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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364	NC_007971	A	6	6	19569	19574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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366	NC_007971	GCG	2	6	19915	19920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
367	NC_007971	TTG	2	6	19922	19927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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373	NC_007971	GCA	2	6	20245	20250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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380	NC_007971	GTC	2	6	20683	20688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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401	NC_007971	CGC	2	6	21712	21717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152445
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403	NC_007971	ATCC	2	8	21762	21769	25 %	25 %	0 %	50 %	94152445
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408	NC_007971	CTC	2	6	21920	21925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94152445
409	NC_007971	GGTTG	2	10	21939	21948	0 %	40 %	60 %	0 %	94152445
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411	NC_007971	TCG	3	9	22005	22013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152445
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