MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 plasmid pMOL30

Total Repeats: 4624

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_007971	TGTTC	2	10	151773	151782	0 %	60 %	20 %	20 %	94152547
3002	NC_007971	GCT	2	6	151824	151829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152547
3003	NC_007971	CGAT	2	8	151832	151839	25 %	25 %	25 %	25 %	94152547
3004	NC_007971	GGT	2	6	151881	151886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94152547
3005	NC_007971	CAG	2	6	152050	152055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152547
3006	NC_007971	TGA	2	6	152259	152264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152547
3007	NC_007971	GT	3	6	152267	152272	0 %	50 %	50 %	0 %	94152547
3008	NC_007971	TGC	2	6	152397	152402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152547
3009	NC_007971	GCC	2	6	152410	152415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152547
3010	NC_007971	GGA	2	6	152451	152456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94152547
3011	NC_007971	GGTG	2	8	152469	152476	0 %	25 %	75 %	0 %	94152547
3012	NC_007971	GTGC	2	8	152512	152519	0 %	25 %	50 %	25 %	94152547
3013	NC_007971	GC	3	6	152524	152529	0 %	0 %	50 %	50 %	94152547
3014	NC_007971	CGG	2	6	152537	152542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152547
3015	NC_007971	CG	3	6	152552	152557	0 %	0 %	50 %	50 %	94152547
3016	NC_007971	CGTC	2	8	152606	152613	0 %	25 %	25 %	50 %	94152547
3017	NC_007971	GC	3	6	152678	152683	0 %	0 %	50 %	50 %	94152547
3018	NC_007971	GCC	2	6	152760	152765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152547
3019	NC_007971	CCA	2	6	152813	152818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94152547
3020	NC_007971	TGG	2	6	152840	152845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94152547
3021	NC_007971	TGG	3	9	152858	152866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94152547
3022	NC_007971	CTG	3	9	152878	152886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152547
3023	NC_007971	GC	3	6	152895	152900	0 %	0 %	50 %	50 %	94152547
3024	NC_007971	TGA	2	6	152984	152989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152547
3025	NC_007971	ATC	2	6	153016	153021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152547
3026	NC_007971	ATC	2	6	153034	153039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152547
3027	NC_007971	GCG	2	6	153054	153059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152547
3028	NC_007971	GTC	2	6	153086	153091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152547
3029	NC_007971	GTC	2	6	153129	153134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152547
3030	NC_007971	TGA	2	6	153242	153247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152547
3031	NC_007971	GCTGGC	2	12	153255	153266	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	94152547
3032	NC_007971	GCTG	2	8	153306	153313	0 %	25 %	50 %	25 %	94152547
3033	NC_007971	TGC	2	6	153314	153319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152547
3034	NC_007971	TCG	2	6	153356	153361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152547
3035	NC_007971	GCGG	2	8	153393	153400	0 %	0 %	75 %	25 %	94152547
3036	NC_007971	TGCTGG	2	12	153434	153445	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	94152547
3037	NC_007971	GTCG	2	8	153472	153479	0 %	25 %	50 %	25 %	94152547
3038	NC_007971	TCC	2	6	153520	153525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94152547
3039	NC_007971	CATCGA	2	12	153536	153547	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	94152547
3040	NC_007971	GATT	2	8	153564	153571	25 %	50 %	25 %	0 %	94152547
3041	NC_007971	GGC	2	6	153645	153650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152547
3042	NC_007971	GCC	2	6	153660	153665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152547
3043	NC_007971	CAT	2	6	153684	153689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152547
3044	NC_007971	ACC	2	6	153724	153729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94152547
3045	NC_007971	TGG	2	6	153773	153778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94152547
3046	NC_007971	CAA	2	6	153780	153785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94152547
3047	NC_007971	ACG	2	6	153788	153793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152547
3048	NC_007971	ACCCA	2	10	153796	153805	40 %	0 %	0 %	60 %	94152547
3049	NC_007971	CGA	2	6	153879	153884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152547
3050	NC_007971	GCC	2	6	153910	153915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152547
3051	NC_007971	CGC	2	6	153999	154004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152547
3052	NC_007971	CG	3	6	154008	154013	0 %	0 %	50 %	50 %	94152547
3053	NC_007971	GAAG	2	8	154029	154036	50 %	0 %	50 %	0 %	94152547
3054	NC_007971	GCC	2	6	154067	154072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152547
3055	NC_007971	GC	3	6	154160	154165	0 %	0 %	50 %	50 %	94152547
3056	NC_007971	TGC	2	6	154175	154180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152547
3057	NC_007971	GCC	2	6	154183	154188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152547
3058	NC_007971	CA	3	6	154242	154247	50 %	0 %	0 %	50 %	94152547
3059	NC_007971	GGGC	2	8	154308	154315	0 %	0 %	75 %	25 %	94152547
3060	NC_007971	TGC	3	9	154341	154349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152547
3061	NC_007971	CG	3	6	154356	154361	0 %	0 %	50 %	50 %	94152547
3062	NC_007971	GGC	2	6	154399	154404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152547
3063	NC_007971	CGC	2	6	154473	154478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152547
3064	NC_007971	GCAAT	2	10	154499	154508	40 %	20 %	20 %	20 %	94152547
3065	NC_007971	CTGGCG	2	12	154540	154551	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	94152547
3066	NC_007971	ACT	2	6	154566	154571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152547
3067	NC_007971	GCA	2	6	154600	154605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152547
3068	NC_007971	TGG	2	6	154757	154762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94152547
3069	NC_007971	TGG	2	6	154901	154906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94152547
3070	NC_007971	CGA	2	6	154938	154943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152547
3071	NC_007971	AGG	2	6	154958	154963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94152547
3072	NC_007971	GAACC	2	10	154985	154994	40 %	0 %	20 %	40 %	94152546
3073	NC_007971	CTGG	2	8	155079	155086	0 %	25 %	50 %	25 %	94152546
3074	NC_007971	TTG	2	6	155200	155205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94152546
3075	NC_007971	TGG	2	6	155227	155232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94152546
3076	NC_007971	CGG	2	6	155302	155307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152546
3077	NC_007971	TCCT	2	8	155344	155351	0 %	50 %	0 %	50 %	94152546
3078	NC_007971	GCC	2	6	155430	155435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152546
3079	NC_007971	CGG	2	6	155471	155476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152546
3080	NC_007971	TCG	2	6	155509	155514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152546
3081	NC_007971	CGC	2	6	155639	155644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152546
3082	NC_007971	GCC	3	9	155646	155654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152546
3083	NC_007971	GTC	2	6	155679	155684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152546
3084	NC_007971	AAGC	2	8	155693	155700	50 %	0 %	25 %	25 %	94152546
3085	NC_007971	GGC	2	6	155735	155740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152546
3086	NC_007971	GCG	2	6	155821	155826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152546
3087	NC_007971	CTG	2	6	155904	155909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152546
3088	NC_007971	CTG	2	6	155964	155969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152546
3089	NC_007971	CGG	2	6	155977	155982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152546
3090	NC_007971	TGC	2	6	156008	156013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152546
3091	NC_007971	GCTG	2	8	156037	156044	0 %	25 %	50 %	25 %	94152546
3092	NC_007971	GCA	2	6	156093	156098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152546
3093	NC_007971	TGCG	2	8	156110	156117	0 %	25 %	50 %	25 %	94152546
3094	NC_007971	TGT	2	6	156122	156127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94152546
3095	NC_007971	CAG	2	6	156157	156162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152546
3096	NC_007971	CAG	2	6	156296	156301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_007971	GGC	2	6	156359	156364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_007971	GCA	3	9	156401	156409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_007971	G	6	6	156517	156522	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_007971	CGC	2	6	156538	156543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3101	NC_007971	CGA	2	6	156556	156561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_007971	GTGG	2	8	156617	156624	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_007971	AGG	2	6	156716	156721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_007971	AGC	2	6	156760	156765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_007971	GC	4	8	156928	156935	0 %	0 %	50 %	50 %	94152545
3106	NC_007971	GCTG	2	8	156952	156959	0 %	25 %	50 %	25 %	94152545
3107	NC_007971	CCGT	2	8	156977	156984	0 %	25 %	25 %	50 %	94152545
3108	NC_007971	CGG	2	6	157017	157022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152545
3109	NC_007971	GCG	2	6	157058	157063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152545
3110	NC_007971	CTT	2	6	157084	157089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94152545
3111	NC_007971	GTCT	2	8	157121	157128	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3112	NC_007971	TGC	2	6	157388	157393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152544
3113	NC_007971	CGA	2	6	157567	157572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152544
3114	NC_007971	CGG	2	6	157578	157583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152544
3115	NC_007971	CGTC	2	8	157596	157603	0 %	25 %	25 %	50 %	94152544
3116	NC_007971	GCG	2	6	157605	157610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152544
3117	NC_007971	GAG	2	6	157611	157616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94152544
3118	NC_007971	AGA	2	6	157729	157734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94152544
3119	NC_007971	CGG	2	6	157735	157740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152544
3120	NC_007971	TAG	2	6	157809	157814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_007971	TGC	2	6	157912	157917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_007971	TGCG	2	8	157926	157933	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3123	NC_007971	CGT	2	6	157991	157996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152543
3124	NC_007971	GC	3	6	158008	158013	0 %	0 %	50 %	50 %	94152543
3125	NC_007971	GC	3	6	158065	158070	0 %	0 %	50 %	50 %	94152543
3126	NC_007971	CGA	3	9	158146	158154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152543
3127	NC_007971	CGC	2	6	158203	158208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152543
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3130	NC_007971	CGA	2	6	158424	158429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152542
3131	NC_007971	TCT	2	6	158433	158438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94152542
3132	NC_007971	GAC	2	6	158450	158455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152542
3133	NC_007971	ACG	2	6	158530	158535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152542
3134	NC_007971	TCG	2	6	158701	158706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152542
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3136	NC_007971	CGGC	2	8	158885	158892	0 %	0 %	50 %	50 %	94152542
3137	NC_007971	GCGG	2	8	158992	158999	0 %	0 %	75 %	25 %	94152542
3138	NC_007971	ACG	2	6	159042	159047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152542
3139	NC_007971	CAT	2	6	159088	159093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152542
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3141	NC_007971	CTA	2	6	159133	159138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152542
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3146	NC_007971	GTCGA	2	10	159419	159428	20 %	20 %	40 %	20 %	94152542
3147	NC_007971	CG	3	6	159430	159435	0 %	0 %	50 %	50 %	94152542
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3152	NC_007971	CG	3	6	159674	159679	0 %	0 %	50 %	50 %	94152542
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3156	NC_007971	ATTC	2	8	159805	159812	25 %	50 %	0 %	25 %	94152542
3157	NC_007971	CGAT	2	8	159903	159910	25 %	25 %	25 %	25 %	94152542
3158	NC_007971	CAGG	2	8	159961	159968	25 %	0 %	50 %	25 %	94152542
3159	NC_007971	TGC	2	6	159975	159980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152542
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3166	NC_007971	CG	3	6	160477	160482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3167	NC_007971	GCCG	2	8	160574	160581	0 %	0 %	50 %	50 %	94152541
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3172	NC_007971	GCGCA	2	10	160892	160901	20 %	0 %	40 %	40 %	94152541
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3193	NC_007971	TG	3	6	162155	162160	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3216	NC_007971	CAT	2	6	163307	163312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291464764
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3230	NC_007971	GGT	2	6	163947	163952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94152538
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3237	NC_007971	GCA	2	6	164053	164058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152538
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3243	NC_007971	CAG	2	6	164340	164345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152538
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3246	NC_007971	TAGA	2	8	164418	164425	50 %	25 %	25 %	0 %	94152538
3247	NC_007971	GAT	2	6	164436	164441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152538
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3250	NC_007971	CGG	2	6	164555	164560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152538
3251	NC_007971	CACG	2	8	164570	164577	25 %	0 %	25 %	50 %	94152538
3252	NC_007971	TCG	2	6	164758	164763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152538
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3330	NC_007971	GA	3	6	168758	168763	50 %	0 %	50 %	0 %	94152536
3331	NC_007971	TGC	2	6	168832	168837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152536
3332	NC_007971	TCTG	2	8	168839	168846	0 %	50 %	25 %	25 %	94152536
3333	NC_007971	TTC	2	6	169022	169027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94152536
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3335	NC_007971	CGG	2	6	169179	169184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152536
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3338	NC_007971	GCA	2	6	169302	169307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152536
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3352	NC_007971	TGCC	2	8	169745	169752	0 %	25 %	25 %	50 %	94152536
3353	NC_007971	GGATT	2	10	169774	169783	20 %	40 %	40 %	0 %	94152536
3354	NC_007971	GC	3	6	169787	169792	0 %	0 %	50 %	50 %	94152536
3355	NC_007971	CAC	2	6	169828	169833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94152536
3356	NC_007971	GGC	2	6	169882	169887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152536
3357	NC_007971	GCGA	2	8	169904	169911	25 %	0 %	50 %	25 %	94152536
3358	NC_007971	CCG	2	6	169915	169920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152536
3359	NC_007971	CG	3	6	169923	169928	0 %	0 %	50 %	50 %	94152536
3360	NC_007971	GAC	2	6	169985	169990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3361	NC_007971	GGA	2	6	170043	170048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94152535
3362	NC_007971	GCGG	2	8	170055	170062	0 %	0 %	75 %	25 %	94152535
3363	NC_007971	GTCAG	2	10	170120	170129	20 %	20 %	40 %	20 %	94152535
3364	NC_007971	GCC	2	6	170153	170158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152535
3365	NC_007971	TGG	2	6	170207	170212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94152535
3366	NC_007971	GGC	2	6	170338	170343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152535
3367	NC_007971	AGG	2	6	170406	170411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94152535
3368	NC_007971	AGC	2	6	170446	170451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3369	NC_007971	TCGG	2	8	170530	170537	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3370	NC_007971	CGA	2	6	170544	170549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3371	NC_007971	GGC	2	6	170612	170617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3372	NC_007971	TG	3	6	170625	170630	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3373	NC_007971	CT	3	6	170653	170658	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3499	NC_007971	CTA	3	9	176714	176722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3500	NC_007971	CTG	2	6	176739	176744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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