MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chromohalobacter salexigens DSM 3043 chromosome

Total Repeats: 85586

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_007963	CTGGG	2	10	127927	127936	0 %	20 %	60 %	20 %	92112238
3002	NC_007963	TCG	2	6	127937	127942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112238
3003	NC_007963	CG	3	6	127977	127982	0 %	0 %	50 %	50 %	92112238
3004	NC_007963	GC	3	6	127984	127989	0 %	0 %	50 %	50 %	92112238
3005	NC_007963	ACG	2	6	128030	128035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112238
3006	NC_007963	CGG	2	6	128039	128044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112238
3007	NC_007963	CG	3	6	128062	128067	0 %	0 %	50 %	50 %	92112238
3008	NC_007963	GC	3	6	128083	128088	0 %	0 %	50 %	50 %	92112238
3009	NC_007963	GGA	2	6	128091	128096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92112238
3010	NC_007963	CTG	2	6	128164	128169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112238
3011	NC_007963	CAG	2	6	128179	128184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112238
3012	NC_007963	CTG	2	6	128224	128229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112238
3013	NC_007963	GCAC	2	8	128290	128297	25 %	0 %	25 %	50 %	92112238
3014	NC_007963	AGC	2	6	128300	128305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112238
3015	NC_007963	TGC	2	6	128315	128320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112238
3016	NC_007963	CGA	2	6	128385	128390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112238
3017	NC_007963	GCGA	2	8	128407	128414	25 %	0 %	50 %	25 %	92112238
3018	NC_007963	CTG	2	6	128446	128451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112238
3019	NC_007963	GGT	2	6	128556	128561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112238
3020	NC_007963	CCGG	2	8	128640	128647	0 %	0 %	50 %	50 %	92112238
3021	NC_007963	TCT	2	6	128741	128746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	92112238
3022	NC_007963	GATGAC	2	12	128764	128775	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	92112238
3023	NC_007963	CTG	2	6	128891	128896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112239
3024	NC_007963	GGC	2	6	128980	128985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112239
3025	NC_007963	TGG	2	6	129012	129017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112239
3026	NC_007963	CG	3	6	129033	129038	0 %	0 %	50 %	50 %	92112239
3027	NC_007963	TTC	2	6	129050	129055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	92112239
3028	NC_007963	CGG	2	6	129243	129248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112239
3029	NC_007963	CGG	2	6	129268	129273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112239
3030	NC_007963	CTG	2	6	129281	129286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112239
3031	NC_007963	CCG	2	6	129302	129307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112239
3032	NC_007963	GCC	2	6	129319	129324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112239
3033	NC_007963	CGC	2	6	129459	129464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3034	NC_007963	GCC	2	6	129602	129607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112240
3035	NC_007963	CGG	2	6	129632	129637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112240
3036	NC_007963	GCA	2	6	129707	129712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112240
3037	NC_007963	GAC	2	6	129744	129749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112240
3038	NC_007963	ACC	2	6	129795	129800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	92112240
3039	NC_007963	GC	4	8	129831	129838	0 %	0 %	50 %	50 %	92112240
3040	NC_007963	GGCG	2	8	129853	129860	0 %	0 %	75 %	25 %	92112240
3041	NC_007963	GCT	2	6	129878	129883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112240
3042	NC_007963	CGA	2	6	129938	129943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112240
3043	NC_007963	GAT	2	6	129987	129992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92112240
3044	NC_007963	GCC	3	9	129995	130003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112240
3045	NC_007963	TCGC	2	8	130022	130029	0 %	25 %	25 %	50 %	92112240
3046	NC_007963	CGG	2	6	130035	130040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112240
3047	NC_007963	CGG	2	6	130089	130094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112240
3048	NC_007963	CGTG	2	8	130142	130149	0 %	25 %	50 %	25 %	92112240
3049	NC_007963	GCG	2	6	130150	130155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112240
3050	NC_007963	GCG	2	6	130188	130193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112240
3051	NC_007963	CGAC	2	8	130195	130202	25 %	0 %	25 %	50 %	92112240
3052	NC_007963	GCAC	2	8	130282	130289	25 %	0 %	25 %	50 %	92112240
3053	NC_007963	TGC	3	9	130348	130356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112240
3054	NC_007963	TGC	2	6	130381	130386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112240
3055	NC_007963	CGA	2	6	130450	130455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112240
3056	NC_007963	GCT	2	6	130538	130543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112241
3057	NC_007963	CGT	2	6	130556	130561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112241
3058	NC_007963	GGC	2	6	130605	130610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112241
3059	NC_007963	GGC	2	6	130652	130657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112241
3060	NC_007963	TCGTTG	2	12	130699	130710	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	92112241
3061	NC_007963	CGC	2	6	130716	130721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112241
3062	NC_007963	CGG	2	6	130727	130732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112241
3063	NC_007963	CAG	2	6	130752	130757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112241
3064	NC_007963	GC	5	10	130830	130839	0 %	0 %	50 %	50 %	92112241
3065	NC_007963	GTC	2	6	130869	130874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112241
3066	NC_007963	GCC	2	6	130927	130932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112241
3067	NC_007963	TTG	2	6	130933	130938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	92112241
3068	NC_007963	CTT	2	6	130962	130967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	92112241
3069	NC_007963	GTTT	2	8	131041	131048	0 %	75 %	25 %	0 %	92112241
3070	NC_007963	GTTA	2	8	131160	131167	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_007963	GAG	2	6	131221	131226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_007963	GTTG	2	8	131243	131250	0 %	50 %	50 %	0 %	92112242
3073	NC_007963	GGC	2	6	131262	131267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112242
3074	NC_007963	CAG	2	6	131307	131312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112242
3075	NC_007963	TGGC	2	8	131323	131330	0 %	25 %	50 %	25 %	92112242
3076	NC_007963	GCC	2	6	131344	131349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112242
3077	NC_007963	TTG	2	6	131356	131361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	92112242
3078	NC_007963	CGTGC	2	10	131371	131380	0 %	20 %	40 %	40 %	92112242
3079	NC_007963	GGCA	2	8	131430	131437	25 %	0 %	50 %	25 %	92112242
3080	NC_007963	GGT	2	6	131439	131444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112242
3081	NC_007963	TGG	2	6	131510	131515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112242
3082	NC_007963	CGC	2	6	131550	131555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112242
3083	NC_007963	TTGG	2	8	131615	131622	0 %	50 %	50 %	0 %	92112243
3084	NC_007963	GTC	2	6	131658	131663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112243
3085	NC_007963	CG	3	6	131669	131674	0 %	0 %	50 %	50 %	92112243
3086	NC_007963	CGG	2	6	131699	131704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112243
3087	NC_007963	CCTGGC	2	12	131744	131755	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	92112243
3088	NC_007963	CTGT	2	8	131809	131816	0 %	50 %	25 %	25 %	92112243
3089	NC_007963	GCT	2	6	131912	131917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112243
3090	NC_007963	TCTA	2	8	131937	131944	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3091	NC_007963	TAG	2	6	131983	131988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_007963	TCAC	2	8	132024	132031	25 %	25 %	0 %	50 %	92112244
3093	NC_007963	GCC	3	9	132082	132090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112244
3094	NC_007963	GCC	2	6	132100	132105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112244
3095	NC_007963	CAA	2	6	132124	132129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	92112244
3096	NC_007963	ACG	2	6	132172	132177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112244
3097	NC_007963	GCGT	2	8	132188	132195	0 %	25 %	50 %	25 %	92112244
3098	NC_007963	CAGC	2	8	132249	132256	25 %	0 %	25 %	50 %	92112244
3099	NC_007963	ACG	2	6	132278	132283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112244
3100	NC_007963	GAT	3	9	132295	132303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92112244
3101	NC_007963	GCTG	2	8	132308	132315	0 %	25 %	50 %	25 %	92112244
3102	NC_007963	ACA	2	6	132329	132334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	92112244
3103	NC_007963	CCG	2	6	132353	132358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112244
3104	NC_007963	CAC	2	6	132378	132383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3105	NC_007963	CCG	2	6	132436	132441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3106	NC_007963	GACG	2	8	132514	132521	25 %	0 %	50 %	25 %	92112245
3107	NC_007963	GTC	2	6	132536	132541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112245
3108	NC_007963	TGT	3	9	132556	132564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	92112245
3109	NC_007963	GTA	2	6	132605	132610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92112245
3110	NC_007963	TGC	3	9	132637	132645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112245
3111	NC_007963	GC	3	6	132815	132820	0 %	0 %	50 %	50 %	92112245
3112	NC_007963	CCG	2	6	132900	132905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112245
3113	NC_007963	GCGCG	2	10	133001	133010	0 %	0 %	60 %	40 %	92112245
3114	NC_007963	TGA	2	6	133015	133020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92112245
3115	NC_007963	CGC	2	6	133030	133035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112245
3116	NC_007963	TCG	2	6	133044	133049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112245
3117	NC_007963	CGT	2	6	133054	133059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112245
3118	NC_007963	CGA	2	6	133096	133101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112245
3119	NC_007963	CGCC	2	8	133110	133117	0 %	0 %	25 %	75 %	92112245
3120	NC_007963	GTC	2	6	133208	133213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112245
3121	NC_007963	ACT	2	6	133253	133258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92112245
3122	NC_007963	TGG	2	6	133267	133272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112245
3123	NC_007963	CTTG	2	8	133295	133302	0 %	50 %	25 %	25 %	92112245
3124	NC_007963	GTC	2	6	133305	133310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112245
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3248	NC_007963	CGG	2	6	138272	138277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112249
3249	NC_007963	CGC	2	6	138365	138370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3250	NC_007963	GAA	2	6	138376	138381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3251	NC_007963	GTC	2	6	138398	138403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112250
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3253	NC_007963	CAT	2	6	138428	138433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92112250
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3269	NC_007963	CGC	2	6	139153	139158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3271	NC_007963	TGG	2	6	139177	139182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3359	NC_007963	CCG	2	6	143214	143219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112255
3360	NC_007963	CGC	2	6	143292	143297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3361	NC_007963	TGC	2	6	143445	143450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112256
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3370	NC_007963	ATC	2	6	143687	143692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92112256
3371	NC_007963	CGGT	2	8	143700	143707	0 %	25 %	50 %	25 %	92112256
3372	NC_007963	GCT	2	6	143782	143787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112256
3373	NC_007963	TGC	2	6	143817	143822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112256
3374	NC_007963	AGCCTG	2	12	143846	143857	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	92112256
3375	NC_007963	TCA	2	6	143871	143876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92112256
3376	NC_007963	TGG	2	6	143946	143951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112256
3377	NC_007963	TCG	2	6	143955	143960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112256
3378	NC_007963	CGC	2	6	143990	143995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112256
3379	NC_007963	CTGG	2	8	144028	144035	0 %	25 %	50 %	25 %	92112256
3380	NC_007963	ATC	2	6	144047	144052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92112256
3381	NC_007963	CGC	2	6	144057	144062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112256
3382	NC_007963	CTG	2	6	144074	144079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112256
3383	NC_007963	GCG	3	9	144132	144140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112256
3384	NC_007963	CGC	2	6	144160	144165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112256
3385	NC_007963	CG	3	6	144261	144266	0 %	0 %	50 %	50 %	92112256
3386	NC_007963	ACCTGA	2	12	144354	144365	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	92112256
3387	NC_007963	CTC	2	6	144373	144378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	92112256
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3389	NC_007963	GAC	2	6	144427	144432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112256
3390	NC_007963	GGCCA	2	10	144446	144455	20 %	0 %	40 %	40 %	92112256
3391	NC_007963	TGA	2	6	144516	144521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92112256
3392	NC_007963	CG	3	6	144532	144537	0 %	0 %	50 %	50 %	92112256
3393	NC_007963	TGA	2	6	144581	144586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92112257
3394	NC_007963	GAT	2	6	144587	144592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92112257
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3397	NC_007963	GGT	2	6	144634	144639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112257
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3399	NC_007963	GGT	2	6	144683	144688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112257
3400	NC_007963	GCT	2	6	144698	144703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112257
3401	NC_007963	TCA	2	6	144805	144810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92112257
3402	NC_007963	GC	3	6	144811	144816	0 %	0 %	50 %	50 %	92112257
3403	NC_007963	ATC	2	6	144828	144833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92112257
3404	NC_007963	GCC	2	6	144852	144857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112257
3405	NC_007963	CTG	2	6	144897	144902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112257
3406	NC_007963	CTGG	2	8	144905	144912	0 %	25 %	50 %	25 %	92112257
3407	NC_007963	TGC	3	9	144985	144993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112257
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3409	NC_007963	CTGACC	2	12	145050	145061	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	92112257
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3413	NC_007963	GTG	2	6	145155	145160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112257
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3421	NC_007963	GGGC	2	8	145322	145329	0 %	0 %	75 %	25 %	92112257
3422	NC_007963	TGC	2	6	145408	145413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112257
3423	NC_007963	ATC	2	6	145491	145496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92112257
3424	NC_007963	CTG	2	6	145509	145514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112257
3425	NC_007963	CG	3	6	145524	145529	0 %	0 %	50 %	50 %	92112257
3426	NC_007963	CGC	2	6	145580	145585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112257
3427	NC_007963	GA	3	6	145638	145643	50 %	0 %	50 %	0 %	92112257
3428	NC_007963	ATCGA	2	10	145680	145689	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3429	NC_007963	CAT	2	6	145714	145719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92112258
3430	NC_007963	AGCGAC	2	12	145726	145737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112258
3431	NC_007963	GAT	2	6	145756	145761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92112258
3432	NC_007963	CAA	2	6	145777	145782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	92112258
3433	NC_007963	ATCA	2	8	145895	145902	50 %	25 %	0 %	25 %	92112258
3434	NC_007963	CCG	2	6	145981	145986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112258
3435	NC_007963	CTG	2	6	146047	146052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112258
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3438	NC_007963	CAG	3	9	146177	146185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112258
3439	NC_007963	CGCT	2	8	146201	146208	0 %	25 %	25 %	50 %	92112258
3440	NC_007963	CGA	2	6	146236	146241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112258
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3444	NC_007963	ATC	2	6	146396	146401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92112258
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3449	NC_007963	GCTG	2	8	146540	146547	0 %	25 %	50 %	25 %	92112259
3450	NC_007963	GC	3	6	146554	146559	0 %	0 %	50 %	50 %	92112259
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3454	NC_007963	GTCG	2	8	146714	146721	0 %	25 %	50 %	25 %	92112259
3455	NC_007963	TCA	2	6	146732	146737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92112259
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3470	NC_007963	CG	3	6	147310	147315	0 %	0 %	50 %	50 %	92112260
3471	NC_007963	CAGG	2	8	147335	147342	25 %	0 %	50 %	25 %	92112260
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3473	NC_007963	CGG	2	6	147409	147414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112260
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3483	NC_007963	GAA	2	6	147671	147676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	92112260
3484	NC_007963	GAA	2	6	147734	147739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3485	NC_007963	TAA	2	6	147774	147779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3486	NC_007963	TGG	2	6	147840	147845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112261
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3489	NC_007963	CAG	2	6	147911	147916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112261
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3491	NC_007963	C	6	6	148018	148023	0 %	0 %	0 %	100 %	92112261
3492	NC_007963	ACG	2	6	148035	148040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112261
3493	NC_007963	CCG	2	6	148065	148070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112261
3494	NC_007963	CGGC	2	8	148071	148078	0 %	0 %	50 %	50 %	92112261
3495	NC_007963	C	6	6	148142	148147	0 %	0 %	0 %	100 %	92112261
3496	NC_007963	CCCA	2	8	148160	148167	25 %	0 %	0 %	75 %	92112261
3497	NC_007963	GGT	2	6	148207	148212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112261
3498	NC_007963	TGG	2	6	148248	148253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112261
3499	NC_007963	AGC	2	6	148364	148369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112261
3500	NC_007963	GAC	2	6	148391	148396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112261

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