MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chromohalobacter salexigens DSM 3043 chromosome

Total Repeats: 85586

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_007963	CTT	2	6	660874	660879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	92112726
15003	NC_007963	CAG	2	6	660916	660921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112726
15004	NC_007963	GCCGA	2	10	660976	660985	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15005	NC_007963	GCC	2	6	661002	661007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112727
15006	NC_007963	CGT	2	6	661147	661152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112727
15007	NC_007963	GGC	2	6	661172	661177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112727
15008	NC_007963	CAG	2	6	661178	661183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112727
15009	NC_007963	TTG	2	6	661221	661226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	92112727
15010	NC_007963	GGC	2	6	661276	661281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112727
15011	NC_007963	ATG	2	6	661323	661328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92112727
15012	NC_007963	GATG	3	12	661352	661363	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15013	NC_007963	GTG	2	6	661388	661393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15014	NC_007963	GCG	4	12	661427	661438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112728
15015	NC_007963	GCCAG	2	10	661482	661491	20 %	0 %	40 %	40 %	92112728
15016	NC_007963	GGCCAG	3	18	661486	661503	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	92112728
15017	NC_007963	CAA	2	6	661504	661509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	92112728
15018	NC_007963	AAGCGC	2	12	661517	661528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112728
15019	NC_007963	CTG	2	6	661585	661590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112728
15020	NC_007963	GC	3	6	661618	661623	0 %	0 %	50 %	50 %	92112728
15021	NC_007963	GC	3	6	661718	661723	0 %	0 %	50 %	50 %	92112728
15022	NC_007963	CAGGTC	2	12	661765	661776	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	92112728
15023	NC_007963	GCA	3	9	661824	661832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112728
15024	NC_007963	CG	3	6	661865	661870	0 %	0 %	50 %	50 %	92112728
15025	NC_007963	CAG	2	6	661885	661890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112728
15026	NC_007963	GGC	3	9	661954	661962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112728
15027	NC_007963	TCT	2	6	661982	661987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	92112728
15028	NC_007963	GCA	2	6	662010	662015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112728
15029	NC_007963	GTA	2	6	662026	662031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92112728
15030	NC_007963	AAG	2	6	662042	662047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	92112728
15031	NC_007963	CGA	2	6	662097	662102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112728
15032	NC_007963	GAA	2	6	662185	662190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	92112728
15033	NC_007963	GAA	2	6	662212	662217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	92112728
15034	NC_007963	CGC	2	6	662226	662231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112728
15035	NC_007963	GGCGA	2	10	662236	662245	20 %	0 %	60 %	20 %	92112728
15036	NC_007963	GCCG	2	8	662257	662264	0 %	0 %	50 %	50 %	92112728
15037	NC_007963	AGC	2	6	662363	662368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112728
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15039	NC_007963	TCG	2	6	662432	662437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112728
15040	NC_007963	CAG	2	6	662527	662532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112728
15041	NC_007963	GAT	2	6	662572	662577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92112728
15042	NC_007963	CGC	2	6	662595	662600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112728
15043	NC_007963	GC	4	8	662608	662615	0 %	0 %	50 %	50 %	92112728
15044	NC_007963	GGAGGC	2	12	662632	662643	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	92112728
15045	NC_007963	TCG	2	6	662765	662770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112728
15046	NC_007963	GCA	2	6	662784	662789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112728
15047	NC_007963	CAGACG	2	12	662854	662865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112728
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15049	NC_007963	GCA	2	6	662928	662933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112728
15050	NC_007963	GC	3	6	662977	662982	0 %	0 %	50 %	50 %	92112728
15051	NC_007963	ACC	2	6	662984	662989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	92112728
15052	NC_007963	ACG	2	6	663017	663022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112728
15053	NC_007963	CTC	2	6	663027	663032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	92112729
15054	NC_007963	CGG	2	6	663037	663042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112729
15055	NC_007963	GC	3	6	663072	663077	0 %	0 %	50 %	50 %	92112729
15056	NC_007963	CGGT	2	8	663085	663092	0 %	25 %	50 %	25 %	92112729
15057	NC_007963	CG	4	8	663119	663126	0 %	0 %	50 %	50 %	92112729
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15062	NC_007963	CGTG	2	8	663344	663351	0 %	25 %	50 %	25 %	92112729
15063	NC_007963	CAG	2	6	663381	663386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112729
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15097	NC_007963	ATG	2	6	664993	664998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15102	NC_007963	CGT	2	6	665255	665260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112732
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15115	NC_007963	GCTG	2	8	665819	665826	0 %	25 %	50 %	25 %	92112732
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15121	NC_007963	CG	3	6	665987	665992	0 %	0 %	50 %	50 %	92112732
15122	NC_007963	CTC	2	6	666021	666026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	92112732
15123	NC_007963	TCC	2	6	666055	666060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	92112732
15124	NC_007963	GAT	2	6	666108	666113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92112732
15125	NC_007963	TGA	2	6	666170	666175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92112732
15126	NC_007963	ATC	2	6	666241	666246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92112732
15127	NC_007963	GAC	2	6	666261	666266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112732
15128	NC_007963	CGC	2	6	666269	666274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112732
15129	NC_007963	GTC	2	6	666282	666287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112732
15130	NC_007963	GCG	2	6	666297	666302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112732
15131	NC_007963	CTG	2	6	666345	666350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112732
15132	NC_007963	GAT	2	6	666354	666359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92112732
15133	NC_007963	TGC	2	6	666420	666425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15134	NC_007963	GAGCGT	2	12	666430	666441	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15135	NC_007963	CTC	2	6	666451	666456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	92112733
15136	NC_007963	TGA	2	6	666467	666472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92112733
15137	NC_007963	GTGC	2	8	666524	666531	0 %	25 %	50 %	25 %	92112733
15138	NC_007963	AGC	2	6	666551	666556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112733
15139	NC_007963	GC	5	10	666555	666564	0 %	0 %	50 %	50 %	92112733
15140	NC_007963	GCC	2	6	666583	666588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112733
15141	NC_007963	GAT	2	6	666601	666606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92112733
15142	NC_007963	CGA	2	6	666621	666626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112733
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15144	NC_007963	CGGT	2	8	666704	666711	0 %	25 %	50 %	25 %	92112733
15145	NC_007963	CGG	2	6	666735	666740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112733
15146	NC_007963	GCC	2	6	666814	666819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112733
15147	NC_007963	GTG	2	6	666844	666849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112733
15148	NC_007963	GCG	2	6	666853	666858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112733
15149	NC_007963	TCA	2	6	666879	666884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92112733
15150	NC_007963	CGAG	2	8	666894	666901	25 %	0 %	50 %	25 %	92112733
15151	NC_007963	CGC	2	6	666933	666938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112733
15152	NC_007963	ATG	2	6	667057	667062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15153	NC_007963	GCG	2	6	667078	667083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15154	NC_007963	CG	3	6	667082	667087	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15155	NC_007963	CG	3	6	667100	667105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15156	NC_007963	CGC	2	6	667108	667113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15157	NC_007963	CAG	2	6	667132	667137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112734
15158	NC_007963	GC	3	6	667172	667177	0 %	0 %	50 %	50 %	92112734
15159	NC_007963	CG	3	6	667185	667190	0 %	0 %	50 %	50 %	92112734
15160	NC_007963	TCG	2	6	667229	667234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112734
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15162	NC_007963	GGC	2	6	667327	667332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112734
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15169	NC_007963	GCA	2	6	667476	667481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112734
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15175	NC_007963	CTG	2	6	667636	667641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112734
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15179	NC_007963	CGA	2	6	668013	668018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112735
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15182	NC_007963	GGC	2	6	668073	668078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112735
15183	NC_007963	TGC	2	6	668084	668089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112735
15184	NC_007963	GC	3	6	668127	668132	0 %	0 %	50 %	50 %	92112735
15185	NC_007963	CG	3	6	668151	668156	0 %	0 %	50 %	50 %	92112735
15186	NC_007963	GTA	2	6	668173	668178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92112735
15187	NC_007963	CG	3	6	668246	668251	0 %	0 %	50 %	50 %	92112735
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15202	NC_007963	GTC	2	6	668797	668802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112735
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15220	NC_007963	GAT	2	6	669472	669477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92112735
15221	NC_007963	GC	3	6	669513	669518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15222	NC_007963	GGCC	2	8	669557	669564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15223	NC_007963	GCC	3	9	669579	669587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15224	NC_007963	GC	3	6	669599	669604	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15225	NC_007963	GGAG	2	8	669618	669625	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15226	NC_007963	CTCAA	2	10	669644	669653	40 %	20 %	0 %	40 %	92112736
15227	NC_007963	GC	3	6	669679	669684	0 %	0 %	50 %	50 %	92112736
15228	NC_007963	CAGGCG	2	12	669727	669738	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	92112736
15229	NC_007963	GCT	2	6	669747	669752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112736
15230	NC_007963	GGC	2	6	669797	669802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112736
15231	NC_007963	GGGC	2	8	669812	669819	0 %	0 %	75 %	25 %	92112736
15232	NC_007963	CAGG	2	8	669828	669835	25 %	0 %	50 %	25 %	92112736
15233	NC_007963	GCCA	2	8	669856	669863	25 %	0 %	25 %	50 %	92112736
15234	NC_007963	CGG	2	6	669878	669883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112736
15235	NC_007963	GCC	2	6	669919	669924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112736
15236	NC_007963	G	6	6	669954	669959	0 %	0 %	100 %	0 %	92112736
15237	NC_007963	GGCC	2	8	669962	669969	0 %	0 %	50 %	50 %	92112736
15238	NC_007963	CAG	2	6	669984	669989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112736
15239	NC_007963	GTC	2	6	670041	670046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112736
15240	NC_007963	GC	3	6	670087	670092	0 %	0 %	50 %	50 %	92112736
15241	NC_007963	GC	3	6	670096	670101	0 %	0 %	50 %	50 %	92112736
15242	NC_007963	ACC	2	6	670180	670185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	92112736
15243	NC_007963	TGG	2	6	670210	670215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112736
15244	NC_007963	CAG	2	6	670242	670247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112736
15245	NC_007963	CGC	2	6	670256	670261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112736
15246	NC_007963	GCTT	2	8	670291	670298	0 %	50 %	25 %	25 %	92112736
15247	NC_007963	CGATG	2	10	670319	670328	20 %	20 %	40 %	20 %	92112736
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15250	NC_007963	GCCA	2	8	670522	670529	25 %	0 %	25 %	50 %	92112736
15251	NC_007963	TGA	2	6	670574	670579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92112736
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15254	NC_007963	GGCG	2	8	670629	670636	0 %	0 %	75 %	25 %	92112736
15255	NC_007963	GCC	2	6	670644	670649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112736
15256	NC_007963	GCGG	2	8	670655	670662	0 %	0 %	75 %	25 %	92112736
15257	NC_007963	GC	3	6	670708	670713	0 %	0 %	50 %	50 %	92112736
15258	NC_007963	GCGA	2	8	670818	670825	25 %	0 %	50 %	25 %	92112736
15259	NC_007963	CTG	2	6	670860	670865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112736
15260	NC_007963	CGT	2	6	670877	670882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112736
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15263	NC_007963	GCCCG	2	10	670960	670969	0 %	0 %	40 %	60 %	92112736
15264	NC_007963	GC	3	6	670971	670976	0 %	0 %	50 %	50 %	92112736
15265	NC_007963	GGTC	2	8	671003	671010	0 %	25 %	50 %	25 %	92112736
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15269	NC_007963	ACAG	2	8	671186	671193	50 %	0 %	25 %	25 %	92112736
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15275	NC_007963	CGA	2	6	671327	671332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112736
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15277	NC_007963	GGCG	2	8	671388	671395	0 %	0 %	75 %	25 %	92112736
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15281	NC_007963	TCG	2	6	671470	671475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112736
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15292	NC_007963	GCG	2	6	671813	671818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112736
15293	NC_007963	TCC	2	6	671871	671876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15294	NC_007963	GGC	2	6	671890	671895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15295	NC_007963	GCT	2	6	671946	671951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15297	NC_007963	CAT	2	6	672021	672026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15308	NC_007963	T	7	7	672372	672378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15309	NC_007963	CAA	2	6	672447	672452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15310	NC_007963	GTT	2	6	672514	672519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15311	NC_007963	A	6	6	672593	672598	100 %	0 %	0 %	0 %	92112738
15312	NC_007963	GCG	2	6	672604	672609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112738
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15314	NC_007963	CTGGCG	2	12	672685	672696	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	92112738
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15335	NC_007963	GC	3	6	673639	673644	0 %	0 %	50 %	50 %	92112738
15336	NC_007963	CGGG	2	8	673698	673705	0 %	0 %	75 %	25 %	92112738
15337	NC_007963	CGC	2	6	673721	673726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112738
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15340	NC_007963	CGT	2	6	673935	673940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15341	NC_007963	CGT	2	6	674010	674015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112739
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15348	NC_007963	CGT	2	6	674235	674240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112739
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15351	NC_007963	TCG	2	6	674444	674449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112739
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15354	NC_007963	AGC	2	6	674528	674533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112739
15355	NC_007963	GA	3	6	674555	674560	50 %	0 %	50 %	0 %	92112739
15356	NC_007963	CGC	2	6	674583	674588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112739
15357	NC_007963	GCGGG	2	10	674610	674619	0 %	0 %	80 %	20 %	92112739
15358	NC_007963	GCG	2	6	674654	674659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112739
15359	NC_007963	GTG	2	6	674692	674697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112739
15360	NC_007963	TGG	2	6	674709	674714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112739
15361	NC_007963	TCGG	2	8	674737	674744	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15362	NC_007963	AGA	2	6	674806	674811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	92112740
15363	NC_007963	GGTGCC	2	12	674822	674833	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	92112740
15364	NC_007963	GCC	2	6	674921	674926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112740
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