MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chromohalobacter salexigens DSM 3043 chromosome

Total Repeats: 85586

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_007963	GAA	2	6	549673	549678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	92112633
12502	NC_007963	GACCG	2	10	549685	549694	20 %	0 %	40 %	40 %	92112633
12503	NC_007963	GGC	3	9	549736	549744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112633
12504	NC_007963	GAA	2	6	549745	549750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	92112633
12505	NC_007963	CG	4	8	549782	549789	0 %	0 %	50 %	50 %	92112633
12506	NC_007963	GGC	2	6	549853	549858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112633
12507	NC_007963	GTC	2	6	549901	549906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112633
12508	NC_007963	GAA	2	6	549910	549915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	92112633
12509	NC_007963	CCG	2	6	549951	549956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112633
12510	NC_007963	CGG	2	6	550044	550049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112633
12511	NC_007963	TGC	2	6	550068	550073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112633
12512	NC_007963	CGG	2	6	550080	550085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112633
12513	NC_007963	GTA	2	6	550105	550110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92112633
12514	NC_007963	GAA	2	6	550141	550146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	92112633
12515	NC_007963	CAG	2	6	550162	550167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112633
12516	NC_007963	GAA	2	6	550192	550197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	92112633
12517	NC_007963	CTG	2	6	550210	550215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112633
12518	NC_007963	CGGT	2	8	550253	550260	0 %	25 %	50 %	25 %	92112633
12519	NC_007963	GATC	2	8	550272	550279	25 %	25 %	25 %	25 %	92112633
12520	NC_007963	GCA	2	6	550284	550289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112633
12521	NC_007963	CGT	3	9	550305	550313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112633
12522	NC_007963	CCAG	2	8	550326	550333	25 %	0 %	25 %	50 %	92112633
12523	NC_007963	CAG	2	6	550360	550365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112633
12524	NC_007963	CCA	2	6	550398	550403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	92112633
12525	NC_007963	GGCGTC	2	12	550414	550425	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	92112633
12526	NC_007963	CAG	2	6	550426	550431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112633
12527	NC_007963	CGA	2	6	550500	550505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112633
12528	NC_007963	CGG	2	6	550521	550526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112633
12529	NC_007963	GCG	2	6	550553	550558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112633
12530	NC_007963	GCC	2	6	550582	550587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112633
12531	NC_007963	GTCG	2	8	550618	550625	0 %	25 %	50 %	25 %	92112633
12532	NC_007963	GCCGA	2	10	550631	550640	20 %	0 %	40 %	40 %	92112633
12533	NC_007963	GAT	2	6	550666	550671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92112633
12534	NC_007963	CAG	2	6	550672	550677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112633
12535	NC_007963	CGGT	2	8	550697	550704	0 %	25 %	50 %	25 %	92112633
12536	NC_007963	ATG	2	6	550757	550762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92112633
12537	NC_007963	TGC	2	6	550772	550777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112633
12538	NC_007963	CGG	2	6	550830	550835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112633
12539	NC_007963	GAATC	2	10	550952	550961	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12540	NC_007963	GGCAT	2	10	551309	551318	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12541	NC_007963	GCG	2	6	551340	551345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12542	NC_007963	CCG	2	6	551348	551353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12543	NC_007963	TCG	2	6	551364	551369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12544	NC_007963	CGG	2	6	551499	551504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112634
12545	NC_007963	GCC	2	6	551578	551583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112634
12546	NC_007963	CGC	2	6	551589	551594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112634
12547	NC_007963	TG	3	6	551717	551722	0 %	50 %	50 %	0 %	92112634
12548	NC_007963	GCCA	2	8	551731	551738	25 %	0 %	25 %	50 %	92112634
12549	NC_007963	AAG	2	6	551848	551853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	92112634
12550	NC_007963	CCTCG	2	10	551862	551871	0 %	20 %	20 %	60 %	92112634
12551	NC_007963	GTC	2	6	551876	551881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112634
12552	NC_007963	GGT	2	6	551889	551894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112634
12553	NC_007963	GAA	2	6	551952	551957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	92112634
12554	NC_007963	AAG	2	6	552010	552015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	92112634
12555	NC_007963	ATG	2	6	552025	552030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92112634
12556	NC_007963	GCG	2	6	552080	552085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112634
12557	NC_007963	CAC	3	9	552132	552140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	92112634
12558	NC_007963	GCTG	2	8	552188	552195	0 %	25 %	50 %	25 %	92112634
12559	NC_007963	GCAT	2	8	552197	552204	25 %	25 %	25 %	25 %	92112634
12560	NC_007963	ATC	2	6	552247	552252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92112634
12561	NC_007963	GC	4	8	552260	552267	0 %	0 %	50 %	50 %	92112634
12562	NC_007963	GAT	2	6	552271	552276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92112634
12563	NC_007963	CAA	2	6	552285	552290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	92112634
12564	NC_007963	GC	3	6	552363	552368	0 %	0 %	50 %	50 %	92112634
12565	NC_007963	GAT	2	6	552411	552416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92112634
12566	NC_007963	CTG	2	6	552421	552426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112634
12567	NC_007963	GTG	2	6	552465	552470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112634
12568	NC_007963	GC	3	6	552489	552494	0 %	0 %	50 %	50 %	92112634
12569	NC_007963	AGG	2	6	552551	552556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92112634
12570	NC_007963	TCG	2	6	552557	552562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112634
12571	NC_007963	ATCAC	2	10	552572	552581	40 %	20 %	0 %	40 %	92112634
12572	NC_007963	GCG	2	6	552584	552589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112634
12573	NC_007963	ACC	2	6	552601	552606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	92112634
12574	NC_007963	TAC	2	6	552640	552645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92112634
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12582	NC_007963	GATGTC	2	12	553051	553062	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	92112634
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12585	NC_007963	CTG	2	6	553167	553172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112635
12586	NC_007963	GTG	2	6	553200	553205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112635
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12588	NC_007963	CGA	2	6	553301	553306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112635
12589	NC_007963	CAA	2	6	553337	553342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	92112635
12590	NC_007963	TCG	2	6	553363	553368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112635
12591	NC_007963	CGAG	2	8	553391	553398	25 %	0 %	50 %	25 %	92112635
12592	NC_007963	CGA	2	6	553439	553444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112635
12593	NC_007963	TCG	2	6	553480	553485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112635
12594	NC_007963	GCA	2	6	553661	553666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12597	NC_007963	AGCCC	2	10	553881	553890	20 %	0 %	20 %	60 %	92112636
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12599	NC_007963	TGC	2	6	554016	554021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112636
12600	NC_007963	GCCA	2	8	554057	554064	25 %	0 %	25 %	50 %	92112636
12601	NC_007963	GCG	2	6	554097	554102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112636
12602	NC_007963	CGC	2	6	554175	554180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112636
12603	NC_007963	CG	3	6	554187	554192	0 %	0 %	50 %	50 %	92112636
12604	NC_007963	GGC	2	6	554331	554336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112636
12605	NC_007963	GCA	2	6	554358	554363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112636
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12607	NC_007963	GGC	2	6	554593	554598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12608	NC_007963	ACGCA	2	10	554643	554652	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
12609	NC_007963	GAC	2	6	554689	554694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12610	NC_007963	CGG	2	6	554699	554704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12611	NC_007963	TCT	2	6	554735	554740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12612	NC_007963	TTA	2	6	554768	554773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	92112637
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12615	NC_007963	CGGC	2	8	554932	554939	0 %	0 %	50 %	50 %	92112637
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12619	NC_007963	GC	3	6	555113	555118	0 %	0 %	50 %	50 %	92112637
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12621	NC_007963	CGC	2	6	555260	555265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112637
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12991	NC_007963	TGA	2	6	574841	574846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12992	NC_007963	TGG	2	6	574866	574871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112652
12993	NC_007963	TGA	2	6	574955	574960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92112652
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