MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlorobium luteolum DSM 273 chromosome

Total Repeats: 49044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_007512	TTG	2	6	195311	195316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78186084
4002	NC_007512	CAC	2	6	195420	195425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78186084
4003	NC_007512	TCA	2	6	195578	195583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78186084
4004	NC_007512	TCG	2	6	195602	195607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78186084
4005	NC_007512	GCC	2	6	195616	195621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78186084
4006	NC_007512	ATC	2	6	195685	195690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78186084
4007	NC_007512	CGC	2	6	195691	195696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78186084
4008	NC_007512	AAGG	2	8	195697	195704	50 %	0 %	50 %	0 %	78186084
4009	NC_007512	GCA	2	6	195709	195714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78186084
4010	NC_007512	AAGT	2	8	195718	195725	50 %	25 %	25 %	0 %	78186084
4011	NC_007512	CGA	2	6	195902	195907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78186085
4012	NC_007512	AGA	2	6	195916	195921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78186085
4013	NC_007512	CAT	2	6	195923	195928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78186085
4014	NC_007512	GTA	2	6	196044	196049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78186085
4015	NC_007512	TTGTCG	2	12	196270	196281	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	78186086
4016	NC_007512	AAG	2	6	196288	196293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78186086
4017	NC_007512	ATC	2	6	196389	196394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78186086
4018	NC_007512	TCG	2	6	196417	196422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78186086
4019	NC_007512	GGC	2	6	196485	196490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78186086
4020	NC_007512	TCC	2	6	196551	196556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78186086
4021	NC_007512	GTG	2	6	196569	196574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78186086
4022	NC_007512	AGC	2	6	196577	196582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78186086
4023	NC_007512	ATG	2	6	196615	196620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78186086
4024	NC_007512	GA	3	6	196626	196631	50 %	0 %	50 %	0 %	78186086
4025	NC_007512	A	6	6	196694	196699	100 %	0 %	0 %	0 %	78186087
4026	NC_007512	GCA	2	6	196719	196724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78186087
4027	NC_007512	A	6	6	196739	196744	100 %	0 %	0 %	0 %	78186087
4028	NC_007512	CCA	2	6	196752	196757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78186087
4029	NC_007512	GTC	2	6	196835	196840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78186087
4030	NC_007512	A	6	6	196943	196948	100 %	0 %	0 %	0 %	78186088
4031	NC_007512	CAC	2	6	196988	196993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78186088
4032	NC_007512	CAA	2	6	197006	197011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78186088
4033	NC_007512	CAG	2	6	197016	197021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78186088
4034	NC_007512	AAG	2	6	197024	197029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78186088
4035	NC_007512	GGT	2	6	197055	197060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78186088
4036	NC_007512	ATT	2	6	197230	197235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78186088
4037	NC_007512	GA	3	6	197254	197259	50 %	0 %	50 %	0 %	78186088
4038	NC_007512	CTG	2	6	197263	197268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78186088
4039	NC_007512	CTG	2	6	197320	197325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78186088
4040	NC_007512	CGG	2	6	197327	197332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78186088
4041	NC_007512	CCGT	2	8	197347	197354	0 %	25 %	25 %	50 %	78186088
4042	NC_007512	CCT	2	6	197402	197407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78186088
4043	NC_007512	AG	3	6	197431	197436	50 %	0 %	50 %	0 %	78186088
4044	NC_007512	CAA	2	6	197507	197512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78186089
4045	NC_007512	CTG	2	6	197553	197558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78186089
4046	NC_007512	CCG	2	6	197608	197613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78186089
4047	NC_007512	TCG	2	6	197625	197630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78186089
4048	NC_007512	TCG	2	6	197668	197673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78186089
4049	NC_007512	CAT	2	6	197711	197716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78186089
4050	NC_007512	ATC	2	6	197736	197741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78186089
4051	NC_007512	GCT	2	6	197747	197752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78186089
4052	NC_007512	CAG	2	6	197784	197789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78186089
4053	NC_007512	GCC	2	6	197803	197808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78186089
4054	NC_007512	AGA	2	6	197809	197814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78186089
4055	NC_007512	TTTTC	2	10	197932	197941	0 %	80 %	0 %	20 %	78186089
4056	NC_007512	TCA	2	6	197953	197958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78186089
4057	NC_007512	TCA	3	9	198037	198045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78186089
4058	NC_007512	CTCG	2	8	198101	198108	0 %	25 %	25 %	50 %	78186089
4059	NC_007512	GCA	2	6	198109	198114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78186089
4060	NC_007512	ATC	2	6	198123	198128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78186089
4061	NC_007512	ATC	2	6	198132	198137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78186089
4062	NC_007512	ATG	2	6	198147	198152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78186089
4063	NC_007512	GTC	2	6	198171	198176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78186089
4064	NC_007512	CGC	2	6	198195	198200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78186089
4065	NC_007512	GGT	2	6	198224	198229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78186089
4066	NC_007512	TGG	2	6	198245	198250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78186089
4067	NC_007512	CCG	2	6	198283	198288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78186089
4068	NC_007512	CAT	2	6	198317	198322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78186089
4069	NC_007512	CTTTC	2	10	198337	198346	0 %	60 %	0 %	40 %	78186089
4070	NC_007512	TTC	2	6	198348	198353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78186089
4071	NC_007512	GTCG	2	8	198374	198381	0 %	25 %	50 %	25 %	78186089
4072	NC_007512	TGG	2	6	198405	198410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78186089
4073	NC_007512	AGG	2	6	198481	198486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78186089
4074	NC_007512	GCC	2	6	198502	198507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78186089
4075	NC_007512	GGC	2	6	198510	198515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78186089
4076	NC_007512	CCGGC	2	10	198530	198539	0 %	0 %	40 %	60 %	78186089
4077	NC_007512	CGG	2	6	198547	198552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78186089
4078	NC_007512	TGC	2	6	198619	198624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78186089
4079	NC_007512	TTC	2	6	198672	198677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78186089
4080	NC_007512	TCA	2	6	198694	198699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78186089
4081	NC_007512	TCG	2	6	198700	198705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78186089
4082	NC_007512	GCA	2	6	198725	198730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78186089
4083	NC_007512	GCC	2	6	198793	198798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78186089
4084	NC_007512	TCG	2	6	198879	198884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78186090
4085	NC_007512	ACC	2	6	198929	198934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78186090
4086	NC_007512	GAG	2	6	198956	198961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78186090
4087	NC_007512	GGT	2	6	199069	199074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78186090
4088	NC_007512	TCA	2	6	199101	199106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78186090
4089	NC_007512	GCAC	2	8	199169	199176	25 %	0 %	25 %	50 %	78186090
4090	NC_007512	ATT	2	6	199181	199186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78186090
4091	NC_007512	CGA	2	6	199198	199203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78186090
4092	NC_007512	TTG	2	6	199215	199220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78186090
4093	NC_007512	TCC	2	6	199289	199294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78186090
4094	NC_007512	AGC	2	6	199302	199307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78186090
4095	NC_007512	GGTC	2	8	199345	199352	0 %	25 %	50 %	25 %	78186090
4096	NC_007512	GCC	2	6	199401	199406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78186090
4097	NC_007512	GGCGG	2	10	199494	199503	0 %	0 %	80 %	20 %	78186090
4098	NC_007512	AC	3	6	199549	199554	50 %	0 %	0 %	50 %	78186090
4099	NC_007512	AC	3	6	199623	199628	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4100	NC_007512	GAA	2	6	199661	199666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78186091
4101	NC_007512	AAAT	2	8	199865	199872	75 %	25 %	0 %	0 %	78186091
4102	NC_007512	ATT	2	6	199875	199880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_007512	GTT	2	6	199891	199896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_007512	ATT	2	6	199898	199903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_007512	TTACA	2	10	199917	199926	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4106	NC_007512	CTA	2	6	199977	199982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_007512	A	6	6	200003	200008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_007512	CAT	2	6	200026	200031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_007512	AGC	2	6	200082	200087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_007512	TCT	2	6	200099	200104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_007512	CAAT	2	8	200110	200117	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4112	NC_007512	ATA	2	6	200131	200136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78186092
4113	NC_007512	GTG	2	6	200344	200349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78186092
4114	NC_007512	AGC	3	9	200350	200358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78186092
4115	NC_007512	GCT	2	6	200386	200391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78186092
4116	NC_007512	CCAGAA	2	12	200452	200463	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	78186092
4117	NC_007512	AAG	3	9	200490	200498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78186092
4118	NC_007512	CAG	2	6	200572	200577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78186093
4119	NC_007512	AGA	2	6	200583	200588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78186093
4120	NC_007512	CGT	2	6	200611	200616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78186093
4121	NC_007512	CGT	2	6	200628	200633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78186093
4122	NC_007512	CAA	2	6	200635	200640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78186093
4123	NC_007512	GAA	2	6	200719	200724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78186093
4124	NC_007512	GCC	2	6	200762	200767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78186093
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4127	NC_007512	GCC	2	6	200916	200921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78186093
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4234	NC_007512	ACTGC	2	10	206243	206252	20 %	20 %	20 %	40 %	78186099
4235	NC_007512	CGA	2	6	206360	206365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78186099
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4239	NC_007512	CAT	2	6	206537	206542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78186099
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4241	NC_007512	GA	3	6	206742	206747	50 %	0 %	50 %	0 %	78186099
4242	NC_007512	CTT	2	6	206873	206878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4243	NC_007512	T	6	6	206877	206882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4244	NC_007512	CATT	2	8	206943	206950	25 %	50 %	0 %	25 %	78186100
4245	NC_007512	TGA	2	6	206980	206985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78186100
4246	NC_007512	GCCG	2	8	207008	207015	0 %	0 %	50 %	50 %	78186100
4247	NC_007512	GCT	2	6	207103	207108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78186100
4248	NC_007512	ACT	2	6	207111	207116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78186100
4249	NC_007512	TCG	2	6	207141	207146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78186100
4250	NC_007512	GCG	2	6	207167	207172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78186100
4251	NC_007512	GGGC	2	8	207223	207230	0 %	0 %	75 %	25 %	78186100
4252	NC_007512	TGG	2	6	207246	207251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78186100
4253	NC_007512	GAT	2	6	207298	207303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78186100
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4257	NC_007512	CTG	2	6	207528	207533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78186100
4258	NC_007512	A	8	8	207571	207578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4259	NC_007512	AAT	2	6	207581	207586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4260	NC_007512	GTT	3	9	207603	207611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4261	NC_007512	CTTC	2	8	207669	207676	0 %	50 %	0 %	50 %	78186101
4262	NC_007512	TCG	2	6	207763	207768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78186101
4263	NC_007512	GCG	2	6	207781	207786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78186101
4264	NC_007512	CGT	2	6	207824	207829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78186101
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4266	NC_007512	GTG	2	6	207891	207896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78186101
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4279	NC_007512	GCG	2	6	208589	208594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78186101
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4282	NC_007512	GGAT	2	8	208803	208810	25 %	25 %	50 %	0 %	78186101
4283	NC_007512	GCA	2	6	208972	208977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78186102
4284	NC_007512	GCT	2	6	209057	209062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78186102
4285	NC_007512	CGG	2	6	209119	209124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78186102
4286	NC_007512	GGC	2	6	209175	209180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78186102
4287	NC_007512	CGA	2	6	209207	209212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78186102
4288	NC_007512	GA	3	6	209239	209244	50 %	0 %	50 %	0 %	78186102
4289	NC_007512	C	6	6	209272	209277	0 %	0 %	0 %	100 %	78186102
4290	NC_007512	A	6	6	209300	209305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4291	NC_007512	CCG	2	6	209329	209334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4292	NC_007512	CGG	2	6	209348	209353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4293	NC_007512	AGG	2	6	209362	209367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4294	NC_007512	TGC	2	6	209376	209381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78186103
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4300	NC_007512	CTTC	2	8	209518	209525	0 %	50 %	0 %	50 %	78186103
4301	NC_007512	ATG	2	6	209540	209545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78186103
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4308	NC_007512	CCTG	2	8	209947	209954	0 %	25 %	25 %	50 %	78186103
4309	NC_007512	GAGCGC	2	12	210044	210055	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	78186103
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4312	NC_007512	GCC	2	6	210189	210194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78186103
4313	NC_007512	A	6	6	210215	210220	100 %	0 %	0 %	0 %	78186103
4314	NC_007512	ATG	2	6	210242	210247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78186103
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4323	NC_007512	GCCG	2	8	210622	210629	0 %	0 %	50 %	50 %	78186103
4324	NC_007512	CA	3	6	210754	210759	50 %	0 %	0 %	50 %	78186104
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4327	NC_007512	GCA	2	6	210903	210908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78186104
4328	NC_007512	ACC	2	6	210923	210928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78186104
4329	NC_007512	GCA	2	6	210956	210961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78186104
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4339	NC_007512	CCGA	2	8	211363	211370	25 %	0 %	25 %	50 %	78186104
4340	NC_007512	TC	3	6	211493	211498	0 %	50 %	0 %	50 %	78186104
4341	NC_007512	CAA	2	6	211566	211571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78186104
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4345	NC_007512	CATG	2	8	211838	211845	25 %	25 %	25 %	25 %	78186104
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4350	NC_007512	GGT	2	6	212089	212094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78186104
4351	NC_007512	CGA	2	6	212106	212111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78186104
4352	NC_007512	GAA	2	6	212127	212132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78186104
4353	NC_007512	CTT	2	6	212139	212144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78186104
4354	NC_007512	GAA	2	6	212163	212168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78186104
4355	NC_007512	GGCG	2	8	212225	212232	0 %	0 %	75 %	25 %	78186104
4356	NC_007512	TCA	2	6	212263	212268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4357	NC_007512	CAC	2	6	212336	212341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78186105
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4361	NC_007512	GGCG	2	8	212549	212556	0 %	0 %	75 %	25 %	78186105
4362	NC_007512	CGGC	2	8	212563	212570	0 %	0 %	50 %	50 %	78186105
4363	NC_007512	GCG	2	6	212578	212583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78186105
4364	NC_007512	CAT	3	9	212720	212728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78186105
4365	NC_007512	CGC	2	6	212756	212761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78186105
4366	NC_007512	CAG	2	6	212784	212789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78186105
4367	NC_007512	GCG	2	6	212854	212859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78186105
4368	NC_007512	GCT	2	6	212903	212908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78186105
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4370	NC_007512	AGG	2	6	212995	213000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78186105
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4493	NC_007512	GTG	2	6	219348	219353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78186111
4494	NC_007512	TCC	2	6	219364	219369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78186111
4495	NC_007512	GCT	2	6	219410	219415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78186111
4496	NC_007512	CCG	2	6	219503	219508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78186111
4497	NC_007512	ATC	2	6	219585	219590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78186111
4498	NC_007512	GGCTG	2	10	219657	219666	0 %	20 %	60 %	20 %	78186111
4499	NC_007512	GATGGC	2	12	219689	219700	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	78186111
4500	NC_007512	TCA	3	9	219727	219735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78186111

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