MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Blochmannia pennsylvanicus str. BPEN chromosome

Total Repeats: 23051

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007292	CATT	2	8	12	19	25 %	50 %	0 %	25 %	71891794
2	NC_007292	TTG	3	9	29	37	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71891794
3	NC_007292	GAG	2	6	38	43	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	71891794
4	NC_007292	AGC	2	6	60	65	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71891794
5	NC_007292	ATA	2	6	110	115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71891794
6	NC_007292	TGG	2	6	153	158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71891794
7	NC_007292	GAAA	2	8	180	187	75 %	0 %	25 %	0 %	71891794
8	NC_007292	ATCA	2	8	224	231	50 %	25 %	0 %	25 %	71891794
9	NC_007292	TAG	2	6	255	260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71891794
10	NC_007292	GCT	2	6	268	273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71891794
11	NC_007292	GTA	2	6	326	331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71891794
12	NC_007292	TTG	2	6	352	357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71891794
13	NC_007292	AGA	2	6	375	380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71891794
14	NC_007292	TAGT	2	8	386	393	25 %	50 %	25 %	0 %	71891794
15	NC_007292	TTG	2	6	404	409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71891794
16	NC_007292	TGT	2	6	453	458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71891794
17	NC_007292	AAT	2	6	505	510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71891794
18	NC_007292	AGG	2	6	516	521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	71891794
19	NC_007292	TGA	2	6	666	671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71891794
20	NC_007292	TAA	2	6	747	752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71891794
21	NC_007292	TAA	2	6	809	814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71891794
22	NC_007292	AGA	2	6	846	851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71891794
23	NC_007292	TCA	2	6	882	887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71891794
24	NC_007292	T	7	7	890	896	0 %	100 %	0 %	0 %	71891794
25	NC_007292	ACA	2	6	913	918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71891794
26	NC_007292	CTA	2	6	944	949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71891794
27	NC_007292	CAAATG	2	12	967	978	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	71891794
28	NC_007292	T	7	7	1044	1050	0 %	100 %	0 %	0 %	71891794
29	NC_007292	AG	3	6	1077	1082	50 %	0 %	50 %	0 %	71891794
30	NC_007292	ATT	2	6	1087	1092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71891794
31	NC_007292	ATT	2	6	1098	1103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71891794
32	NC_007292	T	7	7	1102	1108	0 %	100 %	0 %	0 %	71891794
33	NC_007292	TAC	2	6	1125	1130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71891794
34	NC_007292	GAA	2	6	1138	1143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71891794
35	NC_007292	ATT	2	6	1158	1163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71891794
36	NC_007292	AAG	2	6	1199	1204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71891794
37	NC_007292	AGA	2	6	1216	1221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71891794
38	NC_007292	GAT	2	6	1249	1254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71891794
39	NC_007292	AGA	2	6	1272	1277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71891794
40	NC_007292	GTCT	2	8	1313	1320	0 %	50 %	25 %	25 %	71891794
41	NC_007292	CG	3	6	1359	1364	0 %	0 %	50 %	50 %	71891794
42	NC_007292	A	6	6	1411	1416	100 %	0 %	0 %	0 %	71891794
43	NC_007292	AAT	2	6	1492	1497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71891794
44	NC_007292	ATTA	2	8	1558	1565	50 %	50 %	0 %	0 %	71891794
45	NC_007292	AAATA	2	10	1640	1649	80 %	20 %	0 %	0 %	71891794
46	NC_007292	TCA	2	6	1665	1670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71891794
47	NC_007292	AAG	2	6	1673	1678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71891794
48	NC_007292	AGG	2	6	1757	1762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	71891794
49	NC_007292	AAT	2	6	1777	1782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71891794
50	NC_007292	TTGGT	2	10	1852	1861	0 %	60 %	40 %	0 %	71891794
51	NC_007292	A	7	7	1863	1869	100 %	0 %	0 %	0 %	71891794
52	NC_007292	ATA	2	6	1886	1891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71891794
53	NC_007292	AAT	2	6	1907	1912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007292	TAT	2	6	1933	1938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007292	TA	3	6	1948	1953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007292	GA	3	6	1979	1984	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007292	AAT	3	9	2024	2032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007292	ATA	3	9	2042	2050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007292	ATT	3	9	2059	2067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007292	TATG	2	8	2081	2088	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007292	ATT	2	6	2091	2096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007292	GTT	2	6	2111	2116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007292	T	7	7	2144	2150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007292	TAT	2	6	2191	2196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007292	AATA	2	8	2209	2216	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007292	TTA	2	6	2235	2240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007292	GT	3	6	2283	2288	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007292	TAAT	2	8	2327	2334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007292	AG	5	10	2388	2397	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007292	T	6	6	2426	2431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007292	ACA	2	6	2467	2472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_007292	TA	4	8	2484	2491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007292	TGT	2	6	2546	2551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007292	T	6	6	2599	2604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007292	GGT	2	6	2609	2614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007292	AT	3	6	2646	2651	50 %	50 %	0 %	0 %	71891795
77	NC_007292	CAT	2	6	2656	2661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71891795
78	NC_007292	ATC	2	6	2666	2671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71891795
79	NC_007292	CTT	2	6	2717	2722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71891795
80	NC_007292	T	7	7	2752	2758	0 %	100 %	0 %	0 %	71891795
81	NC_007292	ATT	2	6	2763	2768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71891795
82	NC_007292	TTTATT	2	12	2775	2786	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	71891795
83	NC_007292	T	7	7	2948	2954	0 %	100 %	0 %	0 %	71891795
84	NC_007292	ATTT	2	8	2969	2976	25 %	75 %	0 %	0 %	71891795
85	NC_007292	ATTT	2	8	2984	2991	25 %	75 %	0 %	0 %	71891795
86	NC_007292	CTT	2	6	3059	3064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71891795
87	NC_007292	TAC	2	6	3097	3102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71891795
88	NC_007292	TTA	2	6	3131	3136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71891795
89	NC_007292	ATC	2	6	3149	3154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71891795
90	NC_007292	ATC	2	6	3161	3166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71891795
91	NC_007292	TAT	2	6	3189	3194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71891795
92	NC_007292	GTT	2	6	3199	3204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71891795
93	NC_007292	ATT	2	6	3240	3245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71891795
94	NC_007292	TTA	2	6	3292	3297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71891795
95	NC_007292	TGG	2	6	3301	3306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71891795
96	NC_007292	TTACA	2	10	3356	3365	40 %	40 %	0 %	20 %	71891795
97	NC_007292	TTTTAT	2	12	3369	3380	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	71891795
98	NC_007292	ATTT	2	8	3394	3401	25 %	75 %	0 %	0 %	71891795
99	NC_007292	AGA	2	6	3444	3449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007292	AG	3	6	3454	3459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007292	TTA	2	6	3461	3466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71891796
102	NC_007292	TA	3	6	3491	3496	50 %	50 %	0 %	0 %	71891796
103	NC_007292	TGC	2	6	3498	3503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71891796
104	NC_007292	AAT	2	6	3507	3512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71891796
105	NC_007292	AGC	2	6	3522	3527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71891796
106	NC_007292	GTA	2	6	3560	3565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71891796
107	NC_007292	T	6	6	3622	3627	0 %	100 %	0 %	0 %	71891796
108	NC_007292	AATT	2	8	3713	3720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007292	TATT	2	8	3726	3733	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007292	ATT	2	6	3740	3745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007292	CAA	2	6	3778	3783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71891797
112	NC_007292	TTTGT	2	10	3804	3813	0 %	80 %	20 %	0 %	71891797
113	NC_007292	TG	3	6	3836	3841	0 %	50 %	50 %	0 %	71891797
114	NC_007292	TAT	2	6	3857	3862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71891797
115	NC_007292	GCTTT	2	10	3945	3954	0 %	60 %	20 %	20 %	71891797
116	NC_007292	AAAT	2	8	4001	4008	75 %	25 %	0 %	0 %	71891797
117	NC_007292	TAAT	2	8	4021	4028	50 %	50 %	0 %	0 %	71891797
118	NC_007292	ATT	2	6	4089	4094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71891797
119	NC_007292	GAAA	2	8	4098	4105	75 %	0 %	25 %	0 %	71891797
120	NC_007292	AAATG	2	10	4184	4193	60 %	20 %	20 %	0 %	71891797
121	NC_007292	ATA	2	6	4213	4218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71891797
122	NC_007292	TTA	2	6	4219	4224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71891797
123	NC_007292	CGTA	2	8	4272	4279	25 %	25 %	25 %	25 %	71891798
124	NC_007292	ATTT	2	8	4345	4352	25 %	75 %	0 %	0 %	71891798
125	NC_007292	T	6	6	4389	4394	0 %	100 %	0 %	0 %	71891798
126	NC_007292	AT	3	6	4423	4428	50 %	50 %	0 %	0 %	71891798
127	NC_007292	TAT	2	6	4493	4498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71891798
128	NC_007292	AAT	2	6	4506	4511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71891798
129	NC_007292	TAT	3	9	4516	4524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71891798
130	NC_007292	TTAT	2	8	4550	4557	25 %	75 %	0 %	0 %	71891798
131	NC_007292	TA	3	6	4562	4567	50 %	50 %	0 %	0 %	71891798
132	NC_007292	TAGAAA	2	12	4579	4590	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	71891798
133	NC_007292	A	7	7	4626	4632	100 %	0 %	0 %	0 %	71891798
134	NC_007292	AT	3	6	4696	4701	50 %	50 %	0 %	0 %	71891798
135	NC_007292	ATT	2	6	4713	4718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71891798
136	NC_007292	TGAT	2	8	4735	4742	25 %	50 %	25 %	0 %	71891798
137	NC_007292	TAC	2	6	4780	4785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71891798
138	NC_007292	AGT	2	6	4803	4808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007292	ATTA	2	8	4860	4867	50 %	50 %	0 %	0 %	71891799
140	NC_007292	CTG	2	6	4925	4930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71891799
141	NC_007292	ATCAG	2	10	4998	5007	40 %	20 %	20 %	20 %	71891799
142	NC_007292	TGG	2	6	5087	5092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71891799
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256	NC_007292	TATGTA	2	12	9207	9218	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
257	NC_007292	TAA	2	6	9234	9239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_007292	A	6	6	9270	9275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_007292	TA	3	6	9276	9281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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