MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25 chromosome

Total Repeats: 56234

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_005861	ATC	2	6	650994	650999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46446151
15002	NC_005861	A	6	6	651057	651062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15003	NC_005861	CGG	2	6	651078	651083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15004	NC_005861	GCA	2	6	651110	651115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15005	NC_005861	AG	3	6	651155	651160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15006	NC_005861	A	6	6	651184	651189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15007	NC_005861	TCT	2	6	651205	651210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15008	NC_005861	TTG	2	6	651211	651216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15009	NC_005861	GTC	2	6	651240	651245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15010	NC_005861	CAG	2	6	651301	651306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15011	NC_005861	A	6	6	651415	651420	100 %	0 %	0 %	0 %	46446152
15012	NC_005861	TTG	2	6	651506	651511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46446152
15013	NC_005861	CAT	2	6	651685	651690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46446152
15014	NC_005861	TATT	2	8	651718	651725	25 %	75 %	0 %	0 %	46446152
15015	NC_005861	A	6	6	651802	651807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15016	NC_005861	ATT	2	6	651819	651824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15017	NC_005861	TA	3	6	651871	651876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15018	NC_005861	AATT	2	8	651878	651885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15019	NC_005861	AGT	2	6	651931	651936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15020	NC_005861	GAAA	2	8	651938	651945	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15021	NC_005861	CTG	2	6	652055	652060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15022	NC_005861	A	6	6	652110	652115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15023	NC_005861	TAA	2	6	652200	652205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15024	NC_005861	T	6	6	652272	652277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15025	NC_005861	A	6	6	652520	652525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15026	NC_005861	CCAAAC	2	12	652561	652572	50 %	0 %	0 %	50 %	46446153
15027	NC_005861	AATT	2	8	652601	652608	50 %	50 %	0 %	0 %	46446153
15028	NC_005861	A	6	6	652614	652619	100 %	0 %	0 %	0 %	46446153
15029	NC_005861	TGA	2	6	652665	652670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46446153
15030	NC_005861	AGA	2	6	652672	652677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46446153
15031	NC_005861	AG	3	6	652686	652691	50 %	0 %	50 %	0 %	46446153
15032	NC_005861	GCA	2	6	652768	652773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46446153
15033	NC_005861	TAT	2	6	652785	652790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46446153
15034	NC_005861	TCG	2	6	652901	652906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46446153
15035	NC_005861	ATG	2	6	652910	652915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46446153
15036	NC_005861	TTG	2	6	653021	653026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46446153
15037	NC_005861	TGA	2	6	653061	653066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46446153
15038	NC_005861	A	6	6	653087	653092	100 %	0 %	0 %	0 %	46446153
15039	NC_005861	TGG	2	6	653098	653103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46446153
15040	NC_005861	TAA	2	6	653124	653129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46446153
15041	NC_005861	ATGA	2	8	653183	653190	50 %	25 %	25 %	0 %	46446153
15042	NC_005861	AAT	2	6	653208	653213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15043	NC_005861	A	6	6	653238	653243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15044	NC_005861	T	7	7	653294	653300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15045	NC_005861	AATT	2	8	653341	653348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15046	NC_005861	GCT	2	6	653422	653427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15047	NC_005861	TC	3	6	653450	653455	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15048	NC_005861	TGA	2	6	653458	653463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46446154
15049	NC_005861	TCA	3	9	653534	653542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46446154
15050	NC_005861	ATG	2	6	653566	653571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46446154
15051	NC_005861	TAT	2	6	653591	653596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46446154
15052	NC_005861	ATCA	2	8	653662	653669	50 %	25 %	0 %	25 %	46446154
15053	NC_005861	ACA	2	6	653711	653716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15054	NC_005861	ATA	2	6	653789	653794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15055	NC_005861	CAT	2	6	653816	653821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15056	NC_005861	TAAA	2	8	653871	653878	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15057	NC_005861	CATG	2	8	653913	653920	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15058	NC_005861	TGC	2	6	653921	653926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15059	NC_005861	CAG	2	6	653942	653947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15060	NC_005861	GAAA	2	8	654003	654010	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15061	NC_005861	ATT	2	6	654011	654016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15062	NC_005861	A	7	7	654178	654184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15063	NC_005861	TGA	2	6	654188	654193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15064	NC_005861	GATA	2	8	654228	654235	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15065	NC_005861	A	6	6	654238	654243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15066	NC_005861	AAT	2	6	654279	654284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15067	NC_005861	TAATT	2	10	654288	654297	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15068	NC_005861	AG	3	6	654298	654303	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15069	NC_005861	TTG	2	6	654311	654316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15070	NC_005861	TAA	2	6	654330	654335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15071	NC_005861	AAT	2	6	654340	654345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15072	NC_005861	TCT	2	6	654354	654359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15074	NC_005861	CTA	2	6	654417	654422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15076	NC_005861	CT	3	6	654510	654515	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15077	NC_005861	GTT	2	6	654542	654547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15078	NC_005861	AAT	2	6	654580	654585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15079	NC_005861	ATA	2	6	654713	654718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15080	NC_005861	GTA	2	6	654729	654734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46446155
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15082	NC_005861	AAAT	2	8	654953	654960	75 %	25 %	0 %	0 %	46446155
15083	NC_005861	TAA	2	6	655017	655022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15084	NC_005861	GAT	2	6	655032	655037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15086	NC_005861	AGTT	2	8	655065	655072	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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15088	NC_005861	T	7	7	655099	655105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15089	NC_005861	A	6	6	655140	655145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15090	NC_005861	A	6	6	655147	655152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15091	NC_005861	TGA	2	6	655194	655199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15092	NC_005861	TC	3	6	655209	655214	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15093	NC_005861	TGG	2	6	655353	655358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15096	NC_005861	ATGA	2	8	655596	655603	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15097	NC_005861	TTG	2	6	655606	655611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15098	NC_005861	TCA	2	6	655631	655636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15099	NC_005861	T	8	8	655644	655651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15100	NC_005861	TACTA	2	10	655677	655686	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15101	NC_005861	CTATTT	2	12	655762	655773	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15102	NC_005861	TG	3	6	655809	655814	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15103	NC_005861	AAG	2	6	655824	655829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15104	NC_005861	AAT	2	6	655866	655871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15105	NC_005861	AT	3	6	655877	655882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15106	NC_005861	TAAGTC	2	12	655892	655903	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15107	NC_005861	TAAG	2	8	655909	655916	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15108	NC_005861	TTA	2	6	655946	655951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15109	NC_005861	TAGT	2	8	655996	656003	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15110	NC_005861	T	6	6	656008	656013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15111	NC_005861	ATT	2	6	656031	656036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15112	NC_005861	A	6	6	656060	656065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15114	NC_005861	A	6	6	656121	656126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15115	NC_005861	A	6	6	656162	656167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15116	NC_005861	AGA	2	6	656229	656234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15117	NC_005861	TAA	2	6	656300	656305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15118	NC_005861	A	6	6	656329	656334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15119	NC_005861	AGT	2	6	656348	656353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15120	NC_005861	ATT	2	6	656419	656424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15121	NC_005861	AAG	2	6	656460	656465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15122	NC_005861	AGA	2	6	656469	656474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15123	NC_005861	AAATC	2	10	656489	656498	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15124	NC_005861	GAT	2	6	656619	656624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15125	NC_005861	T	7	7	656631	656637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15126	NC_005861	ATGAT	2	10	656696	656705	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15127	NC_005861	AT	3	6	656746	656751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15128	NC_005861	A	8	8	656753	656760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15129	NC_005861	ATTA	2	8	656777	656784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15130	NC_005861	TAAAAG	2	12	656826	656837	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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