MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium tetani E88 plasmid pE88

Total Repeats: 2299

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004565	ATA	2	6	25	30	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004565	TTA	2	6	48	53	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004565	TAA	2	6	62	67	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004565	A	6	6	95	100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004565	T	6	6	126	131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004565	A	6	6	166	171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004565	A	6	6	188	193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004565	TAAA	2	8	221	228	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004565	AAT	2	6	229	234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004565	TA	3	6	242	247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004565	A	7	7	251	257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004565	TA	3	6	318	323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004565	TTTA	2	8	346	353	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004565	AT	3	6	369	374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004565	TA	3	6	381	386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004565	TTC	2	6	402	407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_004565	AGG	2	6	428	433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004565	TA	3	6	471	476	50 %	50 %	0 %	0 %	28373132
19	NC_004565	A	6	6	488	493	100 %	0 %	0 %	0 %	28373132
20	NC_004565	TGA	2	6	578	583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28373132
21	NC_004565	AT	3	6	587	592	50 %	50 %	0 %	0 %	28373132
22	NC_004565	ATA	2	6	610	615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373132
23	NC_004565	CAT	2	6	630	635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28373132
24	NC_004565	AT	4	8	694	701	50 %	50 %	0 %	0 %	28373132
25	NC_004565	AAG	2	6	731	736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373132
26	NC_004565	AAATT	2	10	753	762	60 %	40 %	0 %	0 %	28373132
27	NC_004565	TAGATT	2	12	772	783	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	28373132
28	NC_004565	ACT	2	6	847	852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28373132
29	NC_004565	AT	3	6	909	914	50 %	50 %	0 %	0 %	28373132
30	NC_004565	TAAA	2	8	979	986	75 %	25 %	0 %	0 %	28373132
31	NC_004565	A	6	6	1009	1014	100 %	0 %	0 %	0 %	28373132
32	NC_004565	GCA	2	6	1023	1028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28373132
33	NC_004565	TTA	2	6	1083	1088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373132
34	NC_004565	ATA	2	6	1099	1104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373132
35	NC_004565	TA	3	6	1219	1224	50 %	50 %	0 %	0 %	28373132
36	NC_004565	AG	3	6	1323	1328	50 %	0 %	50 %	0 %	28373132
37	NC_004565	T	6	6	1337	1342	0 %	100 %	0 %	0 %	28373132
38	NC_004565	TAA	2	6	1409	1414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373132
39	NC_004565	TAG	2	6	1517	1522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28373132
40	NC_004565	TAA	2	6	1552	1557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373132
41	NC_004565	TTA	2	6	1560	1565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373132
42	NC_004565	AGA	2	6	1574	1579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373132
43	NC_004565	ATA	2	6	1609	1614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373132
44	NC_004565	AAG	2	6	1615	1620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373132
45	NC_004565	GAAT	2	8	1673	1680	50 %	25 %	25 %	0 %	28373132
46	NC_004565	GAAG	2	8	1706	1713	50 %	0 %	50 %	0 %	28373132
47	NC_004565	AG	3	6	1722	1727	50 %	0 %	50 %	0 %	28373132
48	NC_004565	TA	3	6	1738	1743	50 %	50 %	0 %	0 %	28373132
49	NC_004565	AAGA	2	8	1802	1809	75 %	0 %	25 %	0 %	28373132
50	NC_004565	TAAA	2	8	1813	1820	75 %	25 %	0 %	0 %	28373132
51	NC_004565	A	6	6	1818	1823	100 %	0 %	0 %	0 %	28373132
52	NC_004565	T	7	7	1875	1881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004565	TA	3	6	1932	1937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004565	TAA	2	6	1954	1959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004565	TTA	2	6	1966	1971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004565	AT	3	6	1982	1987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004565	TAT	2	6	2009	2014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004565	TACAT	2	10	2018	2027	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_004565	A	6	6	2042	2047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004565	ATT	2	6	2079	2084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004565	ATA	2	6	2085	2090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004565	A	6	6	2122	2127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004565	TTA	2	6	2131	2136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004565	ATG	2	6	2146	2151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004565	ATA	2	6	2163	2168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004565	TTA	2	6	2194	2199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004565	ATC	2	6	2251	2256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_004565	TAT	2	6	2313	2318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004565	AAG	2	6	2338	2343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004565	GAA	2	6	2388	2393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004565	AAT	2	6	2403	2408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004565	A	8	8	2467	2474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004565	ATT	2	6	2492	2497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004565	TATT	2	8	2517	2524	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004565	TAG	2	6	2532	2537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004565	TA	3	6	2593	2598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004565	ATT	2	6	2606	2611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004565	TTA	2	6	2616	2621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004565	TAA	2	6	2656	2661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004565	TAA	2	6	2730	2735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004565	A	6	6	2741	2746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004565	TAGATA	2	12	2747	2758	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004565	ATT	2	6	2759	2764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004565	AAT	2	6	2766	2771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004565	ATG	2	6	2798	2803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004565	AAG	2	6	2819	2824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004565	CTT	2	6	2857	2862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_004565	AAT	2	6	2867	2872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004565	AT	3	6	2871	2876	50 %	50 %	0 %	0 %	28373133
90	NC_004565	ACA	2	6	2925	2930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28373133
91	NC_004565	AGG	2	6	2942	2947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28373133
92	NC_004565	AGGAAC	2	12	2987	2998	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	28373133
93	NC_004565	ATA	2	6	3044	3049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373133
94	NC_004565	TA	3	6	3058	3063	50 %	50 %	0 %	0 %	28373133
95	NC_004565	TCC	2	6	3065	3070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28373133
96	NC_004565	T	6	6	3191	3196	0 %	100 %	0 %	0 %	28373133
97	NC_004565	T	6	6	3305	3310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004565	ATT	2	6	3314	3319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004565	T	7	7	3318	3324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004565	TTTA	2	8	3330	3337	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004565	AAG	2	6	3383	3388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004565	A	7	7	3417	3423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004565	ATTTG	2	10	3447	3456	20 %	60 %	20 %	0 %	28373134
104	NC_004565	T	8	8	3487	3494	0 %	100 %	0 %	0 %	28373134
105	NC_004565	T	6	6	3518	3523	0 %	100 %	0 %	0 %	28373134
106	NC_004565	CAT	2	6	3541	3546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28373134
107	NC_004565	TAAT	2	8	3603	3610	50 %	50 %	0 %	0 %	28373134
108	NC_004565	CTC	2	6	3651	3656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_004565	AAG	2	6	3673	3678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373135
110	NC_004565	T	8	8	3681	3688	0 %	100 %	0 %	0 %	28373135
111	NC_004565	T	6	6	3719	3724	0 %	100 %	0 %	0 %	28373135
112	NC_004565	TCT	2	6	3729	3734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28373135
113	NC_004565	T	7	7	3780	3786	0 %	100 %	0 %	0 %	28373135
114	NC_004565	TCT	2	6	3792	3797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28373135
115	NC_004565	GAT	2	6	3855	3860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28373135
116	NC_004565	TCC	2	6	3894	3899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_004565	ATT	2	6	3920	3925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004565	CTA	2	6	3949	3954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_004565	TA	3	6	3953	3958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004565	TAG	2	6	3983	3988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_004565	T	6	6	3997	4002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004565	TAA	2	6	4022	4027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004565	AAT	2	6	4043	4048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004565	ATT	2	6	4061	4066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004565	T	7	7	4086	4092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004565	ATT	2	6	4095	4100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_004565	T	6	6	4202	4207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004565	TCTA	2	8	4224	4231	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_004565	TAA	2	6	4242	4247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004565	TCT	2	6	4255	4260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_004565	TTCA	2	8	4293	4300	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_004565	TGC	2	6	4319	4324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_004565	T	7	7	4332	4338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_004565	ATAA	2	8	4340	4347	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004565	AT	3	6	4348	4353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004565	TA	3	6	4374	4379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_004565	AT	3	6	4390	4395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004565	TGTT	2	8	4412	4419	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_004565	TTTA	2	8	4431	4438	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004565	CAT	2	6	4462	4467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_004565	AATTT	2	10	4468	4477	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_004565	T	7	7	4487	4493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_004565	ATC	2	6	4535	4540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_004565	ATT	2	6	4574	4579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_004565	AT	3	6	4582	4587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_004565	TAA	2	6	4713	4718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_004565	A	7	7	4722	4728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_004565	TAT	2	6	4730	4735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_004565	TAA	2	6	4750	4755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_004565	TA	3	6	4785	4790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_004565	A	6	6	4816	4821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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