MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium tetani E88 chromosome

Total Repeats: 79021

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004557	TA	3	6	18931	18936	50 %	50 %	0 %	0 %	28209846
502	NC_004557	TCT	2	6	18968	18973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209846
503	NC_004557	AT	3	6	19005	19010	50 %	50 %	0 %	0 %	28209846
504	NC_004557	TCT	2	6	19052	19057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209846
505	NC_004557	CTT	2	6	19077	19082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209846
506	NC_004557	TAA	2	6	19105	19110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209846
507	NC_004557	CTT	2	6	19126	19131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209846
508	NC_004557	CTT	2	6	19134	19139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209846
509	NC_004557	TTC	2	6	19237	19242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209846
510	NC_004557	AAT	2	6	19267	19272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209846
511	NC_004557	CAC	2	6	19314	19319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28209846
512	NC_004557	CTA	2	6	19328	19333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209846
513	NC_004557	ATT	2	6	19373	19378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209846
514	NC_004557	TA	3	6	19407	19412	50 %	50 %	0 %	0 %	28209846
515	NC_004557	CTT	2	6	19419	19424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209846
516	NC_004557	ATTT	2	8	19438	19445	25 %	75 %	0 %	0 %	28209846
517	NC_004557	TTA	2	6	19476	19481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209846
518	NC_004557	ATA	2	6	19526	19531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209846
519	NC_004557	TAAG	2	8	19567	19574	50 %	25 %	25 %	0 %	28209846
520	NC_004557	ATTA	2	8	19580	19587	50 %	50 %	0 %	0 %	28209846
521	NC_004557	TC	3	6	19590	19595	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
522	NC_004557	TTTAA	2	10	19597	19606	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_004557	AAT	2	6	19621	19626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_004557	A	6	6	19651	19656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_004557	CCT	2	6	19709	19714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
526	NC_004557	TAT	2	6	19807	19812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_004557	TA	3	6	19846	19851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_004557	C	6	6	19864	19869	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
529	NC_004557	ACA	2	6	19913	19918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_004557	TATTT	2	10	19943	19952	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_004557	TTTA	2	8	19972	19979	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_004557	A	6	6	19979	19984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_004557	AT	3	6	19988	19993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_004557	AGC	2	6	20002	20007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_004557	AT	3	6	20017	20022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_004557	T	7	7	20074	20080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_004557	TCT	2	6	20084	20089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_004557	ATA	2	6	20099	20104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_004557	TTA	2	6	20109	20114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_004557	TCT	2	6	20123	20128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_004557	CCT	2	6	20187	20192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_004557	AAAT	2	8	20257	20264	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_004557	AATT	2	8	20270	20277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_004557	AGG	2	6	20282	20287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
545	NC_004557	TGAA	2	8	20306	20313	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
546	NC_004557	TAC	2	6	20403	20408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_004557	ATA	2	6	20433	20438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_004557	AT	3	6	20451	20456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_004557	CAA	2	6	20509	20514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_004557	TAC	2	6	20556	20561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_004557	AT	3	6	20568	20573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_004557	T	7	7	20589	20595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_004557	AT	3	6	20669	20674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_004557	TAT	2	6	20681	20686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_004557	AAT	2	6	20721	20726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_004557	TAT	2	6	20761	20766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_004557	T	6	6	20775	20780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_004557	AT	3	6	20781	20786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_004557	TTTCT	2	10	20795	20804	0 %	80 %	0 %	20 %	28209847
560	NC_004557	AT	3	6	20918	20923	50 %	50 %	0 %	0 %	28209847
561	NC_004557	TAG	2	6	20957	20962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28209847
562	NC_004557	CTT	2	6	20972	20977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209847
563	NC_004557	TC	3	6	21088	21093	0 %	50 %	0 %	50 %	28209847
564	NC_004557	CTA	2	6	21128	21133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209847
565	NC_004557	TAC	2	6	21164	21169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209847
566	NC_004557	TAA	2	6	21239	21244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209847
567	NC_004557	CTT	2	6	21266	21271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209847
568	NC_004557	TTC	2	6	21316	21321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209847
569	NC_004557	TTC	2	6	21345	21350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209847
570	NC_004557	CTATTG	2	12	21362	21373	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	28209847
571	NC_004557	CTTT	2	8	21482	21489	0 %	75 %	0 %	25 %	28209848
572	NC_004557	TGCA	2	8	21500	21507	25 %	25 %	25 %	25 %	28209848
573	NC_004557	ATA	2	6	21509	21514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209848
574	NC_004557	TCT	2	6	21520	21525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209848
575	NC_004557	CAT	2	6	21536	21541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209848
576	NC_004557	ACT	2	6	21550	21555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209848
577	NC_004557	T	7	7	21585	21591	0 %	100 %	0 %	0 %	28209848
578	NC_004557	CCA	2	6	21616	21621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28209848
579	NC_004557	CTTG	2	8	21628	21635	0 %	50 %	25 %	25 %	28209848
580	NC_004557	T	6	6	21639	21644	0 %	100 %	0 %	0 %	28209848
581	NC_004557	TCC	2	6	21667	21672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28209848
582	NC_004557	TGT	2	6	21676	21681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28209848
583	NC_004557	GCTT	2	8	21694	21701	0 %	50 %	25 %	25 %	28209848
584	NC_004557	TTAT	2	8	21709	21716	25 %	75 %	0 %	0 %	28209848
585	NC_004557	CCA	3	9	21721	21729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28209848
586	NC_004557	CTC	3	9	21740	21748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28209848
587	NC_004557	CTC	2	6	21763	21768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_004557	TTA	2	6	21770	21775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_004557	TAT	2	6	21784	21789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_004557	TTC	2	6	21833	21838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209849
591	NC_004557	TAT	2	6	21839	21844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209849
592	NC_004557	CTA	2	6	21847	21852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209849
593	NC_004557	TCT	2	6	21918	21923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209849
594	NC_004557	TA	3	6	21926	21931	50 %	50 %	0 %	0 %	28209849
595	NC_004557	A	6	6	21964	21969	100 %	0 %	0 %	0 %	28209849
596	NC_004557	TAT	2	6	21988	21993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209849
597	NC_004557	TTTC	2	8	21994	22001	0 %	75 %	0 %	25 %	28209849
598	NC_004557	TTA	2	6	22014	22019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209849
599	NC_004557	ATG	2	6	22090	22095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28209849
600	NC_004557	AT	3	6	22097	22102	50 %	50 %	0 %	0 %	28209849
601	NC_004557	T	6	6	22221	22226	0 %	100 %	0 %	0 %	28209849
602	NC_004557	ATTAT	2	10	22251	22260	40 %	60 %	0 %	0 %	28209849
603	NC_004557	CTT	2	6	22342	22347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209849
604	NC_004557	ATT	2	6	22371	22376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209849
605	NC_004557	TTC	2	6	22463	22468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209849
606	NC_004557	TAA	2	6	22486	22491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209849
607	NC_004557	ATT	2	6	22497	22502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209849
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610	NC_004557	ACTT	2	8	22586	22593	25 %	50 %	0 %	25 %	28209849
611	NC_004557	TAAT	2	8	22597	22604	50 %	50 %	0 %	0 %	28209849
612	NC_004557	ATT	2	6	22640	22645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209849
613	NC_004557	CTT	2	6	22669	22674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209849
614	NC_004557	TAT	2	6	22676	22681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209849
615	NC_004557	T	6	6	22704	22709	0 %	100 %	0 %	0 %	28209849
616	NC_004557	TTA	2	6	22729	22734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209849
617	NC_004557	TAA	2	6	22747	22752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209849
618	NC_004557	TAC	2	6	22766	22771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209849
619	NC_004557	TAT	2	6	22876	22881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209849
620	NC_004557	A	6	6	22889	22894	100 %	0 %	0 %	0 %	28209849
621	NC_004557	TTA	2	6	22906	22911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209849
622	NC_004557	AT	3	6	22930	22935	50 %	50 %	0 %	0 %	28209849
623	NC_004557	TGT	2	6	23009	23014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28209849
624	NC_004557	TTC	2	6	23045	23050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209849
625	NC_004557	ATA	2	6	23141	23146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209849
626	NC_004557	TAT	2	6	23156	23161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209849
627	NC_004557	CTT	2	6	23163	23168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209849
628	NC_004557	TAT	2	6	23182	23187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209849
629	NC_004557	GCA	2	6	23193	23198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28209849
630	NC_004557	CTC	2	6	23204	23209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28209849
631	NC_004557	T	7	7	23236	23242	0 %	100 %	0 %	0 %	28209849
632	NC_004557	CATT	2	8	23253	23260	25 %	50 %	0 %	25 %	28209849
633	NC_004557	T	6	6	23391	23396	0 %	100 %	0 %	0 %	28209849
634	NC_004557	TAT	2	6	23506	23511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_004557	TTATAT	2	12	23533	23544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_004557	TCA	2	6	23552	23557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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