MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila abortus S26/3

Total Repeats: 23950

< Previous12...3233343536373839404142...4748Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_004552	TAT	3	9	861901	861909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62185359
18003	NC_004552	AG	3	6	861914	861919	50 %	0 %	50 %	0 %	62185359
18004	NC_004552	AAG	2	6	861939	861944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185359
18005	NC_004552	CGT	2	6	861994	861999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62185359
18006	NC_004552	AAC	2	6	862004	862009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62185359
18007	NC_004552	TTA	2	6	862055	862060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62185359
18008	NC_004552	AGA	2	6	862071	862076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185359
18009	NC_004552	ACTG	2	8	862143	862150	25 %	25 %	25 %	25 %	62185359
18010	NC_004552	TCT	2	6	862227	862232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185359
18011	NC_004552	TGC	2	6	862233	862238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62185359
18012	NC_004552	A	8	8	862241	862248	100 %	0 %	0 %	0 %	62185359
18013	NC_004552	GA	3	6	862313	862318	50 %	0 %	50 %	0 %	62185359
18014	NC_004552	AGAA	2	8	862326	862333	75 %	0 %	25 %	0 %	62185359
18015	NC_004552	CG	3	6	862405	862410	0 %	0 %	50 %	50 %	62185359
18016	NC_004552	ATC	2	6	862417	862422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185359
18017	NC_004552	ATT	2	6	862577	862582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62185359
18018	NC_004552	TCCT	2	8	862604	862611	0 %	50 %	0 %	50 %	62185359
18019	NC_004552	ATG	2	6	862628	862633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185359
18020	NC_004552	GCA	2	6	862666	862671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62185359
18021	NC_004552	ACT	2	6	862704	862709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185359
18022	NC_004552	TTA	2	6	862714	862719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62185359
18023	NC_004552	TAA	2	6	862851	862856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62185359
18024	NC_004552	GCA	2	6	862893	862898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62185359
18025	NC_004552	TCT	2	6	862945	862950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185359
18026	NC_004552	TTC	2	6	863000	863005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185359
18027	NC_004552	GAA	2	6	863014	863019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185359
18028	NC_004552	AGA	2	6	863034	863039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185359
18029	NC_004552	AAG	2	6	863051	863056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185359
18030	NC_004552	TTTC	2	8	863130	863137	0 %	75 %	0 %	25 %	62185360
18031	NC_004552	TGT	2	6	863169	863174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62185360
18032	NC_004552	CTT	2	6	863185	863190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185360
18033	NC_004552	AACAG	2	10	863194	863203	60 %	0 %	20 %	20 %	62185360
18034	NC_004552	TTC	2	6	863262	863267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185360
18035	NC_004552	ATC	2	6	863362	863367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185360
18036	NC_004552	AAC	2	6	863386	863391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62185360
18037	NC_004552	CTG	2	6	863484	863489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62185360
18038	NC_004552	GCA	3	9	863573	863581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62185360
18039	NC_004552	GAT	2	6	863586	863591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185360
18040	NC_004552	ATT	2	6	863740	863745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62185360
18041	NC_004552	TAC	2	6	863772	863777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185360
18042	NC_004552	TA	3	6	863817	863822	50 %	50 %	0 %	0 %	62185360
18043	NC_004552	ATT	2	6	863866	863871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62185360
18044	NC_004552	TGC	2	6	864014	864019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62185360
18045	NC_004552	GTT	2	6	864154	864159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62185360
18046	NC_004552	GA	3	6	864171	864176	50 %	0 %	50 %	0 %	62185360
18047	NC_004552	CCT	2	6	864197	864202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62185360
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18049	NC_004552	TTC	2	6	864298	864303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185360
18050	NC_004552	AGG	2	6	864313	864318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62185360
18051	NC_004552	ATG	2	6	864367	864372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185360
18052	NC_004552	GAA	2	6	864456	864461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185360
18053	NC_004552	TTC	2	6	864493	864498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185360
18054	NC_004552	T	6	6	864522	864527	0 %	100 %	0 %	0 %	62185360
18055	NC_004552	AAG	2	6	864565	864570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185360
18056	NC_004552	TTC	2	6	864577	864582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185360
18057	NC_004552	AATCA	2	10	864598	864607	60 %	20 %	0 %	20 %	62185360
18058	NC_004552	GAA	2	6	864615	864620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185360
18059	NC_004552	TAT	2	6	864642	864647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62185360
18060	NC_004552	GTT	2	6	864687	864692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62185360
18061	NC_004552	CAA	2	6	864766	864771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62185360
18062	NC_004552	GGGA	2	8	864803	864810	25 %	0 %	75 %	0 %	62185360
18063	NC_004552	TTTCT	2	10	864822	864831	0 %	80 %	0 %	20 %	62185360
18064	NC_004552	CAG	2	6	864852	864857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62185360
18065	NC_004552	TGA	2	6	864888	864893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185360
18066	NC_004552	TCT	2	6	864896	864901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185360
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18068	NC_004552	TC	3	6	864978	864983	0 %	50 %	0 %	50 %	62185360
18069	NC_004552	TAA	2	6	865033	865038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62185360
18070	NC_004552	GCG	2	6	865055	865060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62185360
18071	NC_004552	ACA	2	6	865076	865081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62185360
18072	NC_004552	AAT	2	6	865100	865105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62185360
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18074	NC_004552	T	6	6	865218	865223	0 %	100 %	0 %	0 %	62185360
18075	NC_004552	TGTT	2	8	865240	865247	0 %	75 %	25 %	0 %	62185360
18076	NC_004552	TAA	2	6	865270	865275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62185360
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18078	NC_004552	TGA	2	6	865361	865366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185360
18079	NC_004552	GA	3	6	865386	865391	50 %	0 %	50 %	0 %	62185360
18080	NC_004552	CAT	2	6	865492	865497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185360
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18082	NC_004552	TCAG	2	8	865592	865599	25 %	25 %	25 %	25 %	62185360
18083	NC_004552	TA	3	6	865621	865626	50 %	50 %	0 %	0 %	62185360
18084	NC_004552	TCT	2	6	865649	865654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185360
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18086	NC_004552	CGT	2	6	865727	865732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62185360
18087	NC_004552	A	6	6	865742	865747	100 %	0 %	0 %	0 %	62185360
18088	NC_004552	TCG	2	6	865862	865867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62185360
18089	NC_004552	ATC	2	6	865877	865882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185360
18090	NC_004552	ATA	2	6	865883	865888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62185360
18091	NC_004552	ACTTA	2	10	865951	865960	40 %	40 %	0 %	20 %	62185360
18092	NC_004552	ACG	2	6	865961	865966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62185360
18093	NC_004552	T	7	7	866040	866046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18094	NC_004552	AGTTA	2	10	866098	866107	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18095	NC_004552	TAT	2	6	866115	866120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18096	NC_004552	ATT	2	6	866161	866166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62185361
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18098	NC_004552	GCTGC	2	10	866263	866272	0 %	20 %	40 %	40 %	62185361
18099	NC_004552	AT	3	6	866296	866301	50 %	50 %	0 %	0 %	62185361
18100	NC_004552	TCC	2	6	866333	866338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62185361
18101	NC_004552	CCCTA	2	10	866378	866387	20 %	20 %	0 %	60 %	62185361
18102	NC_004552	ATG	2	6	866404	866409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185361
18103	NC_004552	GGT	2	6	866434	866439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62185361
18104	NC_004552	ATA	2	6	866500	866505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62185361
18105	NC_004552	TAT	2	6	866544	866549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62185361
18106	NC_004552	GAA	3	9	866598	866606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185361
18107	NC_004552	AGA	2	6	866641	866646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185361
18108	NC_004552	ATT	2	6	866665	866670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62185361
18109	NC_004552	TTG	2	6	866677	866682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62185361
18110	NC_004552	TCT	2	6	866694	866699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185361
18111	NC_004552	CTG	2	6	866710	866715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62185361
18112	NC_004552	AGA	2	6	866759	866764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185361
18113	NC_004552	TGG	2	6	866795	866800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62185361
18114	NC_004552	ATG	3	9	866887	866895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185361
18115	NC_004552	GAGT	2	8	866912	866919	25 %	25 %	50 %	0 %	62185361
18116	NC_004552	A	6	6	866959	866964	100 %	0 %	0 %	0 %	62185361
18117	NC_004552	CAA	2	6	866998	867003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62185361
18118	NC_004552	AGA	2	6	867008	867013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185361
18119	NC_004552	GT	3	6	867022	867027	0 %	50 %	50 %	0 %	62185361
18120	NC_004552	TCTT	2	8	867113	867120	0 %	75 %	0 %	25 %	62185361
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18122	NC_004552	ATT	2	6	867353	867358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62185361
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18239	NC_004552	A	6	6	872801	872806	100 %	0 %	0 %	0 %	62185366
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18244	NC_004552	ATT	2	6	873128	873133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18496	NC_004552	CAATTC	2	12	885420	885431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185374
18497	NC_004552	TTCTTT	2	12	885432	885443	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	62185374
18498	NC_004552	GT	3	6	885449	885454	0 %	50 %	50 %	0 %	62185374
18499	NC_004552	T	6	6	885556	885561	0 %	100 %	0 %	0 %	62185374
18500	NC_004552	T	6	6	885575	885580	0 %	100 %	0 %	0 %	62185374

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