MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila abortus S26/3

Total Repeats: 23950

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_004552	CT	3	6	671195	671200	0 %	50 %	0 %	50 %	62185204
14003	NC_004552	TCT	2	6	671248	671253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185204
14004	NC_004552	AAG	2	6	671336	671341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185204
14005	NC_004552	CAG	2	6	671384	671389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62185204
14006	NC_004552	TCA	2	6	671455	671460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185204
14007	NC_004552	TGT	2	6	671632	671637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62185204
14008	NC_004552	CTG	2	6	671658	671663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62185204
14009	NC_004552	TCT	4	12	671719	671730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185204
14010	NC_004552	AGC	2	6	671796	671801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62185204
14011	NC_004552	CCT	2	6	671834	671839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62185204
14012	NC_004552	T	7	7	671889	671895	0 %	100 %	0 %	0 %	62185204
14013	NC_004552	CTAT	2	8	671896	671903	25 %	50 %	0 %	25 %	62185204
14014	NC_004552	T	6	6	671988	671993	0 %	100 %	0 %	0 %	62185204
14015	NC_004552	CTT	2	6	672003	672008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185204
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14017	NC_004552	GGA	2	6	672134	672139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62185204
14018	NC_004552	TTG	2	6	672143	672148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62185204
14019	NC_004552	ATG	2	6	672170	672175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185204
14020	NC_004552	GAT	2	6	672204	672209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185204
14021	NC_004552	GCA	2	6	672250	672255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62185204
14022	NC_004552	T	6	6	672374	672379	0 %	100 %	0 %	0 %	62185204
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14025	NC_004552	ATCG	2	8	672717	672724	25 %	25 %	25 %	25 %	62185204
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14033	NC_004552	TCTTG	2	10	673220	673229	0 %	60 %	20 %	20 %	62185204
14034	NC_004552	GCT	2	6	673325	673330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62185204
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14053	NC_004552	C	6	6	674338	674343	0 %	0 %	0 %	100 %	62185204
14054	NC_004552	CTT	2	6	674380	674385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185204
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14056	NC_004552	TAA	2	6	674513	674518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62185204
14057	NC_004552	ATC	2	6	674548	674553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185204
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14061	NC_004552	A	9	9	674844	674852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14062	NC_004552	TTA	2	6	674892	674897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14063	NC_004552	AT	3	6	674902	674907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14064	NC_004552	TAA	2	6	674933	674938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14065	NC_004552	A	6	6	674937	674942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14101	NC_004552	AGCG	2	8	676496	676503	25 %	0 %	50 %	25 %	62185205
14102	NC_004552	CT	3	6	676575	676580	0 %	50 %	0 %	50 %	62185205
14103	NC_004552	AGAA	2	8	676822	676829	75 %	0 %	25 %	0 %	62185205
14104	NC_004552	TCATA	2	10	676842	676851	40 %	40 %	0 %	20 %	62185205
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14109	NC_004552	AG	3	6	676922	676927	50 %	0 %	50 %	0 %	62185205
14110	NC_004552	TGCA	2	8	676955	676962	25 %	25 %	25 %	25 %	62185205
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14118	NC_004552	CATAT	2	10	677198	677207	40 %	40 %	0 %	20 %	62185206
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14122	NC_004552	AGC	2	6	677375	677380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62185206
14123	NC_004552	CAA	2	6	677410	677415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62185206
14124	NC_004552	CGT	2	6	677460	677465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62185206
14125	NC_004552	CTC	2	6	677653	677658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62185206
14126	NC_004552	CTT	2	6	677704	677709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185206
14127	NC_004552	TCT	3	9	677712	677720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185206
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14135	NC_004552	ATA	2	6	678160	678165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62185206
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14137	NC_004552	CT	3	6	678273	678278	0 %	50 %	0 %	50 %	62185206
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14139	NC_004552	CCA	2	6	678402	678407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62185206
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14143	NC_004552	A	6	6	678555	678560	100 %	0 %	0 %	0 %	62185206
14144	NC_004552	AG	3	6	678593	678598	50 %	0 %	50 %	0 %	62185206
14145	NC_004552	TTG	2	6	678616	678621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62185206
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14149	NC_004552	TCT	2	6	678857	678862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14150	NC_004552	AAGGGA	2	12	678886	678897	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14151	NC_004552	CTT	2	6	678954	678959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14152	NC_004552	ACA	2	6	678975	678980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14153	NC_004552	TG	3	6	678992	678997	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14154	NC_004552	TCA	2	6	678999	679004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14156	NC_004552	AGTT	2	8	679020	679027	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14157	NC_004552	CTT	2	6	679111	679116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185207
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14162	NC_004552	CT	3	6	679451	679456	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14163	NC_004552	TA	3	6	679490	679495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14164	NC_004552	AAT	2	6	679537	679542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14165	NC_004552	A	6	6	679604	679609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14166	NC_004552	AAG	2	6	679634	679639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14167	NC_004552	A	6	6	679656	679661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14168	NC_004552	A	6	6	679663	679668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14169	NC_004552	GTA	2	6	679807	679812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14171	NC_004552	AG	3	6	679939	679944	50 %	0 %	50 %	0 %	62185208
14172	NC_004552	T	6	6	679946	679951	0 %	100 %	0 %	0 %	62185208
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14185	NC_004552	CCT	2	6	680499	680504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14186	NC_004552	GT	3	6	680505	680510	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14187	NC_004552	A	7	7	680544	680550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14188	NC_004552	ATC	2	6	680558	680563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14190	NC_004552	TTAT	2	8	680598	680605	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14191	NC_004552	GAGC	2	8	680661	680668	25 %	0 %	50 %	25 %	62185209
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14197	NC_004552	CT	3	6	681168	681173	0 %	50 %	0 %	50 %	62185210
14198	NC_004552	TC	3	6	681175	681180	0 %	50 %	0 %	50 %	62185210
14199	NC_004552	AGCAA	2	10	681226	681235	60 %	0 %	20 %	20 %	62185210
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14204	NC_004552	TA	3	6	681519	681524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14205	NC_004552	ATTAAT	2	12	681529	681540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14206	NC_004552	ATATTA	2	12	681555	681566	50 %	50 %	0 %	0 %	62185211
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14225	NC_004552	ATAA	2	8	682370	682377	75 %	25 %	0 %	0 %	62185211
14226	NC_004552	AGA	2	6	682380	682385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185211
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14228	NC_004552	CATTT	2	10	682452	682461	20 %	60 %	0 %	20 %	62185211
14229	NC_004552	T	6	6	682459	682464	0 %	100 %	0 %	0 %	62185211
14230	NC_004552	CTT	2	6	682481	682486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185211
14231	NC_004552	TA	3	6	682584	682589	50 %	50 %	0 %	0 %	62185211
14232	NC_004552	AAT	2	6	682613	682618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62185211
14233	NC_004552	GAA	2	6	682700	682705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185211
14234	NC_004552	ATC	2	6	682713	682718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185211
14235	NC_004552	T	7	7	682755	682761	0 %	100 %	0 %	0 %	62185211
14236	NC_004552	TCT	2	6	682774	682779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185211
14237	NC_004552	A	6	6	682784	682789	100 %	0 %	0 %	0 %	62185211
14238	NC_004552	TCA	2	6	682840	682845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185211
14239	NC_004552	A	6	6	682860	682865	100 %	0 %	0 %	0 %	62185211
14240	NC_004552	TTG	2	6	682887	682892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62185211
14241	NC_004552	TCG	2	6	682979	682984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62185211
14242	NC_004552	AACA	2	8	683028	683035	75 %	0 %	0 %	25 %	62185211
14243	NC_004552	CAT	2	6	683061	683066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185211
14244	NC_004552	TTTA	2	8	683146	683153	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14245	NC_004552	AGAT	2	8	683171	683178	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14246	NC_004552	TCA	2	6	683209	683214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14247	NC_004552	CCTA	2	8	683226	683233	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14248	NC_004552	TGA	2	6	683486	683491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14249	NC_004552	TG	3	6	683543	683548	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14250	NC_004552	TAAA	2	8	683578	683585	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14251	NC_004552	GTT	2	6	683587	683592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14252	NC_004552	ACT	2	6	683601	683606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14253	NC_004552	TCTT	2	8	683612	683619	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14254	NC_004552	ATA	2	6	683650	683655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14255	NC_004552	TAC	2	6	683657	683662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14256	NC_004552	TTAGTG	2	12	683686	683697	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14257	NC_004552	TGC	2	6	683751	683756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14258	NC_004552	ACC	2	6	683766	683771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14259	NC_004552	CAC	2	6	683798	683803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14260	NC_004552	GTCTT	2	10	683824	683833	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
14261	NC_004552	CAG	2	6	683851	683856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14263	NC_004552	CTG	2	6	683893	683898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14265	NC_004552	TTC	2	6	683942	683947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14269	NC_004552	TGG	2	6	684194	684199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14270	NC_004552	AAG	2	6	684223	684228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14271	NC_004552	AGG	2	6	684266	684271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14272	NC_004552	TAAA	2	8	684289	684296	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14273	NC_004552	ACT	2	6	684309	684314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14275	NC_004552	TGA	2	6	684353	684358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14281	NC_004552	CAAGC	2	10	684629	684638	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
14282	NC_004552	CCT	2	6	684740	684745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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14284	NC_004552	CTC	2	6	684788	684793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14285	NC_004552	A	6	6	684857	684862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14286	NC_004552	CT	3	6	684935	684940	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14287	NC_004552	ACT	2	6	685004	685009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14288	NC_004552	TCTAG	2	10	685027	685036	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14289	NC_004552	TGA	2	6	685131	685136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14290	NC_004552	GCAGC	2	10	685142	685151	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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14293	NC_004552	TC	3	6	685468	685473	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14294	NC_004552	TAA	2	6	685575	685580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14296	NC_004552	CTT	2	6	685643	685648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14331	NC_004552	CAG	2	6	687069	687074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62185212
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14359	NC_004552	CTT	2	6	688618	688623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14360	NC_004552	GAA	2	6	688649	688654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14361	NC_004552	CTT	2	6	688669	688674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14362	NC_004552	T	6	6	688692	688697	0 %	100 %	0 %	0 %	62185213
14363	NC_004552	ATA	2	6	688775	688780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62185213
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14365	NC_004552	ATC	2	6	688872	688877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185213
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14371	NC_004552	ACTTC	2	10	689068	689077	20 %	40 %	0 %	40 %	62185213
14372	NC_004552	TCA	2	6	689188	689193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185213
14373	NC_004552	ACA	2	6	689254	689259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62185213
14374	NC_004552	CTT	2	6	689300	689305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185213
14375	NC_004552	CGATC	2	10	689328	689337	20 %	20 %	20 %	40 %	62185213
14376	NC_004552	AT	3	6	689362	689367	50 %	50 %	0 %	0 %	62185213
14377	NC_004552	CTT	2	6	689396	689401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185213
14378	NC_004552	CGC	2	6	689514	689519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62185213
14379	NC_004552	TTC	2	6	689571	689576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185213
14380	NC_004552	TTC	2	6	689583	689588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185213
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14384	NC_004552	GAT	2	6	689702	689707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185213
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14399	NC_004552	AT	3	6	690136	690141	50 %	50 %	0 %	0 %	62185213
14400	NC_004552	AAGA	2	8	690146	690153	75 %	0 %	25 %	0 %	62185213
14401	NC_004552	GCA	2	6	690160	690165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62185213
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14406	NC_004552	ATTC	2	8	690323	690330	25 %	50 %	0 %	25 %	62185213
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14431	NC_004552	T	7	7	691204	691210	0 %	100 %	0 %	0 %	62185213
14432	NC_004552	ACAAA	2	10	691320	691329	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
14433	NC_004552	A	6	6	691327	691332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14434	NC_004552	TCTA	2	8	691333	691340	25 %	50 %	0 %	25 %	62185214
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14447	NC_004552	TACT	2	8	691984	691991	25 %	50 %	0 %	25 %	62185214
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14463	NC_004552	GAATA	2	10	692967	692976	60 %	20 %	20 %	0 %	62185216
14464	NC_004552	AT	3	6	692980	692985	50 %	50 %	0 %	0 %	62185216
14465	NC_004552	AGT	2	6	693003	693008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185216
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14484	NC_004552	GCAA	2	8	694666	694673	50 %	0 %	25 %	25 %	62185217
14485	NC_004552	TGA	2	6	694705	694710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185217
14486	NC_004552	TGC	2	6	694759	694764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62185217
14487	NC_004552	CTAT	2	8	694910	694917	25 %	50 %	0 %	25 %	62185217
14488	NC_004552	GAA	2	6	694953	694958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185217
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14491	NC_004552	A	7	7	695069	695075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14492	NC_004552	TAA	2	6	695131	695136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14493	NC_004552	A	6	6	695389	695394	100 %	0 %	0 %	0 %	62185218
14494	NC_004552	C	7	7	695402	695408	0 %	0 %	0 %	100 %	62185218
14495	NC_004552	CAT	2	6	695472	695477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185218
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14499	NC_004552	CAG	2	6	695759	695764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62185219
14500	NC_004552	CA	3	6	695781	695786	50 %	0 %	0 %	50 %	62185219

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