MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila abortus S26/3

Total Repeats: 23950

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_004552	ATCT	2	8	623445	623452	25 %	50 %	0 %	25 %	62185166
13002	NC_004552	CAT	2	6	623481	623486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185166
13003	NC_004552	TAA	2	6	623512	623517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62185166
13004	NC_004552	TAA	2	6	623552	623557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62185166
13005	NC_004552	AG	3	6	623659	623664	50 %	0 %	50 %	0 %	62185166
13006	NC_004552	TCA	3	9	623714	623722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185166
13007	NC_004552	ATT	2	6	623773	623778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62185166
13008	NC_004552	AGTA	2	8	623794	623801	50 %	25 %	25 %	0 %	62185166
13009	NC_004552	TCA	2	6	623873	623878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185166
13010	NC_004552	CTTC	2	8	623909	623916	0 %	50 %	0 %	50 %	62185166
13011	NC_004552	CT	3	6	623944	623949	0 %	50 %	0 %	50 %	62185166
13012	NC_004552	TTC	4	12	623950	623961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185166
13013	NC_004552	CTT	2	6	623979	623984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185166
13014	NC_004552	TAA	2	6	624070	624075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62185166
13015	NC_004552	CCAG	2	8	624092	624099	25 %	0 %	25 %	50 %	62185166
13016	NC_004552	CGA	2	6	624111	624116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62185166
13017	NC_004552	T	6	6	624206	624211	0 %	100 %	0 %	0 %	62185166
13018	NC_004552	GAAA	2	8	624270	624277	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_004552	T	6	6	624346	624351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13020	NC_004552	TCT	2	6	624427	624432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13021	NC_004552	CT	3	6	624431	624436	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13022	NC_004552	AT	3	6	624547	624552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13023	NC_004552	ATT	2	6	624630	624635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13024	NC_004552	TAC	2	6	624734	624739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13025	NC_004552	A	7	7	624744	624750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13026	NC_004552	CTA	2	6	624838	624843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185167
13027	NC_004552	T	8	8	625026	625033	0 %	100 %	0 %	0 %	62185167
13028	NC_004552	ATGA	2	8	625041	625048	50 %	25 %	25 %	0 %	62185167
13029	NC_004552	AG	3	6	625068	625073	50 %	0 %	50 %	0 %	62185167
13030	NC_004552	TGAC	2	8	625090	625097	25 %	25 %	25 %	25 %	62185167
13031	NC_004552	T	6	6	625187	625192	0 %	100 %	0 %	0 %	62185167
13032	NC_004552	CTT	2	6	625197	625202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185167
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13034	NC_004552	GAA	2	6	625306	625311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185167
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13036	NC_004552	AGT	2	6	625402	625407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185167
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13038	NC_004552	GA	3	6	625564	625569	50 %	0 %	50 %	0 %	62185168
13039	NC_004552	AGAAA	2	10	625640	625649	80 %	0 %	20 %	0 %	62185168
13040	NC_004552	T	6	6	625653	625658	0 %	100 %	0 %	0 %	62185168
13041	NC_004552	A	6	6	625686	625691	100 %	0 %	0 %	0 %	62185168
13042	NC_004552	TCC	2	6	625708	625713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13043	NC_004552	ATT	2	6	625730	625735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13044	NC_004552	AAT	2	6	625763	625768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13045	NC_004552	AAC	2	6	625772	625777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13046	NC_004552	AGA	2	6	625793	625798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13047	NC_004552	GAT	2	6	625831	625836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_004552	A	6	6	625845	625850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_004552	ATTTT	2	10	625912	625921	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13050	NC_004552	GTTG	2	8	625953	625960	0 %	50 %	50 %	0 %	62185169
13051	NC_004552	AAT	2	6	625997	626002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62185169
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13054	NC_004552	GTA	2	6	626037	626042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185169
13055	NC_004552	CTT	2	6	626179	626184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185169
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13057	NC_004552	TTA	2	6	626337	626342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62185169
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13059	NC_004552	CTC	2	6	626512	626517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62185169
13060	NC_004552	CA	3	6	626537	626542	50 %	0 %	0 %	50 %	62185169
13061	NC_004552	AGA	2	6	626674	626679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13062	NC_004552	T	6	6	626685	626690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13063	NC_004552	ACAA	2	8	626733	626740	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13064	NC_004552	T	6	6	626760	626765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13065	NC_004552	ATT	2	6	626792	626797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13066	NC_004552	GGAT	2	8	626846	626853	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13067	NC_004552	ATTA	2	8	626892	626899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13068	NC_004552	ATA	2	6	626907	626912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_004552	GAGC	2	8	626951	626958	25 %	0 %	50 %	25 %	62185170
13070	NC_004552	CGG	2	6	626977	626982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62185170
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13074	NC_004552	AAGT	2	8	627171	627178	50 %	25 %	25 %	0 %	62185170
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13101	NC_004552	TA	3	6	628441	628446	50 %	50 %	0 %	0 %	62185170
13102	NC_004552	GA	3	6	628452	628457	50 %	0 %	50 %	0 %	62185170
13103	NC_004552	A	6	6	628472	628477	100 %	0 %	0 %	0 %	62185170
13104	NC_004552	TCTA	2	8	628513	628520	25 %	50 %	0 %	25 %	62185171
13105	NC_004552	TAT	2	6	628533	628538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62185171
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13107	NC_004552	TA	3	6	628582	628587	50 %	50 %	0 %	0 %	62185171
13108	NC_004552	GTTT	2	8	628621	628628	0 %	75 %	25 %	0 %	62185171
13109	NC_004552	CTT	2	6	628656	628661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185171
13110	NC_004552	TG	3	6	628786	628791	0 %	50 %	50 %	0 %	62185171
13111	NC_004552	T	7	7	628864	628870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13112	NC_004552	TTC	2	6	628875	628880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13113	NC_004552	GC	3	6	628887	628892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13114	NC_004552	CAT	2	6	628943	628948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13115	NC_004552	CATGAA	2	12	629093	629104	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13116	NC_004552	GC	3	6	629162	629167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13117	NC_004552	CAG	2	6	629168	629173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13118	NC_004552	AAT	2	6	629220	629225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13119	NC_004552	AGA	2	6	629232	629237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13120	NC_004552	ACA	2	6	629254	629259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13121	NC_004552	ATA	2	6	629263	629268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13122	NC_004552	GCT	2	6	629377	629382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13123	NC_004552	CTA	2	6	629402	629407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13124	NC_004552	TTG	2	6	629537	629542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13125	NC_004552	ACAGC	2	10	629553	629562	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
13126	NC_004552	AAC	2	6	629639	629644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13127	NC_004552	AGA	2	6	629750	629755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13128	NC_004552	AACA	2	8	629757	629764	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13129	NC_004552	TAA	2	6	629801	629806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13130	NC_004552	CAT	2	6	629809	629814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13131	NC_004552	ACA	2	6	629901	629906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13132	NC_004552	AAT	2	6	629969	629974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13133	NC_004552	ATT	2	6	629983	629988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13134	NC_004552	TAA	2	6	630011	630016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13135	NC_004552	CAA	2	6	630058	630063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13136	NC_004552	A	6	6	630069	630074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13137	NC_004552	TAA	2	6	630198	630203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62185172
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13149	NC_004552	AGGT	2	8	630869	630876	25 %	25 %	50 %	0 %	62185172
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13159	NC_004552	GAA	2	6	631132	631137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13165	NC_004552	T	7	7	631317	631323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13241	NC_004552	TGTC	2	8	634809	634816	0 %	50 %	25 %	25 %	62185175
13242	NC_004552	TA	3	6	634889	634894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13243	NC_004552	T	6	6	635010	635015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13244	NC_004552	GCA	2	6	635020	635025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13245	NC_004552	TCC	2	6	635061	635066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62185176
13246	NC_004552	A	6	6	635075	635080	100 %	0 %	0 %	0 %	62185176
13247	NC_004552	TACC	2	8	635212	635219	25 %	25 %	0 %	50 %	62185176
13248	NC_004552	CGC	2	6	635251	635256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62185176
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13251	NC_004552	A	9	9	635375	635383	100 %	0 %	0 %	0 %	62185176
13252	NC_004552	CATC	2	8	635391	635398	25 %	25 %	0 %	50 %	62185176
13253	NC_004552	TGA	2	6	635410	635415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185176
13254	NC_004552	GTA	2	6	635445	635450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185176
13255	NC_004552	CTT	2	6	635455	635460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185176
13256	NC_004552	ATC	2	6	635507	635512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185176
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