MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila abortus S26/3

Total Repeats: 23950

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_004552	ATG	3	9	554527	554535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185109
11502	NC_004552	TGG	2	6	554553	554558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62185109
11503	NC_004552	AGG	3	9	554591	554599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62185109
11504	NC_004552	TTA	2	6	554627	554632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62185109
11505	NC_004552	TTTA	2	8	554666	554673	25 %	75 %	0 %	0 %	62185109
11506	NC_004552	ATG	2	6	554788	554793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185109
11507	NC_004552	AGA	2	6	554828	554833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185109
11508	NC_004552	TGA	2	6	554879	554884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11509	NC_004552	AGT	2	6	555000	555005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11510	NC_004552	CAG	2	6	555092	555097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11511	NC_004552	ATC	2	6	555110	555115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185110
11512	NC_004552	TCT	2	6	555129	555134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185110
11513	NC_004552	TTTATC	2	12	555254	555265	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	62185110
11514	NC_004552	AG	3	6	555266	555271	50 %	0 %	50 %	0 %	62185110
11515	NC_004552	ATC	2	6	555312	555317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185110
11516	NC_004552	CATA	2	8	555382	555389	50 %	25 %	0 %	25 %	62185110
11517	NC_004552	A	6	6	555402	555407	100 %	0 %	0 %	0 %	62185110
11518	NC_004552	TTC	2	6	555419	555424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185110
11519	NC_004552	TCG	2	6	555590	555595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62185110
11520	NC_004552	GAA	2	6	555609	555614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185110
11521	NC_004552	GTAT	2	8	555635	555642	25 %	50 %	25 %	0 %	62185110
11522	NC_004552	CTTA	2	8	555661	555668	25 %	50 %	0 %	25 %	62185110
11523	NC_004552	TTGTA	2	10	555672	555681	20 %	60 %	20 %	0 %	62185110
11524	NC_004552	TCT	2	6	555816	555821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185110
11525	NC_004552	TA	3	6	555822	555827	50 %	50 %	0 %	0 %	62185110
11526	NC_004552	GTC	2	6	555930	555935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62185110
11527	NC_004552	ATT	2	6	555938	555943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62185110
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11529	NC_004552	TTG	2	6	556050	556055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62185110
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11533	NC_004552	ATC	2	6	556154	556159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185110
11534	NC_004552	TCT	2	6	556160	556165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185110
11535	NC_004552	AAAG	2	8	556218	556225	75 %	0 %	25 %	0 %	62185110
11536	NC_004552	TGC	2	6	556241	556246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62185110
11537	NC_004552	GTG	2	6	556293	556298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62185110
11538	NC_004552	TGA	2	6	556325	556330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185110
11539	NC_004552	A	8	8	556442	556449	100 %	0 %	0 %	0 %	62185110
11540	NC_004552	GTT	2	6	556457	556462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62185110
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11542	NC_004552	ATTT	2	8	556590	556597	25 %	75 %	0 %	0 %	62185110
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11545	NC_004552	TTAT	2	8	556679	556686	25 %	75 %	0 %	0 %	62185110
11546	NC_004552	TAT	2	6	556735	556740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62185110
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11549	NC_004552	TAC	2	6	556897	556902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185110
11550	NC_004552	TATTTT	2	12	556924	556935	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	62185110
11551	NC_004552	ACG	2	6	556940	556945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62185110
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11553	NC_004552	TTA	2	6	557015	557020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62185110
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11557	NC_004552	TGG	2	6	557202	557207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62185110
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11562	NC_004552	GAT	2	6	557591	557596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185111
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11589	NC_004552	A	6	6	558744	558749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11590	NC_004552	GT	3	6	558791	558796	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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11603	NC_004552	ATAA	2	8	559437	559444	75 %	25 %	0 %	0 %	62185112
11604	NC_004552	CTT	2	6	559449	559454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185112
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11607	NC_004552	GGA	2	6	559616	559621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62185112
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11611	NC_004552	CATAC	2	10	559746	559755	40 %	20 %	0 %	40 %	62185112
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11614	NC_004552	TTTG	2	8	559840	559847	0 %	75 %	25 %	0 %	62185112
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11621	NC_004552	GTA	2	6	560362	560367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185113
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11623	NC_004552	TG	3	6	560450	560455	0 %	50 %	50 %	0 %	62185113
11624	NC_004552	CTT	2	6	560457	560462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185113
11625	NC_004552	GAG	2	6	560463	560468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62185113
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11628	NC_004552	CTG	2	6	560676	560681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62185113
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11630	NC_004552	TG	3	6	560801	560806	0 %	50 %	50 %	0 %	62185113
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11648	NC_004552	TTC	2	6	561844	561849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185114
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11668	NC_004552	CTTT	2	8	562948	562955	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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11731	NC_004552	TTG	2	6	565701	565706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62185116
11732	NC_004552	AGA	2	6	565737	565742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185116
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11739	NC_004552	GTA	2	6	566091	566096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11742	NC_004552	CTT	2	6	566166	566171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185117
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11875	NC_004552	TGT	2	6	572436	572441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62185122
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11877	NC_004552	ATTG	2	8	572487	572494	25 %	50 %	25 %	0 %	62185122
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11882	NC_004552	ATT	2	6	572779	572784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62185122
11883	NC_004552	GAT	2	6	572797	572802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185122
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11891	NC_004552	AGAA	2	8	573166	573173	75 %	0 %	25 %	0 %	62185122
11892	NC_004552	TGA	2	6	573204	573209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185122
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11981	NC_004552	TGA	2	6	577923	577928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62185127
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11983	NC_004552	TC	3	6	577979	577984	0 %	50 %	0 %	50 %	62185127
11984	NC_004552	TCT	2	6	578027	578032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185127
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11986	NC_004552	AT	3	6	578102	578107	50 %	50 %	0 %	0 %	62185127
11987	NC_004552	A	8	8	578108	578115	100 %	0 %	0 %	0 %	62185127
11988	NC_004552	GA	3	6	578145	578150	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11989	NC_004552	AGA	2	6	578160	578165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11992	NC_004552	AGG	2	6	578295	578300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62185128
11993	NC_004552	GGC	2	6	578323	578328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62185128
11994	NC_004552	ACT	2	6	578386	578391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62185128
11995	NC_004552	GAA	2	6	578411	578416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62185128
11996	NC_004552	G	6	6	578417	578422	0 %	0 %	100 %	0 %	62185128
11997	NC_004552	TTC	2	6	578491	578496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62185128
11998	NC_004552	GGT	2	6	578548	578553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62185128
11999	NC_004552	CT	3	6	578632	578637	0 %	50 %	0 %	50 %	62185128
12000	NC_004552	GTT	2	6	578703	578708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62185128

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