MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Colwellia psychrerythraea 34H chromosome

Total Repeats: 115616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
104001	NC_003910	TGC	2	6	4839445	4839450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71279705
104002	NC_003910	CAT	2	6	4839451	4839456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71279705
104003	NC_003910	TTA	2	6	4839487	4839492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71279705
104004	NC_003910	CAA	2	6	4839517	4839522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71279705
104005	NC_003910	CAA	2	6	4839529	4839534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71279705
104006	NC_003910	TCA	2	6	4839561	4839566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71279705
104007	NC_003910	GCA	2	6	4839604	4839609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71279705
104008	NC_003910	A	6	6	4839666	4839671	100 %	0 %	0 %	0 %	71279705
104009	NC_003910	ATC	2	6	4839674	4839679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71279705
104010	NC_003910	A	6	6	4839690	4839695	100 %	0 %	0 %	0 %	71279705
104011	NC_003910	TAA	2	6	4839764	4839769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71279705
104012	NC_003910	ATTC	2	8	4839784	4839791	25 %	50 %	0 %	25 %	71279705
104013	NC_003910	TCA	2	6	4839819	4839824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71279705
104014	NC_003910	CAC	2	6	4839866	4839871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71279705
104015	NC_003910	CAAT	2	8	4839889	4839896	50 %	25 %	0 %	25 %	71279705
104016	NC_003910	TCA	2	6	4839964	4839969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71279705
104017	NC_003910	TCA	2	6	4840016	4840021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71279231
104018	NC_003910	TAA	2	6	4840077	4840082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71279231
104019	NC_003910	CTG	2	6	4840087	4840092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71279231
104020	NC_003910	CTTTGC	2	12	4840122	4840133	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	71279231
104021	NC_003910	T	6	6	4840139	4840144	0 %	100 %	0 %	0 %	71279231
104022	NC_003910	GGC	2	6	4840145	4840150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71279231
104023	NC_003910	CAA	2	6	4840173	4840178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71279231
104024	NC_003910	ATT	2	6	4840240	4840245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71279231
104025	NC_003910	ATC	3	9	4840343	4840351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71279231
104026	NC_003910	AG	3	6	4840487	4840492	50 %	0 %	50 %	0 %	71278555
104027	NC_003910	ATT	2	6	4840509	4840514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71278555
104028	NC_003910	TTCTC	2	10	4840515	4840524	0 %	60 %	0 %	40 %	71278555
104029	NC_003910	CTTC	2	8	4840528	4840535	0 %	50 %	0 %	50 %	71278555
104030	NC_003910	GTC	2	6	4840550	4840555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71278555
104031	NC_003910	TTC	2	6	4840640	4840645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71278555
104032	NC_003910	CAT	2	6	4840702	4840707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71278555
104033	NC_003910	CAA	2	6	4840711	4840716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71278555
104034	NC_003910	T	6	6	4840730	4840735	0 %	100 %	0 %	0 %	71278555
104035	NC_003910	ATT	2	6	4840757	4840762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71278555
104036	NC_003910	CAG	2	6	4840777	4840782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71278555
104037	NC_003910	ACC	3	9	4840893	4840901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71278555
104038	NC_003910	GAT	2	6	4840963	4840968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104039	NC_003910	TTAC	2	8	4841087	4841094	25 %	50 %	0 %	25 %	71282502
104040	NC_003910	ATC	2	6	4841124	4841129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71282502
104041	NC_003910	ACG	2	6	4841262	4841267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71282502
104042	NC_003910	TA	3	6	4841348	4841353	50 %	50 %	0 %	0 %	71282502
104043	NC_003910	GC	3	6	4841407	4841412	0 %	0 %	50 %	50 %	71282502
104044	NC_003910	ACC	2	6	4841473	4841478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71282502
104045	NC_003910	T	6	6	4841508	4841513	0 %	100 %	0 %	0 %	71282502
104046	NC_003910	GCC	2	6	4841584	4841589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71281766
104047	NC_003910	CT	3	6	4841716	4841721	0 %	50 %	0 %	50 %	71281766
104048	NC_003910	T	6	6	4841769	4841774	0 %	100 %	0 %	0 %	71281766
104049	NC_003910	CAT	2	6	4841797	4841802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71281766
104050	NC_003910	AAC	2	6	4841810	4841815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71281766
104051	NC_003910	AC	3	6	4841832	4841837	50 %	0 %	0 %	50 %	71281766
104052	NC_003910	GTCG	2	8	4841863	4841870	0 %	25 %	50 %	25 %	71281766
104053	NC_003910	T	6	6	4841884	4841889	0 %	100 %	0 %	0 %	71281766
104054	NC_003910	AT	3	6	4841891	4841896	50 %	50 %	0 %	0 %	71281766
104055	NC_003910	AATA	2	8	4842032	4842039	75 %	25 %	0 %	0 %	71281766
104056	NC_003910	TGA	2	6	4842041	4842046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71281766
104057	NC_003910	T	6	6	4842068	4842073	0 %	100 %	0 %	0 %	71281766
104058	NC_003910	ACA	2	6	4842087	4842092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71281766
104059	NC_003910	TAC	2	6	4842094	4842099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71281766
104060	NC_003910	TGC	2	6	4842100	4842105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71281766
104061	NC_003910	GAA	2	6	4842138	4842143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71281766
104062	NC_003910	CTG	2	6	4842149	4842154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71281766
104063	NC_003910	TAC	2	6	4842223	4842228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71281766
104064	NC_003910	GCA	2	6	4842605	4842610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71281766
104065	NC_003910	CCA	2	6	4842623	4842628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71281766
104066	NC_003910	T	7	7	4842654	4842660	0 %	100 %	0 %	0 %	71281766
104067	NC_003910	T	6	6	4842670	4842675	0 %	100 %	0 %	0 %	71281766
104068	NC_003910	T	6	6	4842772	4842777	0 %	100 %	0 %	0 %	71281766
104069	NC_003910	TGC	2	6	4842814	4842819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71281766
104070	NC_003910	T	6	6	4842825	4842830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104071	NC_003910	ATG	2	6	4842864	4842869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104072	NC_003910	AAT	2	6	4842870	4842875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104073	NC_003910	CCT	2	6	4842907	4842912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	71281400
104074	NC_003910	CGA	2	6	4842954	4842959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71281400
104075	NC_003910	CAAC	2	8	4843104	4843111	50 %	0 %	0 %	50 %	71281400
104076	NC_003910	ATC	2	6	4843136	4843141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71281400
104077	NC_003910	TAA	2	6	4843151	4843156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71281400
104078	NC_003910	TCA	2	6	4843170	4843175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71281400
104079	NC_003910	GTAC	2	8	4843209	4843216	25 %	25 %	25 %	25 %	71281400
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104081	NC_003910	CAC	2	6	4843403	4843408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71281400
104082	NC_003910	ATGTC	2	10	4843450	4843459	20 %	40 %	20 %	20 %	71281400
104083	NC_003910	ATCT	2	8	4843547	4843554	25 %	50 %	0 %	25 %	71281400
104084	NC_003910	GTCA	2	8	4843664	4843671	25 %	25 %	25 %	25 %	71281400
104085	NC_003910	TAA	2	6	4843712	4843717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71281400
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104087	NC_003910	CTTT	2	8	4843980	4843987	0 %	75 %	0 %	25 %	71281400
104088	NC_003910	CAT	2	6	4844117	4844122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71281400
104089	NC_003910	AGA	2	6	4844135	4844140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71281400
104090	NC_003910	AAT	2	6	4844166	4844171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71281400
104091	NC_003910	A	6	6	4844190	4844195	100 %	0 %	0 %	0 %	71281400
104092	NC_003910	CGA	2	6	4844223	4844228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71281400
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104101	NC_003910	GGT	2	6	4844510	4844515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71280718
104102	NC_003910	AGGTT	2	10	4844517	4844526	20 %	40 %	40 %	0 %	71280718
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104104	NC_003910	TC	3	6	4844853	4844858	0 %	50 %	0 %	50 %	71280718
104105	NC_003910	TTA	2	6	4844861	4844866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71280718
104106	NC_003910	CTGA	2	8	4844894	4844901	25 %	25 %	25 %	25 %	71280718
104107	NC_003910	CTT	2	6	4844907	4844912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71280718
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104109	NC_003910	TTCA	2	8	4844941	4844948	25 %	50 %	0 %	25 %	71280718
104110	NC_003910	CTT	2	6	4844979	4844984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71280718
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104117	NC_003910	CAT	2	6	4845184	4845189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71280718
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104472	NC_003910	TCG	2	6	4860424	4860429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71281982
104473	NC_003910	TGA	2	6	4860504	4860509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71281982
104474	NC_003910	TGC	2	6	4860530	4860535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71281982
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