MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Colwellia psychrerythraea 34H chromosome

Total Repeats: 115616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
100001	NC_003910	TCT	2	6	4651654	4651659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71278607
100002	NC_003910	TTCT	2	8	4651663	4651670	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
100003	NC_003910	CTA	2	6	4651790	4651795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100004	NC_003910	A	8	8	4651838	4651845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100005	NC_003910	TTTA	2	8	4651902	4651909	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100006	NC_003910	A	8	8	4651965	4651972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100007	NC_003910	AGCA	2	8	4651982	4651989	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
100008	NC_003910	A	6	6	4652087	4652092	100 %	0 %	0 %	0 %	71277837
100009	NC_003910	A	6	6	4652102	4652107	100 %	0 %	0 %	0 %	71277837
100010	NC_003910	CAA	2	6	4652172	4652177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71277837
100011	NC_003910	AGT	2	6	4652212	4652217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71277837
100012	NC_003910	TTA	2	6	4652279	4652284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71277837
100013	NC_003910	AAG	2	6	4652388	4652393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71277837
100014	NC_003910	TGC	2	6	4652398	4652403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71277837
100015	NC_003910	AAC	2	6	4652454	4652459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71277837
100016	NC_003910	TGAGCT	2	12	4652521	4652532	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	71277837
100017	NC_003910	TTC	2	6	4652566	4652571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71277837
100018	NC_003910	AGA	2	6	4652637	4652642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71277837
100019	NC_003910	CCA	2	6	4652671	4652676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71277837
100020	NC_003910	CA	3	6	4652680	4652685	50 %	0 %	0 %	50 %	71277837
100021	NC_003910	AGC	3	9	4652703	4652711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71277837
100022	NC_003910	ACTT	2	8	4652724	4652731	25 %	50 %	0 %	25 %	71277837
100023	NC_003910	AAC	2	6	4652733	4652738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71277837
100024	NC_003910	TGA	2	6	4652743	4652748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71277837
100025	NC_003910	GTAG	2	8	4652840	4652847	25 %	25 %	50 %	0 %	71277837
100026	NC_003910	TGA	2	6	4652848	4652853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71277837
100027	NC_003910	ATTG	2	8	4652857	4652864	25 %	50 %	25 %	0 %	71277837
100028	NC_003910	GTT	2	6	4652975	4652980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71277837
100029	NC_003910	TGCT	2	8	4652994	4653001	0 %	50 %	25 %	25 %	71277837
100030	NC_003910	TGA	2	6	4653013	4653018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71277837
100031	NC_003910	CAA	2	6	4653080	4653085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71277837
100032	NC_003910	AG	3	6	4653174	4653179	50 %	0 %	50 %	0 %	71277837
100033	NC_003910	A	6	6	4653202	4653207	100 %	0 %	0 %	0 %	71277837
100034	NC_003910	ATT	2	6	4653296	4653301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71277837
100035	NC_003910	AAAT	2	8	4653516	4653523	75 %	25 %	0 %	0 %	71281623
100036	NC_003910	TTG	2	6	4653534	4653539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71281623
100037	NC_003910	TAT	2	6	4653583	4653588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71281623
100038	NC_003910	ACGC	2	8	4653664	4653671	25 %	0 %	25 %	50 %	71281623
100039	NC_003910	GTT	2	6	4653771	4653776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71281623
100040	NC_003910	CAA	3	9	4653872	4653880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71281623
100041	NC_003910	TATTGC	2	12	4653883	4653894	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	71281623
100042	NC_003910	TTG	2	6	4653903	4653908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71281623
100043	NC_003910	ACCTG	2	10	4653913	4653922	20 %	20 %	20 %	40 %	71281623
100044	NC_003910	TGA	2	6	4653931	4653936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71281623
100045	NC_003910	AAC	2	6	4653990	4653995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71281623
100046	NC_003910	TAA	2	6	4653997	4654002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71281623
100047	NC_003910	CCA	2	6	4654011	4654016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71281623
100048	NC_003910	ATTTCA	2	12	4654276	4654287	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	71282275
100049	NC_003910	TTG	2	6	4654294	4654299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71282275
100050	NC_003910	TGG	2	6	4654475	4654480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71282275
100051	NC_003910	ACG	2	6	4654501	4654506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71282275
100052	NC_003910	ATG	2	6	4654511	4654516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71282275
100053	NC_003910	GAT	2	6	4654564	4654569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71282275
100054	NC_003910	AGA	2	6	4654896	4654901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71282275
100055	NC_003910	A	7	7	4654965	4654971	100 %	0 %	0 %	0 %	71282275
100056	NC_003910	ATT	2	6	4655034	4655039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71282275
100057	NC_003910	CCG	2	6	4655042	4655047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71282275
100058	NC_003910	TTA	2	6	4655059	4655064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71282275
100059	NC_003910	CTA	2	6	4655080	4655085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71282275
100060	NC_003910	GAA	2	6	4655111	4655116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71282275
100061	NC_003910	ATT	2	6	4655169	4655174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71282275
100062	NC_003910	GTTTT	2	10	4655198	4655207	0 %	80 %	20 %	0 %	71282275
100063	NC_003910	TTA	2	6	4655224	4655229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71282275
100064	NC_003910	CAC	2	6	4655310	4655315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71282275
100065	NC_003910	TTGATA	2	12	4655378	4655389	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	71282275
100066	NC_003910	TAG	2	6	4655415	4655420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71282275
100067	NC_003910	GAA	2	6	4655608	4655613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71282275
100068	NC_003910	GT	3	6	4655678	4655683	0 %	50 %	50 %	0 %	71282275
100069	NC_003910	AAC	2	6	4655696	4655701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71282275
100070	NC_003910	TTA	2	6	4655720	4655725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71282275
100071	NC_003910	TGA	2	6	4655775	4655780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71282275
100072	NC_003910	ACC	2	6	4656006	4656011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71282275
100073	NC_003910	GGT	2	6	4656027	4656032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71282275
100074	NC_003910	TGC	2	6	4656312	4656317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71282275
100075	NC_003910	TTAGGT	2	12	4656457	4656468	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	71282275
100076	NC_003910	TAT	2	6	4656471	4656476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71282275
100077	NC_003910	CAA	2	6	4656493	4656498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71282275
100078	NC_003910	ATT	2	6	4656571	4656576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71282275
100079	NC_003910	TTA	2	6	4656654	4656659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100080	NC_003910	TTTC	2	8	4656773	4656780	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
100081	NC_003910	TTA	2	6	4656798	4656803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100082	NC_003910	CCA	2	6	4656861	4656866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71278122
100083	NC_003910	TGA	4	12	4656877	4656888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71278122
100084	NC_003910	TTA	2	6	4656911	4656916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71278122
100085	NC_003910	ATT	2	6	4656938	4656943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71278122
100086	NC_003910	ACA	2	6	4656985	4656990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71278122
100087	NC_003910	TTG	2	6	4657004	4657009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71278122
100088	NC_003910	AAG	2	6	4657044	4657049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71278122
100089	NC_003910	CTA	2	6	4657190	4657195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71278122
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100091	NC_003910	TTGC	2	8	4657394	4657401	0 %	50 %	25 %	25 %	71278122
100092	NC_003910	TCA	2	6	4657411	4657416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71278122
100093	NC_003910	ATC	2	6	4657420	4657425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71278122
100094	NC_003910	GGC	2	6	4657459	4657464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71278122
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100096	NC_003910	TCA	2	6	4657501	4657506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71278122
100097	NC_003910	T	6	6	4657577	4657582	0 %	100 %	0 %	0 %	71278122
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100100	NC_003910	TAT	2	6	4657758	4657763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71278122
100101	NC_003910	ACA	2	6	4657915	4657920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71278122
100102	NC_003910	GCG	2	6	4657983	4657988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71278122
100103	NC_003910	ACAGC	2	10	4657997	4658006	40 %	0 %	20 %	40 %	71278122
100104	NC_003910	ATT	2	6	4658008	4658013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71278122
100105	NC_003910	TTGA	2	8	4658081	4658088	25 %	50 %	25 %	0 %	71278122
100106	NC_003910	AGC	2	6	4658125	4658130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71278122
100107	NC_003910	AT	3	6	4658142	4658147	50 %	50 %	0 %	0 %	71278122
100108	NC_003910	TCA	2	6	4658188	4658193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71278122
100109	NC_003910	AAT	2	6	4658199	4658204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71278122
100110	NC_003910	TAA	2	6	4658216	4658221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100111	NC_003910	CACT	2	8	4658308	4658315	25 %	25 %	0 %	50 %	71278663
100112	NC_003910	T	8	8	4658358	4658365	0 %	100 %	0 %	0 %	71278663
100113	NC_003910	GCTT	2	8	4658384	4658391	0 %	50 %	25 %	25 %	71278663
100114	NC_003910	CAT	2	6	4658420	4658425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71278663
100115	NC_003910	TAC	2	6	4658432	4658437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71278663
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100117	NC_003910	TTA	2	6	4658502	4658507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71278663
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