MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila caviae GPIC chromosome

Total Repeats: 24952

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_003361	CTAA	2	8	751835	751842	50 %	25 %	0 %	25 %	29840418
16003	NC_003361	CCTAT	2	10	751904	751913	20 %	40 %	0 %	40 %	29840418
16004	NC_003361	TGTA	2	8	751941	751948	25 %	50 %	25 %	0 %	29840418
16005	NC_003361	CTGAG	2	10	751981	751990	20 %	20 %	40 %	20 %	29840418
16006	NC_003361	CTT	2	6	752004	752009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840418
16007	NC_003361	AAC	3	9	752107	752115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29840418
16008	NC_003361	CCT	2	6	752171	752176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29840418
16009	NC_003361	CTT	2	6	752229	752234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840418
16010	NC_003361	CAT	2	6	752235	752240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29840418
16011	NC_003361	GTTTCA	2	12	752300	752311	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	29840418
16012	NC_003361	GCT	2	6	752366	752371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29840418
16013	NC_003361	TAG	2	6	752451	752456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29840418
16014	NC_003361	GCT	2	6	752501	752506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29840418
16015	NC_003361	CGCA	2	8	752524	752531	25 %	0 %	25 %	50 %	29840418
16016	NC_003361	ATC	3	9	752551	752559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29840418
16017	NC_003361	GGA	2	6	752567	752572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29840418
16018	NC_003361	CTT	2	6	752634	752639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840418
16019	NC_003361	TAGCA	2	10	752641	752650	40 %	20 %	20 %	20 %	29840418
16020	NC_003361	CTT	2	6	752682	752687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840418
16021	NC_003361	ATC	2	6	752689	752694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29840418
16022	NC_003361	T	6	6	752703	752708	0 %	100 %	0 %	0 %	29840418
16023	NC_003361	CTTA	2	8	752764	752771	25 %	50 %	0 %	25 %	29840418
16024	NC_003361	CTA	2	6	752774	752779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29840418
16025	NC_003361	ACTTCC	2	12	752822	752833	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	29840418
16026	NC_003361	T	7	7	752861	752867	0 %	100 %	0 %	0 %	29840418
16027	NC_003361	TCAA	2	8	752882	752889	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16028	NC_003361	T	7	7	752940	752946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16029	NC_003361	CTC	2	6	752976	752981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16030	NC_003361	CAT	2	6	753084	753089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16031	NC_003361	A	7	7	753136	753142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16032	NC_003361	AAC	2	6	753149	753154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16033	NC_003361	TTG	2	6	753158	753163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16034	NC_003361	A	8	8	753210	753217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16035	NC_003361	TTTCTT	2	12	753296	753307	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	29840419
16036	NC_003361	T	6	6	753317	753322	0 %	100 %	0 %	0 %	29840419
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16044	NC_003361	C	6	6	753797	753802	0 %	0 %	0 %	100 %	29840420
16045	NC_003361	T	8	8	753874	753881	0 %	100 %	0 %	0 %	29840420
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16054	NC_003361	CT	3	6	754135	754140	0 %	50 %	0 %	50 %	29840420
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16057	NC_003361	TTC	2	6	754275	754280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840420
16058	NC_003361	TGT	2	6	754374	754379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29840420
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16062	NC_003361	A	6	6	754513	754518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16063	NC_003361	TTGA	2	8	754551	754558	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16064	NC_003361	T	6	6	754591	754596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16109	NC_003361	GCT	2	6	757617	757622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29840422
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