MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila caviae GPIC chromosome

Total Repeats: 24952

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_003361	TCC	2	6	657056	657061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29840330
14003	NC_003361	GGA	2	6	657063	657068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29840330
14004	NC_003361	ATA	2	6	657126	657131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29840330
14005	NC_003361	TAA	2	6	657140	657145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29840330
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14009	NC_003361	CGG	2	6	657502	657507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29840331
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14012	NC_003361	T	7	7	657748	657754	0 %	100 %	0 %	0 %	29840331
14013	NC_003361	TTC	2	6	657757	657762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840331
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14015	NC_003361	ACCAGG	2	12	657838	657849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29840331
14016	NC_003361	GGC	2	6	658111	658116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29840331
14017	NC_003361	TCT	2	6	658145	658150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840331
14018	NC_003361	AGAGA	2	10	658211	658220	60 %	0 %	40 %	0 %	29840331
14019	NC_003361	TTG	2	6	658222	658227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29840331
14020	NC_003361	CTT	2	6	658233	658238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840331
14021	NC_003361	TTCT	2	8	658247	658254	0 %	75 %	0 %	25 %	29840331
14022	NC_003361	ACAAG	2	10	658279	658288	60 %	0 %	20 %	20 %	29840331
14023	NC_003361	AGA	2	6	658327	658332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29840331
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14031	NC_003361	ACTTC	2	10	658739	658748	20 %	40 %	0 %	40 %	29840331
14032	NC_003361	TCC	2	6	658861	658866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29840331
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14036	NC_003361	T	8	8	658959	658966	0 %	100 %	0 %	0 %	29840331
14037	NC_003361	TAT	2	6	659033	659038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29840332
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14040	NC_003361	CGT	2	6	659214	659219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29840332
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14042	NC_003361	T	6	6	659269	659274	0 %	100 %	0 %	0 %	29840332
14043	NC_003361	TTC	2	6	659312	659317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840332
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14053	NC_003361	ACT	2	6	659837	659842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29840332
14054	NC_003361	TCC	2	6	659923	659928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29840332
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14062	NC_003361	TCA	2	6	660168	660173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14063	NC_003361	TAA	2	6	660175	660180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14069	NC_003361	A	6	6	660410	660415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14093	NC_003361	CAT	2	6	661479	661484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14094	NC_003361	TGA	2	6	661517	661522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14096	NC_003361	AAG	2	6	661544	661549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14097	NC_003361	ATT	2	6	661607	661612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14101	NC_003361	AT	3	6	661671	661676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14102	NC_003361	CCAA	2	8	661682	661689	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14103	NC_003361	TAA	2	6	661694	661699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14106	NC_003361	ACA	3	9	661922	661930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29840334
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14108	NC_003361	TGAA	2	8	662228	662235	50 %	25 %	25 %	0 %	29840334
14109	NC_003361	AAAC	2	8	662271	662278	75 %	0 %	0 %	25 %	29840335
14110	NC_003361	A	6	6	662283	662288	100 %	0 %	0 %	0 %	29840335
14111	NC_003361	A	7	7	662322	662328	100 %	0 %	0 %	0 %	29840335
14112	NC_003361	TAT	2	6	662354	662359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14113	NC_003361	T	7	7	662359	662365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14114	NC_003361	CAAA	2	8	662389	662396	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14115	NC_003361	GTT	2	6	662404	662409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14116	NC_003361	CTT	2	6	662469	662474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840336
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14126	NC_003361	A	6	6	662853	662858	100 %	0 %	0 %	0 %	29840336
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14249	NC_003361	TCT	2	6	668872	668877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14251	NC_003361	ACA	2	6	668897	668902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14252	NC_003361	AAGAG	2	10	668909	668918	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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