MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila caviae GPIC chromosome

Total Repeats: 24952

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_003361	GCA	2	6	608308	608313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29840298
13002	NC_003361	TAGGG	2	10	608357	608366	20 %	20 %	60 %	0 %	29840298
13003	NC_003361	T	6	6	608412	608417	0 %	100 %	0 %	0 %	29840298
13004	NC_003361	TC	3	6	608420	608425	0 %	50 %	0 %	50 %	29840298
13005	NC_003361	TC	3	6	608484	608489	0 %	50 %	0 %	50 %	29840298
13006	NC_003361	ATAGGG	2	12	608561	608572	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	29840298
13007	NC_003361	ACTT	2	8	608613	608620	25 %	50 %	0 %	25 %	29840298
13008	NC_003361	GAA	2	6	608720	608725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29840298
13009	NC_003361	TG	3	6	608760	608765	0 %	50 %	50 %	0 %	29840298
13010	NC_003361	TTTC	2	8	608773	608780	0 %	75 %	0 %	25 %	29840298
13011	NC_003361	TAG	2	6	608804	608809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29840298
13012	NC_003361	ATCTT	2	10	608818	608827	20 %	60 %	0 %	20 %	29840298
13013	NC_003361	T	6	6	608830	608835	0 %	100 %	0 %	0 %	29840298
13014	NC_003361	TTA	2	6	608914	608919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29840298
13015	NC_003361	AAC	2	6	608956	608961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29840298
13016	NC_003361	GAG	3	9	608976	608984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29840298
13017	NC_003361	AGTTA	2	10	609037	609046	40 %	40 %	20 %	0 %	29840299
13018	NC_003361	CTT	2	6	609060	609065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840299
13019	NC_003361	GTA	2	6	609076	609081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29840299
13020	NC_003361	TCA	2	6	609201	609206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29840299
13021	NC_003361	TC	3	6	609254	609259	0 %	50 %	0 %	50 %	29840299
13022	NC_003361	ATT	2	6	609329	609334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29840299
13023	NC_003361	CAAC	2	8	609536	609543	50 %	0 %	0 %	50 %	29840299
13024	NC_003361	TCT	2	6	609609	609614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840299
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13026	NC_003361	TCT	2	6	609678	609683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840299
13027	NC_003361	TCTTT	2	10	609718	609727	0 %	80 %	0 %	20 %	29840299
13028	NC_003361	T	6	6	609725	609730	0 %	100 %	0 %	0 %	29840299
13029	NC_003361	TTC	2	6	609734	609739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840299
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13031	NC_003361	CAT	2	6	609788	609793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29840299
13032	NC_003361	AAG	2	6	609834	609839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29840299
13033	NC_003361	TGCCTA	2	12	609850	609861	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	29840299
13034	NC_003361	TCAC	2	8	609867	609874	25 %	25 %	0 %	50 %	29840299
13035	NC_003361	CAA	2	6	609909	609914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29840299
13036	NC_003361	TTTC	2	8	609964	609971	0 %	75 %	0 %	25 %	29840299
13037	NC_003361	CGATA	2	10	609985	609994	40 %	20 %	20 %	20 %	29840299
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13039	NC_003361	A	6	6	610120	610125	100 %	0 %	0 %	0 %	29840299
13040	NC_003361	GCTTAT	2	12	610126	610137	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	29840299
13041	NC_003361	TC	3	6	610235	610240	0 %	50 %	0 %	50 %	29840299
13042	NC_003361	GAGAA	2	10	610264	610273	60 %	0 %	40 %	0 %	29840299
13043	NC_003361	TTC	2	6	610370	610375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840299
13044	NC_003361	TCTT	2	8	610396	610403	0 %	75 %	0 %	25 %	29840299
13045	NC_003361	TAA	2	6	610450	610455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29840299
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13048	NC_003361	CA	3	6	610520	610525	50 %	0 %	0 %	50 %	29840299
13049	NC_003361	GGA	2	6	610527	610532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29840299
13050	NC_003361	A	7	7	610630	610636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13051	NC_003361	GAA	2	6	610653	610658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13052	NC_003361	TCTT	2	8	610716	610723	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13053	NC_003361	TTG	2	6	610759	610764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_003361	GCATG	2	10	610833	610842	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13055	NC_003361	CT	3	6	610858	610863	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13056	NC_003361	G	6	6	610871	610876	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_003361	TTTA	2	8	610944	610951	25 %	75 %	0 %	0 %	29840300
13058	NC_003361	GAT	2	6	610986	610991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29840300
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13063	NC_003361	GGTA	2	8	611450	611457	25 %	25 %	50 %	0 %	29840300
13064	NC_003361	GCA	2	6	611471	611476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29840300
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13089	NC_003361	T	8	8	612655	612662	0 %	100 %	0 %	0 %	29840301
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13101	NC_003361	A	8	8	613530	613537	100 %	0 %	0 %	0 %	29840302
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13104	NC_003361	CT	3	6	613614	613619	0 %	50 %	0 %	50 %	29840302
13105	NC_003361	TCT	2	6	613644	613649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840302
13106	NC_003361	A	6	6	613664	613669	100 %	0 %	0 %	0 %	29840302
13107	NC_003361	CT	3	6	613712	613717	0 %	50 %	0 %	50 %	29840302
13108	NC_003361	TCC	2	6	613718	613723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29840302
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13111	NC_003361	TAGC	2	8	613822	613829	25 %	25 %	25 %	25 %	29840302
13112	NC_003361	TGA	2	6	613877	613882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29840302
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13116	NC_003361	T	6	6	613957	613962	0 %	100 %	0 %	0 %	29840302
13117	NC_003361	TAAA	2	8	613993	614000	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13118	NC_003361	TTA	2	6	614106	614111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29840303
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13120	NC_003361	ATTC	2	8	614210	614217	25 %	50 %	0 %	25 %	29840303
13121	NC_003361	CTTC	2	8	614241	614248	0 %	50 %	0 %	50 %	29840303
13122	NC_003361	CAT	2	6	614249	614254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29840303
13123	NC_003361	ATC	2	6	614418	614423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29840303
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13250	NC_003361	CAA	2	6	621223	621228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29840307
13251	NC_003361	AAG	2	6	621235	621240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29840307
13252	NC_003361	CCA	2	6	621245	621250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29840307
13253	NC_003361	TTG	2	6	621269	621274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29840307
13254	NC_003361	AC	3	6	621439	621444	50 %	0 %	0 %	50 %	29840307
13255	NC_003361	TTCTTT	2	12	621535	621546	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	29840307
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13257	NC_003361	TAA	2	6	621608	621613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13258	NC_003361	A	6	6	621612	621617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13259	NC_003361	ATT	2	6	621620	621625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13260	NC_003361	ATTTT	2	10	621644	621653	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13261	NC_003361	AAT	2	6	621692	621697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29840308
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13265	NC_003361	CAA	2	6	621876	621881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29840308
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13273	NC_003361	CCA	2	6	622278	622283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29840308
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13280	NC_003361	A	9	9	622492	622500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13281	NC_003361	TTA	2	6	622526	622531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13282	NC_003361	CTG	2	6	622597	622602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13283	NC_003361	GATT	2	8	622649	622656	25 %	50 %	25 %	0 %	29840309
13284	NC_003361	GC	3	6	622671	622676	0 %	0 %	50 %	50 %	29840309
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13288	NC_003361	AGTT	2	8	622764	622771	25 %	50 %	25 %	0 %	29840309
13289	NC_003361	CAT	2	6	622990	622995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29840309
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13304	NC_003361	A	6	6	623796	623801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13305	NC_003361	GAG	2	6	623820	623825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13307	NC_003361	GA	3	6	623873	623878	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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13309	NC_003361	CAA	2	6	623924	623929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13312	NC_003361	CTT	2	6	624050	624055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13340	NC_003361	A	7	7	625214	625220	100 %	0 %	0 %	0 %	29840311
13341	NC_003361	TTA	2	6	625224	625229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29840311
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13344	NC_003361	AGA	2	6	625335	625340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13349	NC_003361	CAA	2	6	625602	625607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29840312
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13352	NC_003361	ATGA	2	8	625746	625753	50 %	25 %	25 %	0 %	29840312
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13355	NC_003361	TAT	2	6	625900	625905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29840313
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13360	NC_003361	A	6	6	626298	626303	100 %	0 %	0 %	0 %	29840313
13361	NC_003361	TGG	4	12	626335	626346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29840313
13362	NC_003361	AG	3	6	626366	626371	50 %	0 %	50 %	0 %	29840313
13363	NC_003361	GCG	2	6	626399	626404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29840313
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13366	NC_003361	ACTC	2	8	626590	626597	25 %	25 %	0 %	50 %	29840313
13367	NC_003361	AGATAA	2	12	626686	626697	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	29840313
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13370	NC_003361	GCTT	2	8	626812	626819	0 %	50 %	25 %	25 %	29840313
13371	NC_003361	TCC	2	6	626929	626934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29840313
13372	NC_003361	TGGA	2	8	626955	626962	25 %	25 %	50 %	0 %	29840313
13373	NC_003361	TCC	2	6	626986	626991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29840313
13374	NC_003361	CTA	2	6	627102	627107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29840313
13375	NC_003361	TCA	2	6	627144	627149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29840313
13376	NC_003361	ATC	2	6	627177	627182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29840313
13377	NC_003361	TC	4	8	627184	627191	0 %	50 %	0 %	50 %	29840313
13378	NC_003361	GTTT	2	8	627257	627264	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13379	NC_003361	T	6	6	627266	627271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13380	NC_003361	TAA	2	6	627285	627290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13381	NC_003361	TTTA	2	8	627359	627366	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13382	NC_003361	TAA	2	6	627418	627423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29840314
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13403	NC_003361	TCT	2	6	628785	628790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840314
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13406	NC_003361	GAC	2	6	629021	629026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13481	NC_003361	A	6	6	632217	632222	100 %	0 %	0 %	0 %	29840317
13482	NC_003361	ACTC	2	8	632249	632256	25 %	25 %	0 %	50 %	29840317
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13496	NC_003361	A	6	6	632708	632713	100 %	0 %	0 %	0 %	29840317
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